蛋白质结构预测

作品数：225被引量：488H指数：9
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基于多层量子粒子群优化算法和Toy模型的蛋白质结构预测研究
《计算机与应用化学》2010年第11期1574-1578,共5页李成渊 丁颜蕊 须文波 
江南大学青年创新团队(JNIRT0702))
蛋白质结构预测,作为计算生物学基本问题之一,是个典型的NP难解问题。研究表明合理运用算法,借助物理模型,可用于预测蛋白质结构。Toy模型就是较为简单的一类,其势能最低状态的确定则为结构预测的关键所在。量子粒子群算法是典型的智能...
关键词：量子粒子群算法 Toy模型 蛋白质结构预测 
势能曲面变平法的改进及其在三维非格点模型中的应用
《计算机与应用化学》2007年第10期1337-1340,共4页刘景发 黄文奇 
国家自然科学基金项目(10471051);国家高技术研究发展计划973项目(2004CB318000)
根据蛋白质的氨基酸序列预测其空间结构可以归纳为一个多极值的全局优化问题,缺少一种有效的全局寻优方法是阻碍这一难题解决的一个关键。势能曲面变平(ELP)法是一种启发式的全局优化算法,是一种推广的蒙特卡罗(MC)法,已被成功地应用于...
关键词：蛋白质结构预测 非格点模型 蒙特卡罗方法 ELP方法 
进化策略的一种改进及其在蛋白质结构预测中的应用被引量：2
《计算机与应用化学》2005年第12期1097-1100,共4页张红娟 李斌 唐焕文 郭崇慧 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
进化策略算法是一种模拟自然界生物进化过程的全局优化方法。本文将一种改进的进化策略算法应用于蛋白质三维 HPNX非格模型,较成功地预测了蛋白质序列1RPB、1BPI和1UBQ的折叠趋势,说明了三维HPNX非格模型比简化HP非格模型更能准确地描...
关键词：进化策略 HPNX非格模型 蛋白质折叠 
一种禁忌搜索算法在二维HP非格模型中的应用被引量：3
《计算机与应用化学》2005年第12期1101-1105,共5页岳晓晖 唐焕文 郭崇慧 
国家自然科学基金资助项目(90103033)
禁忌搜索算法是一种启发式的全局优化算法,是局部搜索算法的一种推广,已被成功地应用于许多组合优化问题,本文探讨将一种记忆的禁忌搜索算法应用于求解蛋白质结构预测问题。文中首先介绍了一种二维HP非格模型,此模型最后可以归结为一个...
关键词：蛋白质结构预测 二维HP非格模型 禁忌搜索算法 
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