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LETM 2基因在胃癌中的表达及其对胃癌腹膜转移预测和预后的意义被引量：2
《福建医科大学学报》2022年第3期213-219,共7页施若云 王珺岚 张真真 
福建省卫生健康中青年骨干人才培养项目(2019-ZQN-55);福建省自然科学基金面上项目(2020J01988)。
目的探讨LETM2免疫组织化学染色(IHC)对胃癌腹膜隐匿转移灶检测及预后的预测价值。方法通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)在GSE62254数据集中获得胃癌腹膜转移关键模块,基于GEO(GSE62254和GSE84437)和TCGA数据集的单因素COX回归分析筛...
关键词：胃肿瘤 腹膜转移 含亮氨酸拉链和EF手跨膜蛋白2 加权基因共表达网络分析 预后 
利用加权基因共表达网络分析识别胆道闭锁相关的枢纽基因被引量：1
《天津医科大学学报》2022年第2期123-128,共6页周红 吴梅 李鑫 
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2019D01A12)。
目的:通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别胆道闭锁(BA)发病相关的枢纽基因。方法:从基因表达汇编(GEO)数据库下载BA基因芯片数据集GSE46960,利用WGCNA构建基因共表达网络,识别与BA相关的模块与枢纽基因,对关键模块进行基因本体论(GO...
关键词：胆道闭锁 加权共表达网络分析 枢纽基因 
基于WGCNA鉴定全缘叶绿绒蒿类黄酮合成途径关键基因
《中国农业科学》2024年第15期3053-3070,共18页陈晓涓 王海菊 王富敏 雍清青 黄顺满 屈燕 
国家自然科学基金(32160404,31460218);云南省“万人计划”青年拔尖人才项目(YNWR-QNBJ-2019-211)。
【目的】黄酮类化合物具有抗炎、抗癌、抑菌等多种功效,是全缘叶绿绒蒿的主要药用成分之一。通过分析全缘叶绿绒蒿不同部位的空间代谢组与转录组信息,挖掘调控黄酮类化合物合成的关键基因,为研究全缘叶绿绒蒿类黄酮合成机制提供理论参考...
关键词：全缘叶绿绒蒿 类黄酮 药用 关键基因 加权基因共表达网络分析(WGCNA) 
Coupled electrophysiological recording and single cell transcriptome analyses revealed molecular mechanisms underlying neuronal maturation被引量：3
《Protein & Cell》2016年第3期175-186,共12页Xiaoying Chen Kunshan Zhang Liqiang Zhou Xinpei Gao Junbang Wang Yinan Yao Fei He Yuping Luo Yongchun Yu Siguang Li Liming Cheng Yi E. Sun 
The online version of this article （doi：10.1007/s13238-016-0247-8） contains supplementary material, which is available to authorized users.This work was supported by the National Basic Research Program （973 Program） （No. 2012CB966303）, the National Natural Science Foundation of China （Grant Nos. 81330030, 91319309, and 31271371）, the Science and Technology Department of Yunnan Province （Grant 2012HA013）, the Yunnan Basic Research Projects （Grant 2014FC004）, and the Doctoral Tutor of Education Department of Shanghai, China （Grant 20130072110021 ）, grants from NASAD： BRN ＆ BEHV RES FND 23072, NIH R21：IR21NS095184-01 and finally, a fellowship from China Scholarship Council to X. -Y.C.
The mammalian brain is heterogeneous, containing billions of neurons and trillions of synapses forming vari- ous neural circuitries, through which sense, movement, thought, and emotion arise. The cellular heterogeneit...
关键词：Patch-Seq hESC/hiPSC-derived neuron WGCNA Biomarkers for neuronal maturation Ubiquitination and mitochondrial function 
基于WGCNA鉴定花生荚果膨大相关基因共表达模块
《中国油料作物学报》2024年第4期808-818,共11页吕正昊 史晓龙 周东英 任婧瑶 钟超 刘喜波 张鹤 康树立 赵新华 于海秋 王传堂 
国家现代农业产业技术体系(CARS-13);沈阳市科学技术计划(21-110-3-17);辽宁省“揭榜挂帅”科技攻关专项(2021JH/10400034)。
花生荚果膨大过程直接决定了荚果大小,深入研究该过程有助于明确荚果大小的调控机制。本研究以不同荚果大小的花生品种(系)为研究对象,分析荚果发育早期转录水平的变化,并利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定与荚果发育相关的关键基...
