基于格子模型的蛋白质设计方法  

A Protein Design Procedure Based on The Lattice Model

作　　者：刘赟[1] 王存新[1] 王宝翰[2] 陈慰祖[1] 

机构地区：[1]北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京100022 [2]中国科学院生物物理研究所,北京100101

出　　处：《生物化学与生物物理进展》2004年第2期172-176,共5页Progress In Biochemistry and Biophysics

基　　金：国家自然科学基金 ( 10 1740 0 5 ;3 0 170 2 3 0 );北京市自然科学基金 ( 5 0 3 2 0 0 2 )资助项目

摘　　要：　提出一个简单有效的蛋白质设计方法 ,这一方法完全基于物理学原理 .与同类工作相比 ,该方法在很大程度上可节省对序列空间进行的搜索 ,是对同类工作的简化与发展 .对三个平面格子模型进行的检验表明该方法是成功的 .A new simple and effective approach completely based on the physical theory is proposed for protein design. Compared with the similar works, the algorithm saves a vast deal of trouble in exploring sequence space. The method is an improvement over previous works. The design procedure was tested on three lattice models in two dimensions and the successful results have been obtained. The method can be readily implemented for three dimensional off lattice models of real proteins.

关 键 词：蛋白质 设计方法 蛋白质逆折叠 格子模型 非格子模型 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学] Q615