云南高校图书馆联盟文献共享服务平台- 苏计国

苏计国: 作品数：10被引量：17H指数：3; 导出分析报告; 供职机构：燕山大学理学院更多>>; 发文主题：蛋白质折叠相对熵蛋白质去折叠同源模建更多>>; 发文领域：生物学环境科学与工程医药卫生电子电信更多>>; 发文期刊：《燕山大学学报》《物理化学学报》《生物化学与生物物理进展》《生物技术通讯》更多>>; 所获基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金北京市自然科学基金国际科技合作与交流专项项目更多>>

p53 DNA结合域与抗癌多肽的拉伸分子动力学研究(英文): 《生物化学与生物物理进展》2014年第6期598-609,共12页许先进苏计国陈慰祖王存新 CANNISTRARO Salvatore BIZZARRI Anna-Rita; supported by grants from International S&T Cooperation Program of China(2010DFA31710);The National Natural Science Foundation of China(11204267);The doctoral fund of innovation from Beijing University of Technology and by a grant from The Italian Association for Cancer Research(AIRC No IG 10412)~~; 研究发现,取自蓝铜蛋白azurin的一段多肽p28能够进入癌细胞,结合到肿瘤抑制因子p53的DNA结合域上,进而增加p53的抗癌能力.本工作中,通过拉伸分子动力学方法,在原子尺度上研究了p28-p53 DBD复合物的解离过程.分析结果显示复合物的解离过...; 关键词：拉伸分子动力学 P53 抗癌多肽

持久性有机污染物4,4'-DDE和CB-153的反向虚拟筛选被引量：4: 《物理化学学报》2013年第10期2276-2285,共10页许先进苏计国刘斌李春华谭建军张小轶陈慰祖王存新; 国际科技合作项目(2010DFA31710);国家自然科学基金(31100523;31171267;21173014;11204267);北京工业大学博士生创新基金资助项目~~; 持久性有机污染物(POPs)会导致人类和动植物各种疾病的发生,已经成为一种新的全球性环境问题.研究发现,POPs分子能够特异性地结合到生物体内一些蛋白质受体上,发挥其致病机制.本文运用基于分子对接的反向虚拟筛选方法,从蛋白质结构数据...; 关键词：持久性有机污染物反向虚拟筛选蛋白质靶点生物传感器

淀粉蔗糖酶DrAS的工作机理研究与稳定性改造: 《生物物理学报》2013年第4期286-295,共10页刘明李平刘斌苏计国王存新; 国家自然科学基金项目(11204267)~~; 淀粉蔗糖酶(amylosucrase,AS)以蔗糖为唯一底物和能量来源催化合成直链葡聚糖。与AS相比,其它拥有合成直链淀粉样多糖的酶都需要利用昂贵的核苷酸激活糖来进行合成。这使得AS成为一种具有工业应用潜力的工业酶。尽管具有较大应用潜力,...; 关键词：淀粉蔗糖酶DrAS 同源模建高斯网络模型去折叠

淀粉蔗糖酶AcAS的工作机理与去折叠性质研究(英文): 《生物化学与生物物理进展》2013年第6期565-577,共13页刘明李平刘斌苏计国王存新; 淀粉蔗糖酶(amylosucrase,AS)是一种葡萄糖基转移酶(E.C.2.4.1.4),隶属于糖苷水解酶13家族.当体系中存在葡聚糖时,AS可以蔗糖为唯一底物催化合成直链葡聚糖.与AS相比,其他拥有合成直链淀粉样多糖的酶都需要利用昂贵的核苷酸激活糖来进...; 关键词：淀粉蔗糖酶同源模建去折叠高斯网络模型迭代高斯网络模型

淀粉蔗糖酶AcAS的工作机理研究与稳定性改造被引量：1: 《生物技术通讯》2013年第3期308-313,共6页刘明孙巍岳俊杰苏计国; 国家自然科学基金(11204267); 目的:对新发现的一种新型淀粉蔗糖酶AcAS的结构功能进行深入讨论。方法:用同源模建方法构建AcAS的三维结构;用高斯网络模型和各项异性网络模型,对其功能型运动和工作机理进行预测;利用迭代高斯网络模型方法对其去折叠路径进行预测;根据...; 关键词：淀粉蔗糖酶AcAS 同源模建高斯网络模型去折叠

基于弹性网络模型的细胞色素c折叠核的识别研究: 《燕山大学学报》2012年第5期465-470,共6页苏计国郝锐; 国家自然科学基金资助项目(10947014); 来自细菌的细胞色素c与来自马的细胞色素c具有很高的序列和结构相似性,但是二者的折叠/去折叠路径及折叠核的位置具有很大的差异,导致这种差异的原因目前并不清楚。本文采用迭代的高斯网络方法研究了上述两个蛋白的去折叠过程,并成功识...; 关键词：细胞色素C 折叠核弹性网络模型拓扑结构

不同类型氨基酸网络参量与蛋白质折叠的关系被引量：6: 《生物化学与生物物理进展》2010年第7期762-768,共7页严立成苏计国陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(10974008;10947014);教育部博士点基金(200800050003)资助项目~~; 理论和实验研究表明,蛋白质天然拓扑结构对其折叠过程具有重要的影响.采用复杂网络的方法分析蛋白质天然结构的拓扑特征,并探索蛋白质结构特征与折叠速率之间的内在联系.分别构建了蛋白质氨基酸网络、疏水网、亲水网、亲水-疏水网以及...; 关键词：氨基酸网络疏水作用折叠速率匹配系数聚集系数

基于相对熵的蛋白质折叠研究方法的改进: 《中国科学（G辑）》2009年第4期549-555,共7页齐立省苏计国陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(批准号:10574009);北京市自然科学基金(编号:5072002)资助项目; 在本课题组以前的工作中,通过优化相对熵函数来预测蛋白质主链的三维结构取得了较好的结果.但是在该方法中接触势的系综平均值采用了一个估计值,为了使基于相对熵的蛋白质结构预测方法在理论上更加完善,该文基于统计热力学微扰理论,提...; 关键词：蛋白质折叠相对熵优化方法热力学微扰

基于HNP模型及相对熵的蛋白质设计方法在不同蛋白质体系中的应用被引量：1: 《生物化学与生物物理进展》2008年第9期1070-1076,共7页齐立省苏计国陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(10574009,30670497);北京市自然科学基金(5072002)资助项目~~; 详细考察了基于HNP(H:hydrophobic,N:neutral,P:hydrophilic)模型及相对熵的蛋白质设计方法对于不同结构类型蛋白质的适用性,并与基于HP模型的结果进行了比较.通过对190个4种不同结构类型的蛋白质进行预测,结果表明,基于HNP模型及相对...; 关键词：蛋白质设计相对熵结构类型氨基酸简化模型

基于HNP三态模型及相对熵方法的蛋白质折叠研究被引量：6: 《生物化学与生物物理进展》2006年第5期479-484,共6页苏计国王宝翰焦雄陈慰祖王存新; 国家自然科学基金(10574009);国家教育部博士点基金(20040005013)资助项目.~~; 把20种氨基酸简化为3类:疏水氨基酸(hydrophobic,H)、亲水氨基酸(hydrophilic,P)及中性氨基酸(neutral,N),每个氨基酸简化为一个点,用其C!原子来代替.采用非格点模型,以相对熵作为优化函数,进行蛋白质三维结构预测.为了与基于相对熵方...; 关键词：氨基酸简化模型相对熵蛋白质折叠

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