沈丹

作品数：14被引量：23H指数：3
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供职机构：扬州大学动物科学与技术学院更多>>
发文主题：转座子斑马鱼SB转基因PB更多>>
发文领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《中国家禽》《遗传》《农业生物技术学报》《生物工程学报》更多>>
所获基金：国家自然科学基金江苏省产学研联合创新资金项目中国博士后科学基金国家科技重大专项更多>>
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Tol2转座子介导斑马鱼rps26基因附近增强子捕获及注解分析
《生物工程学报》2018年第3期449-458,共10页桑亚通 沈丹 陈伟 产舒恒 顾浩 高波 宋成义 
国家自然科学基金(Nos.31671313;31572364)资助~~
随着人类等生物大规模基因组测序工作的完成,认识和理解基因组上表达调控元件成为后基因组时代的重要研究任务,增强子捕获技术是一种鉴定基因组上增强子元件及其对基因表达调控机制的有效方法。本研究选择Tol2转座子系统介导制备的稳定...
关键词：增强子捕获 注解 Tol2 斑马鱼 
9种硬骨鱼类转座组注释
《生物工程学报》2018年第1期122-131,共10页高波 沈丹 陈才 王赛赛 杨昆仑 陈伟 王伟 张丽 宋成义 
国家自然科学基金(Nos.31671313;31572364);江苏省高等教育优势学科;扬州市现代农业项目(No.YZ2016040)资助~~
通过生物信息学手段对9种硬骨鱼转座组进行注释。结果表明9种硬骨鱼类转座组大小和构成差异显著,其转座组含量从高到低分别为斑马鱼、矛尾鱼、青鳉鱼、罗非鱼、花斑剑尾鱼、大西洋鳕鱼、三刺鱼、金娃娃和红鳍东方鲀,转座子含量和基因组...
关键词：硬骨鱼 转座子 注释 
斑马鱼转座子时空表达特性被引量：2
《生物信息学》2017年第4期201-206,共6页高波 王伟 钱跃 陈才 钟继汉 沈丹 陈伟 宋成义 
国家自然科学基金(31671313;31572364);扬州市现代农业项目(YZ2016040)
转座子是基因组中可移动和扩展的元件,能够插入新的位点,影响基因组和基因的结构和功能,是基因组进化的内在驱动。为探讨转座子的时空表达特性,首先通过生物信息学方法鉴定出斑马鱼9个疑似活性转座子,包括DNA转座子Tc1家族(Tc-a、Tc-b、...
关键词：转座子 Tc1家族 ERV家族 LINE家族 时空表达 斑马鱼 
环境污染物对斑马鱼早期胚胎转座子转录活性的影响被引量：1
《水产学报》2017年第11期1660-1666,共7页高波 陈才 张丽 沈丹 王赛赛 陈伟 王伟 产舒恒 宋成义 
国家自然科学基金(31671313);江苏省优势学科专项~~
转座子在生物基因组中占据重要的组成部分,是基因组中可移动和扩展的重要元件,其转座活性受外界环境因子调控。为了探讨环境应激对基因组转座子表达活性的影响,用环境污染物二噁英(TCDD)和重金属Cu^(2+)或Cd^(2+)处理斑马鱼早期胚胎,通...
关键词：斑马鱼 转座子 污染物 转录活性 
核定位信号肽和转运肽对斑马鱼转基因效率的影响
《河南农业科学》2017年第6期142-146,共5页钟继汉 沈丹 陈才 高波 宋成义 
国家自然科学基金项目(31671313;31572364)
为了探讨核定位信号肽S413-PV和转运肽Tp10这2种融合肽对转基因效率的影响,将S413-PV和Tp10与线性化质粒分别以质量比50∶1、100∶1、200∶1混合制成转染液,注射斑马鱼单细胞期胚胎,分别检测转染24 h、120 h后胚胎的阳性率和成活率。结...
