云南高校图书馆联盟文献共享服务平台- 陈慰祖

陈慰祖: 作品数：62被引量：135H指数：6; 导出分析报告; 供职机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院更多>>; 发文主题：HIV-1HIV-1整合酶分子对接整合酶蛋白质更多>>; 发文领域：生物学医药卫生理学自动化与计算机技术更多>>; 发文期刊：《中国生物工程杂志》《计算物理》《物理化学学报》《生物化学与生物物理进展》更多>>; 所获基金：国家自然科学基金北京市自然科学基金国家教育部博士点基金国际科技合作与交流专项项目更多>>

基于弹性网络模型的蛋白质结构-功能关系: 《北京工业大学学报》2017年第12期1787-1793,共7页丁喜峰米春霖陈慰祖苏计国王存新; 首批河北省青年拔尖人才支持计划资助项目(201319); 蛋白质结构-功能关系研究是结构生物学领域的热点问题之一,具有重要的理论和实际应用价值.弹性网络模型(elastic network model,ENM)是获取蛋白质结构本身固有动力学性质,进而揭示其生物学功能的有效方法,在蛋白质结构-功能关系研究中...; 关键词：蛋白质结构-功能关系弹性网络模型正则模分析功能性运动关键位点

蛋白质折叠的计算机模拟研究进展: 《北京工业大学学报》2017年第12期1818-1827,共10页苏计国王韦卜陈慰祖王存新; 首批河北省青年拔尖人才支持计划资助项目(201319); 蛋白质折叠是结构生物学领域有待解决的重要科学问题,计算机模拟方法是研究蛋白质折叠的主要手段之一.对蛋白质折叠的计算机模拟研究进展进行了简要介绍,主要内容包括:全原子分子动力学模拟、Gō模型以及弹性网络模型的主要思路及其在...; 关键词：蛋白质折叠分子动力学模拟 Gō模型弹性网络模型

p53 DNA结合域与抗癌多肽的拉伸分子动力学研究(英文): 《生物化学与生物物理进展》2014年第6期598-609,共12页许先进苏计国陈慰祖王存新 CANNISTRARO Salvatore BIZZARRI Anna-Rita; supported by grants from International S&T Cooperation Program of China(2010DFA31710);The National Natural Science Foundation of China(11204267);The doctoral fund of innovation from Beijing University of Technology and by a grant from The Italian Association for Cancer Research(AIRC No IG 10412)~~; 研究发现,取自蓝铜蛋白azurin的一段多肽p28能够进入癌细胞,结合到肿瘤抑制因子p53的DNA结合域上,进而增加p53的抗癌能力.本工作中,通过拉伸分子动力学方法,在原子尺度上研究了p28-p53 DBD复合物的解离过程.分析结果显示复合物的解离过...; 关键词：拉伸分子动力学 P53 抗癌多肽

持久性有机污染物4,4'-DDE和CB-153的反向虚拟筛选被引量：4: 《物理化学学报》2013年第10期2276-2285,共10页许先进苏计国刘斌李春华谭建军张小轶陈慰祖王存新; 国际科技合作项目(2010DFA31710);国家自然科学基金(31100523;31171267;21173014;11204267);北京工业大学博士生创新基金资助项目~~; 持久性有机污染物(POPs)会导致人类和动植物各种疾病的发生,已经成为一种新的全球性环境问题.研究发现,POPs分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上,发挥其致病机制.本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法,从蛋白质结构数据...; 关键词：持久性有机污染物反向虚拟筛选蛋白质靶点生物传感器

用支持向量机预测HIV-1整合酶抑制剂活性: 《北京工业大学学报》2013年第4期634-640,共7页刘昕谭建军陈慰祖刘斌李杉王存新; 国家自然科学基金资助项目(21173014);科技部国际合作项目(2010DFA31710); HIV整合酶可催化病毒复制周期中的整合过程,即将HIV反转录产物cDNA整合入宿主基因组,它是病毒复制过程中不可缺少的酶,也是抗HIV药物设计的重要靶点.构建嘧啶酮类(pyrimidones)HIV-1整合酶抑制剂定量构效关系模型,有助于进一步了解影响...; 关键词：支持向量机 HIV-1整合酶抑制剂定量构效关系嘧啶酮

