基于相对熵的蛋白质设计新方法  

作　　者：刘贇[1] 王宝翰[2] 王存新[1] 陈慰祖[1] 

机构地区：[1]北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京100022 [2]中国科学院生物物理研究所,北京100101

出　　处：《中国科学（G辑）》2003年第4期348-356,共9页

基　　金：国家自然科学基金(批准号:10174005;30170230);北京市自然科学基金(批准号:5032002

摘　　要：提出一个关于蛋白质设计的新的有效快速的优化方法,其实质是按照Boltz-mann分布搜索序列空间。这一方法完全基于物理学原理,在该方法中使用了相对熵的概念,并把它作为优化的目标函数。利用真实蛋白质的非格子模型对该方法进行了检验。与同类工作相比,得到了较好的结果。该方法可以作为处理蛋白质折叠和逆折叠的统一框架。

关 键 词：蛋白质设计 相对熵 非格子模型 Boltzmann分布搜索序列空间 蛋白质逆折叠 优化方法 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学]