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检索条件："关键词=浮动电荷模型 "
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环多肽晶体的浮动电荷极化力场模拟被引量：4
《物理化学学报》2006年第10期1243-1247,共5页张强 张霞 杨忠志 
国家自然科学基金(20173025和20373021)资助项目
利用原子键电负性均衡结合分子力场方法(ABEEM/MM)对五种环多肽晶体进行了研究.与传统力场相比,该方法中的静电势包含了分子内和分子间的静电极化作用,以及分子内电荷转移影响,同时加入了化学键等非原子中心电荷位点,合理地体现了分子...
关键词：原子键电负性均衡结合分子力场方法(ABEEM/MM) 环多肽 极化力场 浮动电荷模型 氢键 
磷脂分子DPPC的浮动电荷分子力场被引量：3
《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2018年第4期482-489,共8页宫利东 田博 李斌 孙小雅 于敏聪 杨忠志 
国家自然科学基金资助项目(20703022);辽宁省自然科学基金资助项目(20180550163);辽宁师范大学创新实践项目(CX201801012)
基于量子化学(QM)计算和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEMσπ/MM),构建了1,2-二棕榈酰磷脂酰胆碱(1,2-dipalmitoyl-sn-phosphatidylcholine,DPPC)分子的可极化势能函数.首先将DPPC分子分成乙基三甲基铵(ETMA)、乙酸甲酯(MAS)...
关键词：DPPC ABEEMΣΠ/MM 可极化力场 浮动电荷模型 电荷分布 
原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)应用于蛋白质BPTI水溶液的分子动力学模拟被引量：4
《科学通报》2007年第15期1739-1742,共4页管清梅 崔宝秋 赵东霞 宫利东 杨忠志 
国家自然科学重点基金资助项目(批准号:20633050和20403007)
利用ABEEM/MM浮动电荷模型对蛋白质BPTI分子的水溶液进行了分子动力学模拟,验证了模拟参数(包括ABEEM参数和力场参数)的正确性以及可转移性.结果表明,对蛋白质BPTI水溶液模拟所得的蛋白质中各类非氢原子的位置与实验晶体结构相比的均方...
关键词：ABEEM/MM 浮动电荷模型 BPTI水溶液 均方根位移偏差 径向分布函数 
烷烃小分子溶剂化自由能的快速计算被引量：3
《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2010年第3期332-334,共3页杨忠志 于玲 赵东霞 
国家自然科学基金项目(20633050;20873055;20703022)
将ABEEMσπ浮动电荷模型与generalized Born(GB)模型相结合,计算分子的溶剂化自由能.GB模型是一种连续介质模型,计算快速而简单,但是这种模型的计算精度却尚待提高.由于ABEEMσπ浮动电荷模型将分子的电荷区域进行了详细划分,分为原子...
关键词：浮动电荷模型 GB/SA模型 溶剂化自由能 极化 
磷脂分子POPE的浮动电荷分子力场
《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2020年第4期482-488,共7页宫利东 赵力傧 田博 杨忠志 
国家自然科学基金资助项目(20703022);辽宁省自然科学基金资助项目(20180550163)。
应用量子化学(QM)计算和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEMσπ/MM)方法,建立1-棕榈酰-2-油酰基-磷脂酰乙醇胺(POPE)分子的浮动电荷力场.将POPE分子的极性头部分为乙基三甲基铵(ETMA)、乙酸甲酯(MAS)和磷酸二甲酯(DMP)等小分子片...
关键词：POPE ABEEMΣΠ/MM 可极化力场 浮动电荷模型 电荷分布 
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