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作 者:许先进[1] 苏计国[2] 刘斌[1] 李春华[1] 谭建军[1] 张小轶[1] 陈慰祖[1] 王存新[1]
机构地区:[1]北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京100124 [2]燕山大学理学院,河北秦皇岛066004
出 处:《物理化学学报》2013年第10期2276-2285,共10页Acta Physico-Chimica Sinica
基 金:国际科技合作项目(2010DFA31710);国家自然科学基金(31100523;31171267;21173014;11204267);北京工业大学博士生创新基金资助项目~~
摘 要:持久性有机污染物(POPs)会导致人类和动植物各种疾病的发生,已经成为一种新的全球性环境问题.研究发现,POPs分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上,发挥其致病机制.本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法,从蛋白质结构数据库中筛选出配体分子可能的受体蛋白质,研究了持久性有机污染物4,4-DDE和CB-153潜在的受体蛋白质.结合实验信息,讨论分析了排在前5%的蛋白质受体.值得注意的是,已知的一些蛋白质受体都排在了虚拟筛选结果的前列.该研究不仅有助于进一步了解这些有毒污染物分子的致病机制,还将为设计针对该类污染物分子的生物传感器提供有用的信息.Persistent organic pollutants (POPs) cause various diseases in both human and wildlife and have become a new global environmental problem. The toxic effects of POPs can be induced through their binding to specific proteins in the body. In the present work, a reverse virtual screening method based on molecular docking was used to search for potential protein targets for two POPs, 4,4'-dichlorodiphenyldichloroethane (4, 4'-DDD) and 2,2',4,4',5,5'-hexachlorobiphenyl (CB-153), from a protein structure database. Targets ranked in the top 5% were chosen for analysis using experimental information. All known targets appeared in the top 5% of targets. This study not only increases understanding of the toxic mechanism of POPs, but may also aid the design of novel recognition elements in biosensors.
关 键 词:持久性有机污染物 反向虚拟筛选 蛋白质靶点 生物传感器
分 类 号:X13[环境科学与工程—环境科学]
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