关键词：核定位信号肽 转运肽 基因转移 斑马鱼 
SB转座子介导的斑马鱼增强子捕获注解分析被引量：1
《生物技术通报》2017年第5期153-158,共6页刘帅军 沈丹 钟继汉 陈伟 王伟 张丽 陈才 杨昆仑 高波 宋成义 
国家自然科学基金项目(31671313;31572364);扬州现代农业项目(YZ2016040)
为了建立斑马鱼增强子捕获突变体库及研究功能基因的表达调控模式,制备了SB转座子介导的增强子捕获转基因斑马鱼(F0),通过繁育建立了组织或器官特异表达报告基因绿色荧光蛋白(Green fluorescent protein,GFP)的品系(F1)。选择F1代的SK-3...
关键词：增强子捕获 注解 SB 斑马鱼 
Tc1/Mariner转座子超家族的研究进展被引量：3
《遗传》2017年第1期1-13,共13页沈丹 陈才 王赛赛 陈伟 高波 宋成义 
国家自然科学基金项目(编号:31671313,31572364);扬州现代农业项目(编号:YZ2016040)资助~~
随着高通量测序技术的迅猛发展,越来越多的生物基因组注释结果表明:转座子几乎存在于所有生物的基因组中,是大多数生物基因组的重要组分。其中,Tc1/Mariner转座子是自然界中分布最广泛的一类DNA转座子超家族,在自然界已经发现14个有活性...
关键词：Tc1/Mariner转座子 转基因 基因治疗 基因捕获 
BMPMP3、BMPBMP10、BMPBMP15基因在雏鸡和成年鸡主要器官中的表达特性研究被引量：4
《中国家禽》2016年第4期5-9,共5页王赛赛 王亚丽 沈丹 薛松磊 钱跃 史云强 陈才 钟继汉 刘帅军 高波 
骨形态发生蛋白(BMP)是转化生长因子超家族中的重要成员,其信号通路控制着诸如中胚层形成、神经系统分化、牙齿和骨骼发育以及癌症发生等许多重要的生物学过程。研究旨在分析BMP家族中的BMP3、BMP10、BMP15在雏鸡和成年鸡主要器官中表...
关键词：鸡 BMP基因 表达特性 
转座子介导细胞质显微注射技术的基因转移效率比较被引量：1
《农业生物技术学报》2016年第1期151-156,共6页薛松磊 史云强 陈才 沈丹 李庆平 宋成义 崔恒宓 高波 
国家转基因重大专项重点课题子课题(No.2014ZX08006005-008);江苏省产学研联合创新资金-前瞻性联合研究项目(No.BY2013063-03);中国博士后科学基金(No.20100480371);江苏省普通高校学术学位研究生科研创新计划项目(No.KYLX_1357)
为了比较和探索SB(sleeping beauty)、PB(piggy Bac)和Tol2 3种转座子介导下的细胞质显微注射法在小鼠(Mus musculus)和斑马鱼(Danio rerio)上的转基因效率,本研究将包含3种转座子的重组载体p T3-PST-CAG-GFP分别与3种转座酶表达载体以1...
关键词：小鼠 斑马鱼 转座子 细胞质显微注射 
体外获能和顶体反应对猪精子黏附蛋白基因和精子运动抑制因子(SPMI)mRNA表达的影响被引量：3
《农业生物技术学报》2015年第7期923-929,共7页高波 钱跃 沈丹 史云强 王赛赛 薛松磊 陈才 宋成义 
国家自然科学基金项目(No.31200920和No.31272406)
为了探讨精子黏附蛋白基因Spermadhesins(AQN1、AQN3、AWN、PSPⅠ和PSPⅡ)和精子运动抑制因子(seminal plasma motility inhibitor,SPMI)在成熟精子中m RNA表达水平与精子获能和顶体反应之间的关系,本研究采用体外诱导法使猪(Sus scrofa...
关键词：猪 精子获能 顶体反应 精子黏附蛋白基因 精子运动抑制因子(SPMI) 
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