蛋白质设计

作品数：46被引量：31H指数：3
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人工智能在酶工程中的应用与进展
《生命的化学》2025年第2期252-264,共13页孙萌 王曼潞 李雨泽 袁波 陈晨曦 王梁华 陈涵 孙铭娟 
国家自然科学基金面上项目(82173732)。
近年来,随着人工智能技术的快速发展,其在酶工程领域的应用展现出巨大潜力,特别是在酶分子定向进化方面。人工智能技术辅助酶分子设计为酶定向进化提供了预测指导,为酶工程提供了新的设计策略和工具。酶分子定向进化的基本流程包括构建...
关键词：酶工程 定向进化 人工智能 机器学习 蛋白质设计 
真菌毒素降解酶及其结构和功能研究进展被引量：2
《核农学报》2025年第1期140-156,共17页王凤华 牛锦璐 邓俊劲 晏石娟 张军 吴绍文 
国家自然科学基金(22307022);高水平农科院建设-科技创新战略专项(GDNKY-ZQQZ-K5);广东省科技计划项目(2021TQ06N115);甘肃省自然科学基金(23JRRA1413)。
真菌毒素作为真菌次级代谢产生的一类化合物,其化学结构稳定并可在食物链中积累,严重威胁人类和禽畜健康并造成重大经济损失。生物酶降解法因安全性高、环境友好等优点而在真菌毒素脱毒方面展现出极大的应用前景。本文系统总结黄曲霉毒...
关键词：真菌毒素 降解酶 结构 蛋白质设计 
智能蛋白质工程
《生物化学与生物物理进展》2024年第12期3084-3102,共19页王凯悦 叶盛 
北京市科技计划课题(Z221100003522020)资助项目。
蛋白质是生命活动的重要基础物质,在生物体内扮演着多种关键角色,包括构建细胞结构、参与代谢和能量转化、调节生理功能、提供免疫保护、传递信号等。蛋白质多样化的功能是通过其特定的氨基酸序列,以及相应的三维结构来实现的。蛋白质...
关键词：蛋白质工程 蛋白质设计 密码子优化 蛋白质结构 深度学习 深度生成 人工智能 
蛋白质的计算设计与结构预测
《自然杂志》2024年第6期429-434,共6页卞月珉 
国家自然科学基金(优秀青年科学基金项目(海外)、青年科学基金项目82404516);上海市海外高层次人才项目;上海市教委人工智能促进科研范式改革赋能学科跃升计划专项项目的支持
2024年诺贝尔化学奖授予了在蛋白质结构设计与预测领域作出决定性贡献的三位科学家:大卫·贝克(David Baker)、德米斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)和约翰·朱姆珀(John M.Jumper)。本文围绕三位获奖者,主要介绍了计算结构生物学领域中蛋...
关键词：蛋白结构预测 蛋白质设计 人工智能 诺贝尔化学奖 
AlphaFold结构预测的重大突破及其对蛋白质研究的影响与挑战
《生物化学与生物物理进展》2024年第12期3073-3083,共11页宫维斌 
国家自然科学基金(32371273)资助项目。
近年来,基于深度学习的方法研究在蛋白质结构预测领域实现了重大突破。AlphaFold 2 (AF2)于2021年开源发布,实现了蛋白质暨蛋白质复合物三维结构的高精度预测,使得研究人员能够快速获取可靠的三维结构信息,显著加速了蛋白质结构与功能...
关键词：AlphaFold 深度学习 大数据 蛋白质结构预测 生物分子复合物结构预测 蛋白质设计 
固定骨架的从头蛋白质设计:多目标优化与深度学习算法研究进展
《江苏科技大学学报(自然科学版)》2024年第6期69-75,共7页李瑞祥 沈红斌 
国家自然科学基金项目(62073219)。
固定骨架的蛋白质设计通过计算的方法生成能够折叠为目标蛋白结构的氨基酸序列,该过程可以被视作蛋白质结构预测的逆过程.蛋白质的功能与结构有着紧密的联系,因此基于特定结构的蛋白质设计在酶、疫苗、制药、蛋白质材料等领域都有着潜...
关键词：蛋白质设计 能量函数 多目标优化 深度学习 蛋白质序列与结构 
大语言模型在蛋白质设计中的应用综述
《基因组学与应用生物学》2024年第8期1303-1320,共18页张锦雄 孟雪莉 陈燕 韦松键 吕丽兰 胡小春 
国家自然科学基金项目(62362004);广西重点研发计划项目(桂科AB24010031)资助。
在蛋白质设计领域,人工智能技术的应用已经催生了一些大模型。蛋白质的计算设计是指利用计算机技术辅助确定蛋白质的氨基酸序列,实现预设的结构和功能的过程。基于计算的蛋白质设计可进行改造设计或从头设计。特定功能的蛋白质快速生成...
关键词：蛋白质序列 蛋白质结构 大语言模型 Transformer架构 
巨型AI蛋白质设计模型生成了新型荧光蛋白
《世界科学》2024年第8期13-14,共2页思羽(编译) 
Evolutionary Scale(一家AI新锐公司)的蛋白质语言模型ESM3是生物学领域最大的AI模型之一,已创造出新型荧光蛋白。这一进展赢得了市场积极的关注。科学家已经使用一个“能讲蛋白质语言”的人工智能(AI)模型——它是迄今为止生物学领域...
关键词：语言模型 科研方向 生物数据 荧光蛋白 AI 荧光分子 药物开发 纽约市 
华盛顿大学蛋白质设计研究所创新之道及其对生命科学新型研发机构建设的启示
《中国科学院院刊》2024年第7期1235-1244,共10页赵润州 倪铭 法云智 伯晓晨 焦剑 
蛋白质设计研究所是美国华盛顿大学发起,州政府、联邦政府等支持的非营利性科研机构。自2012年成立起,该研究所抢抓人工智能驱动科学研究(AI for Science)、开放科学发展机遇,提升原始创新、技术供给和产品生成能力,现已成为全球生命科...
关键词：蛋白质设计 新型研发机构 生命科学 科技创新 
生物信息学课程思政的教学探索与元素挖掘被引量：1
《佳木斯大学社会科学学报》2024年第3期171-174,共4页张寅良 房伟 张学成 
安徽大学校级质量工程项目:“生命学院交叉学科拔尖人才培养”(2022xjzlgc004);安徽大学研究生精品课程建设项目:“现代生物技术原理”(Y010510028)。
生物信息学课程是生物学专业的核心课程,在本科生和研究生课程中均占有一定比重,然而,在过去的教学中,往往只注重学科知识和技能的培养,而忽略了思政元素的教育。因此,在生物信息学课程中融入思政教学,挖掘思政元素,对于培养学生的社会...
关键词：生物信息学 课程思政 教学改革 新冠疫苗 蛋白质设计 
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