EST-SSRS

作品数:67被引量:604H指数:15
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相关作者:高丽锋李宏伟孙效文龙青姨黄华孙更多>>
相关机构:西北农林科技大学南京农业大学中国热带农业科学院上海海洋大学更多>>
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长江刀鲚脑转录组多态性EST-SSRs的规模化开发与利用
《大连海洋大学学报》2023年第2期196-205,共10页于爱清 施永海 徐嘉波 
上海市自然科学基金(19ZR1477900);上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2016)第6-2-2号);上海领军人才项目(沪人社专2021-67号)。
为加速长江刀鲚(Coilia nasus)分子标记辅助育种的研究进程,对养殖长江刀鲚雌、雄个体分别进行转录组测序,利用MISA软件挖掘长江刀鲚脑转录组Unigenes中的EST-SSRs,采用SSRMMD软件规模化开发多态性EST-SSRs,并对3个长江刀鲚养殖群体开...
关键词:长江刀鲚 转录组 微卫星 分子标记 
Generation and classification of transcriptomes in two Croomia species and molecular evolution of CYC/TB1 genes in Stemonaceae
《Plant Diversity》2018年第6期253-264,共12页Ruisen Lu Wuqin Xu Qixiang Lu Pan Li Jocelyn Losh Faiza Hina Enxiang Li Yingxiong Qiu 
supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant Nos. 31370241, 31570214);the International Cooperation and Exchange of the National Natural Science Foundation of China (Grant Nos. 31511140095, 31561143015);National Science Foundation of China (grant no. 30960027)
The genus Croomia(Stemonaceae) is an excellent model for studying the evolution of the Eastern Asia(EA)-Eastern North America(ENA) floristic disjunction and the genetic mechanisms of floral zygomorphy formation. In ad...
关键词:Croomia TRANSCRIPTOME SCNGs EST-SSRS FLOWER SYMMETRY CYC/TB1 
虾夷扇贝EST-SSR标记在栉孔扇贝中的通用性研究被引量:9
《渔业科学进展》2018年第4期139-146,共8页张广明 孙秀俊 吴彪 杨爱国 刘志鸿 周丽青 刘寒苗 赵庆 
国家自然科学基金(31602153);青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室开放基金(2016LMFS-B02);海水养殖教育部重点实验室开放基金(KLM2018004);山东省自然科学基金(ZR2016CQ32)共同资助~~
为研究虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)和栉孔扇贝(Chlamys farreri)的群体遗传多样性并分析其亲缘关系,对在虾夷扇贝中开发的60个EST-SSR位点在栉孔扇贝中的通用性进行了研究。结果显示,21个位点可在栉孔扇贝中扩增出特异性条带,通...
关键词:虾夷扇贝 栉孔扇贝 EST-SSRS 微卫星 多态性 通用性 
Development of a panel of unigene-derived polymorphic EST–SSR markers in lentil using public database information被引量:2
《The Crop Journal》2016年第5期425-433,共9页Debjyoti Sen Gupta Peng Cheng Gaurav Sablok Dil Thavarajah Pushparajah Thavarajah Clarice J.Coyne Shiv Kumar Michael Baum Rebecca J.McGee 
Financial assistance from ICARDA, Morocco, in the form of a brief project;grant support from the Northern Pulse Growers Association and the USA Dry Pea and Lentil Council are gratefully acknowledged
Lentil(Lens culinaris Medik.), a diploid(2n = 14) with a genome size greater than 4000 Mbp, is an important cool season food legume grown worldwide. The availability of genomic resources is limited in this crop specie...
关键词:Lens culinaris EST-SSRS Functional annotation Unigene sequences EST database Genetic resources 
Analysis of EST-SSRs in silver birch(Betula pendula Roth.)
《Journal of Forestry Research》2016年第3期639-646,共8页Ertugrul Filiz Ilhan Dogan Ibrahim Ilker Ozyigit 
Simple sequence repeats(SSRs) defined as sequence repeat units between 1 and 6 bp occur abundantly in both coding and non-coding regions in eukaryotic genomes and these repeats can affect gene expression. In this st...
