刘赟

作品数：5被引量：4H指数：1
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供职机构：北京工业大学生命科学与生物工程学院更多>>
发文主题：蛋白质设计方法蛋白质设计相对熵结构类型更多>>
发文领域：生物学理学更多>>
发文期刊：《生物化学与生物物理进展》《北京工业大学学报》《数学物理学报（A辑）》《科学通报》更多>>
所获基金：北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
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四种结构类型的蛋白质设计方法被引量：1
《生物物理学报》2004年第4期307-314,共8页刘赟 王屹华 王宝翰 王存新 陈慰祖 
国家自然科学基金项目(10174005;30170230);北京市自然科学基金项目(5032002)
给出了以疏水-亲水模型为基础的蛋白质设计方法,该方法以物理学原理为基础,以相对熵作为优化的目标函数。对四种不同结构类型的天然结构的真实蛋白质进行了检测,分析了影响检测成功率的主要因素,结果表明,该方法是普适的,可用于对不同...
关键词：蛋白质设计 蛋白质逆折叠 结构类型 非格子模型 
基于格子模型的蛋白质设计方法被引量：3
《生物化学与生物物理进展》2004年第2期172-176,共5页刘赟 王存新 王宝翰 陈慰祖 
国家自然科学基金 ( 10 1740 0 5 ;3 0 170 2 3 0 );北京市自然科学基金 ( 5 0 3 2 0 0 2 )资助项目
　提出一个简单有效的蛋白质设计方法 ,这一方法完全基于物理学原理 .与同类工作相比 ,该方法在很大程度上可节省对序列空间进行的搜索 ,是对同类工作的简化与发展 .对三个平面格子模型进行的检验表明该方法是成功的 .
关键词：蛋白质 设计方法 蛋白质逆折叠 格子模型 非格子模型 
位形空间非定域Ward恒等式被引量：1
《数学物理学报（A辑）》2004年第1期58-62,共5页刘赟 李瑞洁 李子平 
从 Faddeev- Popov( FP)方法对规范理论给出的位形空间生成泛函出发 ,导出了位形空间非定域变换下的 Ward恒等式 .应用于非 Abel Chern- Simons( CS)理论 ,得到了 CS规范场 -鬼场正规顶角间的 Ward恒等 ,并把此结果与文献 [1 ]做了对比 。
关键词：WARD恒等式 位形空间生成泛函 Chern—Simons理论 
基于相对熵的蛋白质设计方法的普遍近似
《科学通报》2004年第2期135-139,共5页王屹华 王宝翰 刘赟 陈慰祖 王存新 
发展了最近提出的一种基于相对熵原理的蛋白质设计方法.将该方法从必须满足特定的条件才能适用,推广到普遍适用.研究表明,扩展前的方法可被看作扩展后方法的特例,扩展后的采用普遍近似的蛋白质设计方法更利于蛋白质设计的研究,使基于相...
关键词：相对熵 蛋白质设计 非格子模型 分子生物学 蛋白质三级结构 
非格子模型的蛋白质设计方法
《北京工业大学学报》2004年第1期106-109,共4页刘赟 王存新 王宝翰 陈慰祖 
国家自然科学基金资助项目(10174005);北京市自然科学基金资助项目(5032002).
为了克服双重蒙特卡罗方法用于较大分子体系及非格子模型的困难,提出了一个基于相对熵的蛋白质设计的简单方法.利用非格子模型,以16个处于天然稳定态的真实蛋白质为目标结构进行测试,成功率可达75.9％.与其他利用Monte Carlo方法搜索序...
关键词：蛋白质设计 蛋白质逆折叠 相对熵 
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