张纪刚

作品数:8被引量:7H指数:1
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供职机构:中国农业大学动物科技学院更多>>
发文主题:QTL定位家畜最大似然法CDNA芯片CDNA微阵列更多>>
发文领域:农业科学生物学理学更多>>
发文期刊:《畜牧兽医学报》《农业生物技术学报》《中国畜牧杂志》《Journal of Genetics and Genomics》更多>>
所获基金:国家重点基础研究发展计划安徽省教育厅项目国家高技术研究发展计划安徽省自然科学基金更多>>
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检测cDNA芯片中差异表达基因的非转换方法
《中国畜牧杂志》2006年第13期2-5,共4页张纪刚 殷宗俊 张勤 
国家重点基础研究发展规划(973)(G2000016103);国家高技术研究与发展计划(863)(2001AA243011);国家杰出青年基金(30025003)
cDNA芯片已经成为生物学试验中一种重要试验手段,与其相应的检测差异表达基因的统计方法也在快速地完善。目前通用的方法是将数据进行对数比转换,并相应进行标准化处理。鉴于对数转换的缺点,本研究提出一种非转换方法,即背景校正后直接...
关键词:畜牧、兽医科学基础学科 CDNA芯片 对数转换 非转换方法 标准化 
利用Bayesian-MCMC方法进行畜禽复杂离散性状QTL定位被引量:2
《中国科学(C辑)》2006年第3期240-246,共7页刘剑锋 张沅 张勤 王立贤 张纪刚 
国家自然科学基金重点资助项目(批准号:30430500)
复杂离散性状由于表型数据呈离散分布并且提供信息量过小,因此很难用常规的统计方法对此类性状的QTL进行定位研究.Bayesian-MCMC方法是复杂离散性状QTL定位的重要手段,该方法通过所有先验信息来推导QTL参数的后验分布并利用Markov Chai...
关键词:复杂离散性状 QTL定位 Bayesian-MCMC方法 远交群体 IBD方差组分随机模型 
家畜遗传抗性多基因效应预测的广义线性方法被引量:1
《畜牧兽医学报》2006年第4期313-316,共4页殷宗俊 张勤 张纪刚 刘剑锋 
国家重点基础研究发展规划(G2000016103);安徽省自然科学基金(050410204);安徽省教育厅项目(2002jq126;2004kj151)
在广义线性混合模型(GLMM)的框架内模拟研究了抗性性状的遗传分析方法,初步比较了GLMM方法与一般线性方法(LM)的育种值估计效果。模拟研究的抗性表型为单阈值和3阈值2种类型,选用的连接函数分别为logist连接和log连接,试验设计为全同胞...
关键词:广义线性混合模型(GLMM) 遗传抗性 估计育种值(EBV) 
cDNA微阵列的标准化方法研究被引量:1
《农业生物技术学报》2006年第3期356-359,共4页张纪刚 张勤 殷宗俊 
国家重点基础研究发展规划(973)(No.G2000016103);国家高技术研究与发展计划(863)(No:2001AA243011)资助。
针对目前通用的cDNA微阵列数据的标准化处理方法(常称为对数比转换法)中存在的缺陷,提出了一种新的cDNA微阵列数据标准化方法-非转换法。该方法利用Huber等(2003)提出的芯片数据分析模型,在对芯片背景进行校正后,根据最小二乘估计原理,...
关键词:CDNA微阵列 标准化方法 差异表达基因 最小二乘估计 数据标准化 转换法 标准化处理 计算机模拟 转化法 估计值 
cDNA芯片差异表达基因检测的非转换方法(英文)
《Acta Genetica Sinica》2006年第1期80-88,共9页张纪刚 殷宗俊 张勤 
This Work Was Supported by the National Key Basic Research Program of China (No.G2000016103).
cDNA微阵列数据中包含许多变异因素,用于检测差异表达基因和其它统计分析前,必须将这些“噪音”剔除。对 数比法(背景校正、对数比转换和数据标准化)已经被广泛应用于cDNA微阵列数据分析中,然而这种方法却存在着一些 亟待解决的缺陷。对...
关键词:CDNA芯片 差异表达基因 对数比转换 非转换方法 标准化 
利用广义线性方法定位家畜抗性等级性状的QTL被引量:2
《畜牧兽医学报》2005年第12期1241-1246,共6页殷宗俊 张勤 张纪刚 丁向东 
国家重点基础研究发展规划(G2000016103);国家杰出青年科学基金(30025003);安徽省教育厅基金(2002jq126;2004kj151);安徽省自然基金(050410204)
在广义线性模型的框架内模拟研究了家畜抗性等级性状的QTL定位方法,QTL参数的估计采用最大似然方法,比较了阈模型方法与一般线性方法的QTL定位效率,并对影响等级性状QTL定位效率的主要因素(QTL效应、性状的遗传力)进行了模拟研究。试验...
关键词:抗性等级性状 阈模型 线性模型 QTL定位 最大似然法 
家畜抗性等级性状的QTL定位方法(英文)被引量:1
《Acta Genetica Sinica》2005年第11期1147-1155,共9页殷宗俊 张勤 张纪刚 丁向东 
国家重点基础研究发展规划(编号:G2000016103);国家高技术研究发展计划(编号:2001AA243011);安徽省教育厅项目(编号:2002jq126,2004kj151)~~
在广义线性模型的框架内模拟研究了家畜抗性等级性状的QTL定位方法,QTL参数的估计采用最大似然方法,比较了阈模型方法与一般线性方法的QTL定位效率,并对影响等级性状QTL定位效率的主要因素(QTL效应、性状的遗传力)进行了模拟研究,实验...
关键词:抗性等级性状 阈模型 线性模型 QTL定位 最大似然法 
离散性状QTL区间定位的最大似然方法被引量:1
《Acta Genetica Sinica》2005年第9期923-929,共7页殷宗俊 张勤 陈宏权 张纪刚 丁向东 王春考 
国家重点基础研究发展规划(编号:G2000016103);安徽省教育厅项目(编号:2002jq126;2004kj151)~~
采用最大似然区间定位法对阈模型与一般线性模型的QTL定位效率进行了比较,并对影响离散性状QTL检测效率的主要因素(QTL效应、性状的遗传力和表型发生率)进行了模拟研究,实验设计为多个家系的女儿设计,资源群体大小为500头。研究结果表明...
关键词:离散性状 阈模型 QTL定位 最大似然法 
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