关键词:Silver birch (Betula pendula) Betulaceae -EST-SSR SSR mining In silico analysis 
濒危药用植物新疆阿魏cDNA文库构建与微卫星标记
《世界科学技术-中医药现代化》2016年第2期209-213,共5页王果平 樊丛照 罗红梅 季爱加 宋骏 李晓瑾 
新疆维吾尔自治区科技厅优秀青年科技创新人才培养项目(2013721042):基于高通量测序技术的濒危药用植物新疆阿魏开花调控基因的挖掘;负责人:王果平
目的:测试和分析新疆阿魏转录组,挖掘基因表达谱多态性标记(EST—SSRs),为新疆阿魏属植物遗传多样性、生物学特性、功能基因鉴定和濒危机制的研究奠定基础。方法:提取新疆阿魏茎叶总RNA,反转录合成cDNA,应用454 GS FLX Titanium进行测序...
关键词:新疆阿魏 EST-SSRS 高通量测序 分子标记 
大白菜与结球甘蓝多态性EST-SSRs标记筛选及其EST序列分析被引量:2
《农业生物技术学报》2015年第8期1040-1048,共9页石丽娟 许愿超 秦艳梅 顾爱侠 赵建军 申书兴 王彦华 王玉海 
国家自然科学基金(No.31101552;No.31171964;No.31171976);"十二五"农村领域国家科技计划课题(No.2012AA100202-5);高等学校博士学科点专项科研基金(No.20101302120006);河北省自然科学基金项目(No.C2014204093;No.C2013204118);河北省高等学校科学技术研究项目(No.Z2010149)
为了实现大白菜遗传背景下结球甘蓝染色体、染色体片段的准确鉴定,探索结球甘蓝遗传物质的添加对大白菜的影响,本研究以不同类型大白菜(Brassica rapa,AA)和结球甘蓝(Brassica oleracea,CC)为材料,对来自结球甘蓝的797个表达序列标签简...
关键词:大白菜 结球甘蓝 EST-SSRS 多态性标记 GO注释 KEGG分析 
基于高通量测序技术的虎杖EST-SSRs和EST-SNPs的开发及特征分析被引量:5
《中药材》2015年第6期1164-1167,共4页欧阳蒲月 刘芬 夏黎 胡伟明 
广州市科技局应用基础研究项目(2013J4100076);广东食品药品职业学院院级课题(2013YZ004)
目的:利用生物信息学方法,从虎杖转录组中开发SSRs、SNPs和In Dels标记。方法:从NCBI的SRA数据库下载虎杖RNA-Seq数据,经Trinity拼接后得到unigenes。用MISA软件搜索虎杖unigenes,对得到的SSRs位点信息进行特征分析并利用PRIMER 3软件设...
关键词:虎杖 转录组 简单重复序列 单核苷酸多态性 
<i>In</i><i>Silico</i>Mining of EST-SSRs in Jatropha curcas L. towards Assessing Genetic Polymorphism and Marker Development for Selection of High Oil Yielding Clones被引量:2
《American Journal of Plant Sciences》2014年第11期1521-1541,共21页Neeraj Jain Ganesh B. Patil Poonam Bhargava Rajani S. Nadgauda 
In recent years, Jatropha curcas L. has gained popularity as a potential biodiesel plant. The varying oil content, reported between accessions belonging to different agroclimatic zones, has necessitated the assessment...
关键词:BIO-DIESEL JATROPHA curcas L. EST SSR MAS Diversity Marker MINING Polymorphism In Silico 
《遗传》多篇文章获奖
《遗传》2013年第10期1216-1216,共1页
2013年9月27日,中国科学技术信息研究所在北京国际会议中心举行的“2013中国科技论文统计结果发布会”上,《遗传》2008年第1期发表的“野生狗牙根种质多样性的SRAP研究”被评为“中国百篇最具影响优秀国内学术论文(2012)”;《遗传...
关键词:《遗传》 中国科学技术信息研究所 北京国际会议中心 EST-SSRS 聚丙烯酰胺凝胶 SSR标记 中国科技 高胆固醇血症 
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