石静

作品数:3被引量:12H指数:2
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发文领域:化学工程理学自动化与计算机技术一般工业技术更多>>
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聚合物纳米球结晶机理的计算机模拟被引量:1
《中国科学:化学》2013年第1期49-54,共6页王思邈 陶晓芳 石静 孔滨 余翔 刘文志 聂峰光 李晓霞 杨小震 
国家自然科学基金(20874107,21073195);多相复杂系统国家重点实验室开放项目基金的资助
本文基于位置有序参数(SOP)分析了利用图形处理器(GPU)加速的分子动力学程序GMD模拟含有4.5万和36万个CH2联合原子的聚乙烯纳米球的分子动力学结晶过程中结晶度的变化,并使用Avrami方程得到了不同温度下的结晶指数.与一般实验结果相同,...
关键词:聚乙烯纳米球 高分子结晶 Avrami方程 分子动力学 图形处理器(GPU) 
分子动力学模拟LINCS约束算法的GPU并行化被引量:6
《计算机与应用化学》2012年第8期907-912,共6页刘忠亮 李晓霞 石静 郭力 孔滨 杨小震 
国家自然科学基金资助项目(21073195);中国科学院过程工程研究所多相复杂系统国家重点实验室开放基金资助
分子动力学模拟(Molecular Dynamics,MD)是计算化学和生物模拟领域一种重要的计算手段,由于计算强度大,目前MD可模拟的时空尺度还不能满足真实物理过程的需要,计算速度是其主要瓶颈之一。2007年以来,比CPU具有更强大的存储器带宽和计算...
关键词:分子动力学(MD) LINCS约束算法 GPU CUDA GROMACS 
Particle-Mesh-Ewald(PME)算法在GPU上的实现被引量:10
《计算机与应用化学》2012年第5期517-522,共6页石静 李晓霞 刘忠亮 刘文志 郭力 
国家自然科学基金资助项目(21073195);中国科学院过程工程研究所多相复杂国家重点实验室自主探索项目资助
分子动力学模拟(MD)是分子模拟的一类常用方法,为生物体系的模拟提供了重要途径。由于计算强度大,目前MD可模拟的时空尺度还不能满足真实物理过程的需要。作为CPU的加速设备,近年来,GPU为提高MD计算能力提供了新的可能。GPU编程难点主...
关键词:PME分子动力学模拟(MD) GPU CUDA GMD 
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