谭丽

作品数:3被引量:3H指数:1
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供职机构:华南理工大学更多>>
发文主题:DNA序列金属有机骨架材料MEMETIC算法码书索引更多>>
发文领域:自动化与计算机技术经济管理化学工程电子电信更多>>
发文期刊:《华南理工大学学报(自然科学版)》《电子学报》《电子与信息学报》更多>>
所获基金:国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
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基于码书索引变换的高通量DNA序列数据压缩算法被引量:1
《电子学报》2015年第5期1007-1013,共7页谭丽 孙季丰 
国家自然科学基金青年科学基金(No.61202292);广东省自然科学基金(No.9151064101000037)
提出一种高通量DNA序列数据的压缩算法.该算法先采用码书索引变换模型,将传统码书索引值的表示方法变换成由四个标准碱基字符替代的四进制数值方式,并采用一种界定替换串与非替换串的简明编码方法,接着通过信息熵的大小来决定是否进行...
关键词:高通量DNA序列 码书索引变换模型 块排序压缩变换 前移编码 信息熵 数据压缩算法 
基于混合统计模型的DNA序列压缩算法
《华南理工大学学报(自然科学版)》2014年第3期8-14,共7页孙季丰 仝雪珂 谭丽 
国家自然科学基金青年科学基金资助项目(61202292)
基于专家模型算法(XM算法)原理和有限上下文混合统计模型估计DNA序列每一个符号的概率,提出一种基于混合统计模型的DNA序列压缩算法.将采用混合统计模型计算出的概率估计应用于算术编码中,对标准DNA序列集的符号位进行压缩编码.实验结...
关键词:XM算法 有限上下文模型 混合统计模型 
基于Memetic算法的DNA序列数据压缩方法被引量:2
《电子与信息学报》2014年第1期121-127,共7页谭丽 孙季丰 郭礼华 
国家自然科学基金(60902087);广州市科委新星计划项目(2010A 090100016)资助课题
该文提出一种基于CPMA(Collaborative Particle swarm optimization-based Memetic Algorithm)算法的DNA序列数据压缩方法,CPMA分别采用综合学习粒子群优化(Comprehensive Learning Particle Swarm Optimization,CLPSO)算法和动态调整...
关键词:DNA序列压缩 MEMETIC算法 扩展的近似重复矢量(EARV) 粒子群优化(PSO) 动态混沌局部搜索 
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