陈白尘

作品数:5被引量:7H指数:2
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供职机构:东北大学信息科学与工程学院更多>>
发文主题:DNA序列过滤器索引结构LPR轻量级更多>>
发文领域:自动化与计算机技术更多>>
发文期刊:《小型微型计算机系统》《东北大学学报(自然科学版)》《计算机研究与发展》《华中科技大学学报(自然科学版)》更多>>
所获基金:国家自然科学基金高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划更多>>
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DNA序列中基于后继数组索引的SATR查找算法被引量:2
《东北大学学报(自然科学版)》2007年第2期184-188,共5页王镝 赵毅 陈白尘 王国仁 
国家自然科学基金资助项目(6027307960473074)
研究了基因序列分析中的DNA序列相似性重复片段的查找问题.在对重复片段的相似性衡量进行分析之后,基于海明距离提出了新的相似度衡量标准模式相似度和片段相似度,并在此基础上提出了一个新的相似性重复片段的定义SATR(segment-similari...
关键词:DNA序列 相似性重复片段 片段相似度 SATR 后继数组 
音乐数字序列中主题重复片段的查找
《计算机研究与发展》2006年第z3期184-188,共5页陈白尘 王镝 王国仁 赵毅 于长永 徐莹颖 
国家自然科学基金项目(60273079,60573089)
随着将音乐作品转化为数字数据技术的不断涌现,基于音乐作品内容的查询已经成为未来音乐数据查询的一个重要方向,音乐作品中有意义的重复片段查询是其中一个重要部分.定义音乐数据中有意义的重复片段和给出有效的查找算法是亟待解决的...
关键词:音乐数字序列 主题重复片段  γ)相似 过滤器 
DNA序列中基于后继数组索引的LPR查找算法被引量:4
《计算机研究与发展》2006年第z3期195-199,共5页王镝 王国仁 吴青泉 陈白尘 赵毅 毛克明 
国家自然科学基金项目(60273079,60573089)
DNA序列中的重复片段在人类基因研究中有着非常重要的生物意义,因此,查找给定DNA序列中的重复片段是生物序列分析领域中的一个重要课题.基于重复片段的模式提出了新的重复片段定义LPR(largest pattern repetition)和模式单元的概念.对...
关键词:DNA序列 重复片段 LPR 模式单元 后继数组 
CMRS:聚类的多解析度字符串索引结构
《小型微型计算机系统》2006年第3期497-502,共6页郑若石 王镝 徐恒宇 王国仁 陈白尘 
国家自然科学基金项目(60273079)资助;教育部高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划基金资助项目.
随着基因测序技术和人类基因组计划的发展,从大量的生物数据中寻找相似的序列就越来越成为当前研究的热点问题.本文提出了一种聚类的多解析度字符串索引结构,用于解决生物序列的相似性查询问题.首先,以较小容量的MBR(最小绑定矩形)构造...
关键词:序列相似性查询 范围查 K近邻查询 生物信息学 
一种可用于生物序列分析的轻量级索引结构被引量:1
《华中科技大学学报(自然科学版)》2005年第z1期209-212,225,共5页王镝 王国仁 陈白尘 吴青泉 王斌 韩冬红 
国家自然科学基金资助项目(6027379;60273074)
针对目前可用于重复片断查询的索引结构所需空间过大的问题,通过对序列中重复片断的分析提出一种轻量级数据结构———后继数组,它是基于基数排序方法建立的.后继数组也适用于多序列分析.理论分析表明了后继数组及多序列后继数组在存储...
关键词:DNA序列 重复片段 后继数组 
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