HIV-1整合酶链转移反应抑制剂的荧光筛选方法: 《中国生物工程杂志》2013年第1期67-71,共5页刘斌刘昕李杉何红秋张小轶谭建军陈慰祖王存新; 科技部国际合作项目(2010DFA31710) ;国家自然科学基金(31100523;21173014);国家"973" 计划( 2009CB930200);北京工业大学博士科研启动基金(X0015001201104)资助项目; 整合酶被认为是抗HIV-1药物研究的理想靶点之一。为了建立便捷高效的整合酶链转移反应抑制剂筛选方法,首先将HIV-1整合酶原核表达载体pNL-IN转化入大肠杆菌感受态细胞BL21(DE3)进行原核表达,并用镍琼脂糖凝胶进行亲和纯化,获得了纯度和...; 关键词：HIV-1 整合酶链转移抑制剂筛选

蛋白质表面模块划分及其在结合位点预测中的应用被引量：2: 《物理化学学报》2012年第11期2729-2734,共6页王攀文龚新奇李春华陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(31171267;10974008);北京市自然科学基金(4102006);科技部国际合作项目(2010DFA31710);北京市教委科技创新平台-自然基础研究项目资助~~; 蛋白质-蛋白质复合物的结合位点预测是计算分子生物学的一个难题.本文对蛋白质-蛋白质复合物数据集Benchmark3.0中的双链蛋白质复合物进行了研究,计算了单体的残基溶剂可接近表面积和残基间的接触面积,并据此提出了蛋白质表面模块划分方...; 关键词：蛋白质结合位点预测模块划分溶剂可接近表面积内部接触面积

蛋白质-蛋白质分子对接中打分函数研究进展被引量：10: 《物理化学学报》2012年第4期751-758,共8页王存新常珊龚新奇杨峰李春华陈慰祖; 国家自然科学基金(10974008;31171267);教育部博士点基金项目(200800050003);科技部国际合作项目(2010DFA31710)资助~~; 分子对接是研究分子间相互作用与识别的有效方法.其中,用于近天然构象挑选的打分函数的合理设计对于对接中复合物结构的成功预测至关重要.本文回顾了蛋白质-蛋白质分子对接组合打分函数中一些主要打分项,包括几何互补项、界面接触面积...; 关键词：蛋白质-蛋白质分子对接打分函数打分策略结合位点信息

分子信标方法研究HIV-1整合酶3'加工反应动力学被引量：1: 《中国生物工程杂志》2012年第2期76-81,共6页何红秋刘斌陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(30670497);北京市自然科学基金(5072002);重庆市科技攻关重点项目(CSTC2010AB5101)资助项目; HIV-1整合酶催化病毒cDNA与宿主细胞基因组DNA的整合,是病毒在宿主细胞中增殖的一个关键酶。3'加工是整合酶催化整合过程的第一步反应,3'加工反应动力学的研究对整合酶催化机理研究和以整合酶为靶点的药物研发都具有重要意义。构建了野...; 关键词：HIV-1 整合酶分子信标3’加工动力学

蛋白质-蛋白质分子对接方法中分子柔性处理与近天然结构筛选的研究被引量：2: 《生物物理学报》2012年第1期15-22,共8页杨峰曹立彬龚新奇常珊陈慰祖王存新李春华; 国家自然科学基金项目(10974008);北京市自然科学基金项目(4102006);教育部博士点基金项目(200800050003);科技部国际科技合作项目(2010DFA31710);北京市教委科技创新平台-自然基础研究基金资助项目~~; 蛋白质-蛋白质分子对接方法是研究蛋白质分子间相互作用与识别的重要理论方法。该方法主要涉及复合物结合模式的构象搜索和近天然结构的筛选两个问题。在构象搜索中,分子柔性的处理是重点也是难点,围绕这一问题,近年来提出了许多新的方...; 关键词：蛋白质-蛋白质分子对接分子柔性处理结合位点信息结构聚类打分函数

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