蛋白结构预测

作品数:84被引量:216H指数:7
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相关机构:中国农业科学院兰州兽医研究所青海大学渊慧科技有限公司内蒙古农业大学更多>>
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细粒棘球蚴重组蛋白EgG1Y162诱导表达条件的 优化及其蛋白结构预测
《新疆医科大学学报》2025年第4期426-431,共6页陈娜菲 李小坡 马西智 彭学臻 曹春宝 周晓涛 
新疆维吾尔自治区杰出青年基金项目(2022D01E50);国家自然科学基金项目(32260192)。
目的探索优化重组质粒pET30a-EgG1Y162表达条件并预测其蛋白结构模型。方法通过使用EgG1Y162原始菌种进行诱导表达,探索不同浓度异丙基硫代半乳糖苷(IPTG,sopropylβ-D-Thiogalactoside)、孵育时间对EgG1Y162蛋白诱导表达水平的影响。...
关键词:细粒棘球蚴 EgG1Y162 原核表达条件优化 生物信息学 
蛋白质的计算设计与结构预测
《自然杂志》2024年第6期429-434,共6页卞月珉 
国家自然科学基金(优秀青年科学基金项目(海外)、青年科学基金项目82404516);上海市海外高层次人才项目;上海市教委人工智能促进科研范式改革赋能学科跃升计划专项项目的支持
2024年诺贝尔化学奖授予了在蛋白质结构设计与预测领域作出决定性贡献的三位科学家:大卫·贝克(David Baker)、德米斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)和约翰·朱姆珀(John M.Jumper)。本文围绕三位获奖者,主要介绍了计算结构生物学领域中蛋...
关键词:蛋白结构预测 蛋白质设计 人工智能 诺贝尔化学奖 
猪流行性腹泻病毒S1基因遗传进化分析及蛋白结构预测
《现代农业科技》2024年第21期146-152,164,共8页孙在兴 邱文英 扶海 罗皓 曹敏 李玉锋 
四川省科技成果转移转化项目“高致病性禽流感DNA疫苗技术成果转化”(2022ZHCG0024)。
猪流行性腹泻病毒(PEDV)属于冠状病毒科甲型冠状病毒属,可引起血清阴性新生仔猪急性腹泻、呕吐、脱水,死亡率较高。PEDV感染引起的猪流行性腹泻(PED)给欧洲和亚洲养猪业造成了重大的经济损失。地方性PED是一个重大问题,多种PEDV潜在输...
关键词:猪流行性腹泻病毒 S1基因 生物信息学 遗传进化 蛋白结构 疫苗 
一株海洋杆菌属新菌种XAAS-72^(T)的植物促生功能分析及ACC脱氨酶蛋白结构预测
《新疆农业科学》2024年第7期1778-1785,共8页王慧楠 朱静 谢文文 何子璇 柏晓玉 朱艳蕾 张志东 
新疆维吾尔自治区自然科学基金项目“杰出青年基金”(2022D01E19);新疆农业科学院科技创新重点培育专项(xjkcpy-2022004);新疆农业科学院农业科技创新稳定支持专项(xjnkywdzc-2023005)。
【目的】研究海洋杆菌属新菌种XAAS-72的植物促生功能,挖掘其潜在功能基因。【方法】通过对菌株全基因组测序,分析相关功能基因组成,挖掘ACC脱氨酶合成相关的候选基因,并进行功能预测。【结果】海洋杆菌属新种Pontibacter kalidii XAAS...
关键词:海洋杆菌属 植物促生特性 ACC脱氨酶 结构预测 
干旱胁迫下沙棘CMO基因的时空表达模式与蛋白结构预测被引量:1
《西北林学院学报》2024年第2期21-27,共7页刘青青 马玉花 董佳伟 冶贵生 张丹 杨开宇 
国家自然科学基金(31660071);青海省科技厅项目(2017-ZJ-734)。
CMO基因是沙棘体内甜菜碱合成过程中的关键性基因,对植物体抗旱起着重要作用。以青海野生中国沙棘的根、茎、叶为试验材料,对沙棘CMO基因及其全长序列进行克隆,并进行生物信息学分析,在此基础上对不同程度干旱胁迫下沙棘不同组织部位CM...
