闫学兵

作品数：3被引量：29H指数：3
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供职机构：福建农林大学作物科学学院农业部甘蔗生理生态与遗传改良重点实验室更多>>
发文主题：甘蔗表达序列标签简单重复序列电子克隆生物信息学分析更多>>
发文领域：生物学农业科学更多>>
发文期刊：《生物技术通讯》《热带作物学报》《生物信息学》更多>>
所获基金：引进国际先进农业科技计划国家现代农业产业技术体系建设项目国家高技术研究发展计划更多>>
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甘蔗MYB2转录因子的电子克隆和生物信息学分析被引量：20
《生物信息学》2011年第1期24-27,共4页李国印 阙友雄 许莉萍 郭晋隆 闫学兵 陈如凯 
国家948项目(2010-C21)
用电子克隆方法获得甘蔗MYB2基因,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:甘蔗MYB2基因全长991bp,包含570bp的ORF,编...
关键词：甘蔗 MYB2基因 电子克隆 生物信息学 
基于表达序列标签的简单重复序列标记开发策略被引量：4
《生物技术通讯》2011年第1期118-121,共4页闫学兵 阙友雄 许莉萍 李国印 
国家高技术研究发展计划(2007AA100701);农业部"948"计划(006-G37;2010-S19);福建省科技厅国家科技项目备案(F2007AA100701);现代农业产业技术体系建设专项
作为一种新型分子标记,表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)来自表达基因,因此除具备来源于传统基因组的SSR标记的所有优势外,还与基因功能表达具有直接或间接的关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用。我们简要介绍了EST-SSR标记...
关键词：表达序列标签 简单重复序列 标记开发 策略 
甘蔗EST序列的SSR信息分析被引量：5
《热带作物学报》2010年第9期1497-1501,共5页闫学兵 阙友雄 许莉萍 郭晋隆 陈如凯 潘永保 
现代农业产业技术体系建设专项资金(No.nycytx-024);国家948项目(2010-C21)资助
从NCBI公共数据库获得262 113条甘蔗EST,通过前处理和聚类拼接得到全长为50 058.89 kb的无冗余Unigene 62 565条。在这些序列中搜索出9 482个SSRs,出现频率是15.15%;平均5.28 kb出现1个SSR。三核苷酸重复是主要的类型,占总SSRs的45.92%...
关键词：甘蔗 表达序列标签 简单重复序列 特性 
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