蛋白质数据库

作品数：45被引量：184H指数：6
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一种基于图论的计算蛋白质数据库代表序列的算法
《计算机与应用化学》2008年第5期607-610,共4页刘鹏飞 曾振柄 蔡煜东 
许多生物序列数据库中都含有大量的冗余序列,这些冗余序列通常不利于对数据库的统计分析和处理,而且它们要占用更多的计算机存储和处理资源。针对这个问题,本文中我们设计了一种去除蛋白质冗余序列的算法。该算法基于图论最大独立集的...
关键词：生物信息学 最大独立集 代表序列 去冗余 
蛋白质数据库中匹配间隙序列标签的自动机算法
《计算机与应用化学》2005年第10期845-850,共6页张涛 
国家863计划重大专项资助项目(2002AA103061)国家自然科学基金资助项目(10171099)
对于肽和蛋白质的分析鉴别,串联质谱(MS/MS)是极其重要的方法。解释MS/MS数据的一种方法是de novo序列,它正变得越来越准确和重要了。但de novo序列通常只能准确地判定序列的一部分,而对于不确定的部分只能通过“质量间隙”来表示,我们...
关键词：串联质谱(MS/MS) AHO-CORASICK算法 质量间隙序列标签 
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