任文科

作品数：3被引量：8H指数：3
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供职机构：北京工业大学更多>>
发文主题：类蛋白蛋白质折叠折叠类型蛋白质结构域更多>>
发文领域：生物学更多>>
发文期刊：《生物化学与生物物理进展》《生物物理学报》《中国生物化学与分子生物学报》更多>>
所获基金：北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
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构建基于折叠核心的全α类蛋白取代矩阵被引量：3
《中国生物化学与分子生物学报》2008年第8期761-766,共6页刘晓辉 李晓琴 徐海松 任文科 
国家自然科学基金(No.30570427);北京市自然科学基金(No.4063035)资助项目~~
氨基酸残基取代矩阵是影响多序列比对效果的重要因素,现有的取代矩阵对低相似序列的比对性能较低.在已有的BLOSUM取代矩阵算法基础上,定义了基于蛋白质折叠核心结构的序列-结构数据块;提出一种新的基于全α类蛋白质折叠核心结构的氨基...
关键词：蛋白质结构 折叠核心结构 低相似性 多序列比对 取代矩阵 
Globin-like蛋白质折叠类型识别被引量：8
《生物化学与生物物理进展》2008年第5期548-554,共7页任文科 徐海松 李晓琴 
国家自然科学基金资助项目(30570427);北京市自然科学基金资助项目(4063035)~~
蛋白质折叠类型识别是蛋白质结构研究的重要内容.以SCOP中的Globin-like折叠为研究对象,选择其中序列同一性小于25%的17个代表性蛋白质为训练集,采用机器和人工结合的办法进行结构比对,产生序列排比,经过训练得到了适合Globin-like折叠...
关键词：蛋白质 折叠类型识别 Globin-like 隐马尔科夫模型 结构比对 
蛋白质折叠类型识别方法研究被引量：5
《生物物理学报》2008年第1期65-71,共7页张玮 李晓琴 徐海松 任文科 
国家自然科学基金项目(30570427);北京市自然科学基金项目(4063035)~~
蛋白质折叠类型识别是一种分析蛋白质结构的重要方法。以序列相似性低于25%的822个全β类蛋白为研究对象,提取核心结构二级结构片段及片段间氢键作用信息为折叠类型特征参数,构建全β类蛋白74种折叠类型模板数据库。定义查询蛋白与折叠...
关键词：折叠类型识别 结构域 全β类蛋白 
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