关键词:沙棘 干旱胁迫 CMO基因 蛋白质结构 
非洲猪瘟病毒H3基因序列分析蛋白结构预测及其亚细胞定位
《中国兽医科学》2023年第8期939-946,共8页亢伟芳 王悦 任静静 彭江玲 朱国强 李丹 杨文萍 郑海学 
国家重点研发计划项目(2021YFD1801300);甘肃省科技重大专项计划项目(21ZD3NA001);广东省农业科技创新十大主攻方向“揭榜挂帅”项目(2022SDZG02);农业技术产业体系建设项目(CARS-352022);国家自然科学基金青年科学基金项目(32202780)。
在前期研究中本实验室构建了敲除H3(Hypothetical protein 3)基因的非洲猪瘟病毒(ASFV)毒株,并进一步通过动物实验表明敲除该基因对于ASFV的毒力没有影响,推测该蛋白可能是ASFV的非结构蛋白。为进一步了解ASFVH3基因及其编码蛋白的理化...
关键词:非洲猪瘟病毒 H3基因 蛋白结构预测 亚细胞定位 
人工智能在药物靶点的筛选及验证方面的应用进展被引量:2
《中国药科大学学报》2023年第3期269-281,共13页王超 肖辅 李妙竹 潘颖 丁晓 任峰 Zhavoronkov Alex 王亚洲 
近年来人工智能发展迅速,随着算力的提升、算法的迭代,人工智能极大方便了生物信息、化学信息和临床数据的收集及处理,为新药研发注入了新的活力。本综述对人工智能在制药领域的发展历程及其主要算法进行了简要介绍,随后结合具体实例对...
关键词:人工智能 靶点发现 蛋白结构预测 苗头化合物生成 端到端应用 
异戊酸血症基因新发变异蛋白结构预测
《中国优生与遗传杂志》2023年第6期1208-1212,共5页程威 张志蕾 王彦云 洪冬洋 孙云 蒋涛 
2021年度南京医科大学科技发展基金项目(NMUB 20210121)。
目的探索异戊酸血症的临床及致病基因突变特点。方法收集1例异戊酸血症的临床资料及提取患儿及父母外周血基因组DNA,采用基于高通量测序技术的基因Panel进行诊断;同时收集国内已经报道的异戊酸血症的临床资料进行汇总,分析其临床表型和...
关键词:新生儿筛查 异戊酸血症 早期确诊 基因检测 
本期『生物信息』专栏主持人陈伟 专栏评述
《电子科技大学学报》2022年第6期819-819,共1页
评“多结构域蛋白质结构预测方法综述”蛋白质结构决定了其生物学功能,通过分析蛋白质的结构可以为药物分子设计提供合理的靶分子及结构。因此,蛋白质结构预测一直是生物信息学关注的热点问题,也是生命科学领域尚未解决的重大基础性科...
关键词:蛋白质结构预测 药物分子设计 组装方法 主持人 蛋白结构预测 数据库 方法综述 
非洲猪瘟病毒MGF360-10L的结构预测及亚细胞定位
《中国兽医科学》2022年第5期537-546,共10页彭江玲 易佳敏 朱国强 文圆 吴盼雪 李丹 郑海学 
国家重点研发计划项目(2021YFD1800100);甘肃省科技厅重大专项(20ZD7NA006);家畜疫病病原生物学国家重点实验室自主课题(SKLVEB2020CGPY02);中国农业科学院科技创新工程重大科研计划项目(CAAS-ZDRW202006-03)。
为了解非洲猪瘟病毒(ASFV)多基因家族成员MGF360-10L基因及其编码蛋白的理化性质和结构特征,本研究在NCBI数据库中搜集到68株含有MGF360-10L序列的ASFV毒株,对这些序列进行比较并构建系统发育进化树;分析MGF360-10L基因及其编码蛋白的...
关键词:非洲猪瘟病毒 MGF360-10L基因 序列分析 蛋白结构预测 亚细胞定位 
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