王芬

作品数:1被引量:3H指数:1
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供职机构:西北农林科技大学更多>>
发文主题:蛋白质相互作用网络蛋白质相互作用网络挖掘种内同源更多>>
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基于蛋白质相互作用网络挖掘物种内的功能相似蛋白质被引量:3
《生物物理学报》2011年第9期789-800,共12页宋宝兴 桑青 王芬 张德礼 
国家自然科学基金(31072115;30270342);生物大分子国家重点实验室开放基金(O5SY021107);兽医生物技术国家重点实验室开放基金(SKLVBF200905);遗传资源与进化国家重点实验室开放基金(GREKF09-05);传染病诊治国家重点实验室开放基金(2010KF13);有害生物控制与资源利用国家重点实验室访问学者基金(SKLBC09F04);农业部动物疫病病原学与免疫控制重点开放实验室开放基金(2010KLEP002)~~
本文基于图论(graph theory)思想挖掘功能相似蛋白质。将蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction network,PPI)转化为图,使用1-hop方法把相互作用网络拆分为子图。应用最短路径法,依次把拆分得到的每一个子图与所有子图进行两...
关键词:功能相似蛋白质 同源 蛋白质相互作用网络 
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