郑若石

作品数：3被引量：8H指数：1
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供职机构：东北大学信息科学与工程学院更多>>
发文主题：生物信息学查询处理技术范围查询TANDEMREPEAT更多>>
发文领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
发文期刊：《小型微型计算机系统》《软件学报》《计算机科学》更多>>
所获基金：国家自然科学基金高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划更多>>
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CMRS:聚类的多解析度字符串索引结构
《小型微型计算机系统》2006年第3期497-502,共6页郑若石 王镝 徐恒宇 王国仁 陈白尘 
国家自然科学基金项目(60273079)资助;教育部高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划基金资助项目.
随着基因测序技术和人类基因组计划的发展,从大量的生物数据中寻找相似的序列就越来越成为当前研究的热点问题.本文提出了一种聚类的多解析度字符串索引结构,用于解决生物序列的相似性查询问题.首先,以较小容量的MBR(最小绑定矩形)构造...
关键词：序列相似性查询 范围查 K近邻查询 生物信息学 
基于二分频率变换的序列相似性查询处理技术被引量：8
《软件学报》2006年第2期232-241,共10页王国仁 葛健 徐恒宇 郑若石 
国家自然科学基金~~
作为基因功能预测的主要手段,序列相似性查询技术是生物信息学领域的研究热点.基因序列和结构的相似性往往决定了基因功能的相似性,因此可以通过基因序列的相似性查找来预测新基因的功能.分析了MRS索引中频率变化和小波变换等相关技术,...
关键词：序列相似性查询 范围查询 编辑距离 生物信息学 
Tandem repeat查找方法比较
《计算机科学》2005年第10期172-175,192,共5页徐恒宇 王镝 王国仁 郑若石 
教育部高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划基金;国家自然科学基金(60273079)
Tandemrepeat在基因组成和进化中起到非常重要的作用,查找和分析Tandemrepeat已经成为当前生物信息学的一个前沿领域和研究焦点。目前在这一研究领域存在多类解决方法,主要有基于LZ分解技术的方法和最近兴起的基于后缀树索引的方法。本...
关键词：TANDEM REPEAT LZ分解 后缀树 生物信息学 时间复杂度 基因组成 分解技术 数量级 后缀树 
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