国家高技术研究发展计划(2002AA231071)

作品数:14被引量:55H指数:5
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相关作者:孙啸谢建明何洁月陆祖宏胡孔法更多>>
相关机构:东南大学扬州大学南京医科大学更多>>
相关期刊:《中国生物医学工程学报》《计算机应用研究》《电脑知识与技术》《生物物理学报》更多>>
相关主题:WEB本体语言资源描述框架数据库调控元件查询算法更多>>
相关领域:自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
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基于特征的核酸序列数据库搜索系统被引量:1
《中国生物医学工程学报》2006年第6期694-699,共6页焦典 顾珉 傅静 李石法 谢建明 孙啸 
"863"资助项目(2002AA231071);国家自然科学基金资助项目(60121101);江苏省自然科学基金资助项目(BK2002057)。
随着后基因组时代的到来,建立生物数据库并且在其上开发各种分析工具进行数据分析和挖掘,已经成为了生物学研究的一种新方法。目前国际上流行的通过序列比对搜索相似序列的方法主要是针对短的序列,将这样的方法应用于大规模基因组序列...
关键词:基因组 数据库 序列特征 
基于内插马尔可夫模型的Gibbs改进算法识别调控元件
《中国生物医学工程学报》2006年第4期396-399,410,共5页谢雪英 孙啸 谢建明 陆祖宏 
国家自然科学基金资助项目(60121101);"863"计划资助项目(2002AA231071);江苏省自然科学基金资助项目(BK2002057)
不同阶数插值形式的马尔可夫内插模型,可以表示在一个DNA序列中相邻核苷酸之间的前后关系的变化。本研究将内插马尔可夫模型引入Gibbs采样算法,识别基因上游序列中的调控元件。对模拟序列和10组来源于文献的酵母基因序列的测试结果表明...
关键词:内插马尔可夫模型 GIBBS采样 调控元件 基因序列 
本体驱动的半结构化Web生物数据抽取被引量:5
《计算机工程》2006年第5期192-194,共3页成瑜 何洁月 
国家"863"计划基金资助项目(2002AA231071)
提出由本体驱动,并根据文档结构和特征匹配来进行信息定位和信息抽取的方法,并实现了一个用户指导的交互式信息抽取原型系统。有效地解决了信息抽取中涉及的同义词,一词多义等语义问题,以及数据项不完整和排序不固定的问题。
关键词:信息抽取 本体 资源描述框架/Web本体语言 生物数据 
基于频繁序列的新词挖掘算法
《电脑知识与技术》2006年第5期98-99,共2页周俊 孙啸 
863资助项目(编号2002AA231071);江苏省自然科学基金资助项目(编号BK2002057).
生物医学领域信息量的飞速增长,极大地促进了人们的交流和研究,同时也使人们在海量的信息面前无所适从:这就提出了对信息进行分类筛选的需求。词库对于文本分类的结果有着至关重要的作用,只有能实时更新新词的词库才能适应使用的需...
关键词:分词 文本分类 频繁序列 
数据仓库系统中一种改进的维层次聚集Cube存储结构被引量:4
《计算机研究与发展》2005年第8期1362-1368,共7页梁作鹏 胡孔法 董逸生 陈崚 
国家自然科学基金项目(60473012);国家"十五"重大科技攻关基金项目(2003BA614A);国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2002AA231071);江苏省"十五"高科技基金项目(BG2004034;BG2001013)
提出利用Cube中的维层次(dimensionhierarchy)聚集技术来创建高性能的维层次聚集Cube(dimensionhierarchyaggregatecube,DHAC).充分利用DHAC已保存的维层次信息,对Cube中多维数据的查询和更新效率进行了优化,并且支持Cube的上探、下钻...
关键词:数据仓库系统 维层次聚集 CUBE 存储结构 多维联机分析处理 
基于图像投影的基因芯片图像网格定位被引量:9
《生物医学工程学杂志》2005年第4期668-671,共4页胡园园 孙啸 何农跃 汤建新 
863资助项目(2002AA231071);江苏省自然科学基金资助项目(BK2002057)
对基因芯片图像进行网格定位是芯片分析的前提和关键。利用芯片图像在水平方向和竖直方向的投影,可将二维图像分析问题转化为一维信号处理问题。本文对图像的投影信号进行算术平均滤波,然后利用不同参数滤波后投影信号间的灰度偏差进行...
关键词:基因芯片 投影信号 网格定位 局部最小值 图像分析 投影 网格 信号处理 芯片分析 水平方向 
基于本体的生物信息数据源的发现被引量:5
《微机发展》2005年第1期38-40,103,共4页成瑜 何洁月 
国家"八六三"计划基金资助项目(2002AA231071)
随着互联网和生物信息的飞速发展,即时发现新的生物信息数据源来进行研究变得非常重要。传统的基于关键词的搜索引擎由于忽视了关键词本身所含的语义信息而得到较低的查全率和查准率,文中提出了基于本体的生物信息数据源发现的方法。通...
关键词:语义WEB 本体 资源描述框架/Web本体语言 特征短语 基因调控 
跨平台基因表达模式分析软件系统被引量:1
《计算机应用研究》2004年第10期146-148,共3页胡弘 谢建明 汪德正 孙啸 
国家"863"计划资助项目(2002AA231071);江苏省自然科学基金资助项目(BK2002057)
构建了可在不同操作系统平台之间通用的基因表达模式分析软件系统。该软件集成了多种基因表达模式分析算法,并通过模块化设计保持了算法的可扩展性。同时具有原始数据可视化和过滤、多种相似性度量选择、聚类方法选择、表达模式匹配查...
关键词:基因表达模式分析 跨平台 软件系统 
应用多重反转录PCR技术检测病毒性呼吸道感染被引量:6
《南京医科大学学报(自然科学版)》2004年第5期452-454,525,共4页冯东举 周锋 周世新 孙华 马春玲 姚堃 
国家863高科技资助项目(2002AA231071)
目的为了寻求呼吸道感染病毒的快速诊断并指导治疗,建立一种多重反转录PCR体系。方法分别设计针对肠病毒、腺病毒、乙型流感病毒和甲型流感病毒标准株的特异性引物,采用多重反转录PCR检测4种病毒。结果应用此多重反转录PCR系统可以特异...
关键词:多重反转录聚合酶链式反应 肠病毒 腺病毒 甲型流感病毒 乙型流感病毒 
一种基于维层次编码的OLAP聚集查询算法被引量:14
《计算机研究与发展》2004年第4期608-614,共7页胡孔法 董逸生 徐立臻 杨科华 
国家自然科学基金项目 (5 98895 0 4);国家"八六三"高技术研究发展计划基金项目(2 0 0 2AA2 3 10 71);江苏省"九五"重点攻关基金项目(BG980 17 1);江苏省"十五"高科技基金项目(BG2 0 0 10 13 )
联机分析处理 (OLAP)查询往往需在海量数据上进行即席的复杂分组聚集查询 ,在其SQL语句中通常包含多表连接和分组聚集操作 ,因而减少多表连接和压缩关键字 ,以及对查询数据进行有效地分组聚集操作 ,成为ROLAP查询处理的关键问题 提出了...
关键词:OLAP(联机分析处理) 聚集查询 维层次编码 层次前缀 
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