孔栋

作品数：4被引量：14H指数：2
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供职机构：西北农林科技大学生命科学学院更多>>
发文主题：MICRORNAMIRNANORTHERN印迹水稻支持向量机更多>>
发文领域：生物学农业科学更多>>
发文期刊：《生物物理学报》《中国生物化学与分子生物学报》《西北农林科技大学学报（自然科学版）》《生物技术通报》更多>>
所获基金：国家转基因植物研究与产业化专项国家自然科学基金更多>>
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拟南芥基因组中新的microRNA预测及分析被引量：2
《生物物理学报》2007年第5期389-396,共8页金伟波 孔栋 应晓敏 郭蔼光 李伍举 
国家自然科学基金项目(30470411;30500105)~~
MicroRNA(miRNA)是一类存在于动植物体内、长度为21￣25nt的内源性小RNA,对生物体的转录后基因调控起着关键作用,但一些低丰度的miRNA和组织特异性miRNA往往很难发现。为了系统识别拟南芥基因组中新的非同源miRNA,首先基于已报道的拟南...
关键词：拟南芥 基因组 MICRORNA 预测 
水稻MicroRNA的预测及实验验证被引量：7
《中国生物化学与分子生物学报》2007年第9期743-750,共8页金伟波 李楠楠 吴方丽 孔栋 郭蔼光 
国家转基因植物研究与产业化开发专项(No.JY03A-11-01)~~
根据已报道水稻pre-miRNA的序列与结构信息,利用支持向量机(support vector machine,SVM)方法在miRNA前体上预测成熟区,产生一个模型——mature-SVM.它预测水稻成熟区的敏感性和特异性分别为86.7%和100%;然后,用这个模型对从水稻基因组...
关键词：水稻 MIRNA 支持向量机 NORTHERN印迹 
串叶松香草高效再生体系的建立与兔出血症病毒YL株外壳蛋白基因VP60对其遗传转化被引量：6
《生物技术通报》2007年第5期173-178,共6页李传山 张婷婷 宋书峰 李维英 孔栋 郭蔼光 
通过对串叶松香草(Silphium perfoliatumL.)不同激素浓度配比的诱导分化实验,建立了串叶松香草离体培养高效再生体系,结果表明MS+6-BA(2.0mg/L)+NAA0.1(mg/L)培养基可高效诱导愈伤组织和芽的分化,1/2MS+IBA(0.1mg/L)培养基可快速诱导根...
关键词：串叶松香草 组织培养 VP60基因 根癌农杆菌 遗传转化 
计算识别水稻基因组中microRNA基因
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》2006年第12期97-100,共4页金伟波 吴方丽 孔栋 郭蔼光 杨淑慎 
国家转基因研究与产业化开发专项(JY03A-11-01);陕西省农业分子生物学重点实验室项目
一些低丰度的m iRNA和组织特异性m iRNA往往很难发现,利用生物信息学方法,根据已知水稻m iRNA的各种属性,设计m iRNA前体预测程序——P reM iRF ind,从全基因组范围中预测出1 375条m iRNA前体,然后利用已知拟南芥的m iRNA对这1 375条前...
关键词：水稻基因组 RNAfold MICRORNA 
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