关键词：花生 荚果 发育 转录组 WGCNA 核心基因 
基因差异表达谱及WGCNA构建骨质疏松症miRNA-mRNA调控网络被引量：4
《中国骨质疏松杂志》2022年第6期787-793,801,共8页林适 林燕平 黄佳纯 袁嘉尧 连晓航 林贤灿 万雷 黄宏兴 
国家自然科学资金(81973886);广州中医药大学学科研究重点项目(XK2019028)。
目的通过基因差异表达谱及加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法构建并分析骨质疏松症相关的miRNA-mRNA调控网络,全面阐释骨质疏松症的发病机制。方法首先在GEO数据库中获取微阵列数据集,进行差异分析及WGCNA分析,获取差异miRNA和临床相...
关键词：骨质疏松症 加权基因共表达网络分析 微型核糖核酸 调控网络 
基于M1/M2型巨噬细胞浸润相关特征基因构建乳腺癌预后风险预测模型
《武汉大学学报（医学版）》2024年第9期1049-1056,共8页胡美顺 陈芳芳 张京伟 
中国初级卫生保健基金会新锐肿瘤支持治疗课题研究项目(编号:cphcf-2022-216)。
目的:基于M1/M2型巨噬细胞浸润特征基因构建乳腺癌预后风险预测模型,识别新的乳腺癌预后标志物,以促进乳腺癌精准治疗策略的发展。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌RNA-seq数据和临床信息,结合加权基因共表达网络分析(WGCNA...
关键词：乳腺癌 M1/M2型巨噬细胞 WGCNA 预后风险模型 
基于WGCNA分析鉴定糖尿病肾病新的诊断标志物被引量：1
《中国实验诊断学》2023年第11期1281-1287,共7页安敏 杨晓玲 马亮 付少杰 马福哲 
2022年河北省医学科学研究课题计划(20220219);吉林省自然科学基金(20210101259JC)
目的基于生物信息学技术鉴定糖尿病肾病(DKD)新的诊断标志物。方法在基因综合表达数据库(GEO)中筛选DKD与正常肾小球组织中的差异表达基因(DEGs),并通过加权基因共表达网络(WGCNA)筛选关键基因模块,获得关键DEGs。进行基因本体论功能(GO...
关键词：糖尿病肾病 诊断标志物 DUSP1 FOSB WGCNA分析 
基于多基因的阿尔兹海默症风险评估研究
《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2023年第4期90-94,共5页刘玮瑾 唐静蕾 彭文珂 陈梓政 施江程 
2022年国家级大学生创新创业训练项目《基于多基因的阿尔兹海默症风险评估系统研究》(项目编号:202210058031)阶段性成果。
阿尔兹海默症(Alzheimer’s Disease,AD)是一种神经退行性疾病,多发于老年人群,严重影响着患者的身体健康和生活质量,本研究利用生物信息学方法对AD基因表达谱数据进行系统性分析,旨在鉴定潜在的AD多基因生物标志物,从而建立有效的AD风...
关键词：阿尔兹海默症 生物信息学 差异表达基因 WGCNA 风险评估 
WGCNA鉴定奶山羊妊娠至泌乳期乳腺发育关键基因被引量：5
《畜牧兽医学报》2020年第11期2679-2688,共10页高慧杰 郑惠玲 
国家自然科学基金(31572368)。
旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选奶山羊不同生理阶段乳腺发育的关键基因。本研究从GEO数据库中下载奶山羊不同生理阶段(妊娠46天、70天、90天、110天和产后40天)的乳腺组织微...
关键词：加权基因共表达网络分析 乳腺发育 妊娠期 泌乳期 山羊 
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