国家高技术研究发展计划(2006AA10Z117)

作品数:7被引量:53H指数:3
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相关作者:姚泉洪熊爱生彭日荷章镇高峰更多>>
相关机构:上海市农业科学院南京农业大学苏州农业职业技术学院扬州大学更多>>
相关期刊:《麦类作物学报》《南京农业大学学报》《中南林业科技大学学报》《果树学报》更多>>
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葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析被引量:3
《上海农业学报》2011年第3期9-15,共7页郑建立 高峰 田永生 高建杰 帅建军 彭日荷 熊爱生 姚泉洪 
863项目(2006AA10Z117和2006AA06Z358);上海市国际合作项目(055407068);上海市优秀学科带头人计划(06XD14017)资助
采用电子克隆(In silico cloning)的方法获得3个葡萄ERF类转录因子VvERF2.1、VvERF2.2、VvERF2.3,利用生物信息学方法对基因推导的氨基酸序列从氨基酸组成、理化性质、进化关系、高级结构和功能等方面进行了预测和分析。结果表明:3个转...
关键词:葡萄 AP2/EREBP 电子克隆 转录因子 生物信息学 
葡萄全基因组SSR分析和数据库构建被引量:19
《南京农业大学学报》2009年第4期28-32,共5页蔡斌 李成慧 姚泉洪 周军 陶建敏 章镇 
上海市科委基础研究重大项目(06DZ19103);国家自然科学基金项目(30670179);国家863计划项目(2006AA06Z358,2006AA10Z117)
利用Perl语言开发了用于探寻基因组SSR的程序SSRFinder,并利用其从法国国家基因测序中心(Genoscope)公布的欧亚种葡萄(Vitis viniferaL.)黑比诺品系PN40024的基因组序列中检索到114 520个SSR。其中含单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四...
关键词:SSR 欧亚种葡萄 基因组 数据库 
八棱海棠中转录因子基因MrDREBA6的克隆及表达分析被引量:13
《果树学报》2009年第6期761-768,共8页付晓燕 彭日荷 章镇 乔玉山 周军 朱波 高峰 田永生 赵伟 熊爱生 姚泉洪 
国家863项目(2006AA10Z117);上海市青年科技启明星跟踪计划(08QH14021);国家和上海市自然科学基金(30670179;07ZR14094;08ZR1417200);国家转基因重大专项(2009ZX08002-011B)
DREB类基因是植物中重要的一类转录因子基因,其编码的产物广泛参与生长发育和各类生理过程。根据拟南芥和水稻DREB类基因序列,设计2个兼并引物,利用RACE法从八棱海棠cDNA文库中扩增出一编码DREB类转录因子的cDNA序列,命名为MrDREBA6。从...
关键词:八棱海棠 转录因子 RACE DREB类 荧光定量PCR 
一个小麦AP2/ERF转录因子家族单独亚族基因的克隆及分析被引量:1
《麦类作物学报》2009年第5期752-759,共8页庄静 陈建民 彭日荷 高峰 朱波 付晓燕 ZHANG Jian 熊爱生 姚泉洪 
国家“863”项目(2006AA10Z117);上海市青年科技启明星跟踪计划项目(08QH14021);上海市自然科学基金项目(08ZR1417200);上海市-Alberta国际合作项目(08540706500);国家转基因重大专项项目(2009ZX08002-011B)
AP2/ERF家族转录因子是植物中重要的一类转录因子,广泛参与植物各类生理过程。为了给该家族转录因子的深入研究提供基础,利用小麦EST数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/UGOrg.cgi?TAXID=4565),以拟南芥AP2/ERF家族转录因子单...
关键词:小麦 AP2/ERF转录因子 基因克隆 
基因组水平上杨树NAC基因家族的初步分析被引量:1
《中南林业科技大学学报》2009年第4期126-131,共6页蔡斌 周军 李成慧 彭日荷 熊爱生 高峰 姚泉洪 章镇 
上海市科委基础研究重大项目(06DZ19103);国家自然科学基金(30670179);国家“863”项目(2006AA06Z358,2006AA10Z117)
利用其他物种的NAC蛋白,构建NAC结构域的位置特异得分矩阵(PSSM).用PSSM搜索整个杨树PopulusL.基因组,获得编码杨树NAC结构域的DNA片段在基因组上的位置信息,然后运用Perl脚本语言从基因组相应位置提取包含基因全长的序列,推测NAC基因...
关键词:分子生物学 NAC 基因家族 杨树 结构域 系谱发生 
甘蓝型油菜‘沪油15'中两个CBF类转录因子的克隆与分析被引量:3
《植物生理学通讯》2008年第6期1106-1112,共7页庄静 朱波 金晓芬 彭日荷 乔玉山 章镇 熊爱生 姚泉洪 
国家“863”项目(2006AA10Z117);上海市自然科学基金(08ZR1417200);上海市青年科技启明星跟踪计划(08QH14021)。
以拟南芥CBF家族转录因子AP2保守域的氨基酸序列为信息探针,搜索油菜UniGene数据库,得到2个UniGene:Bna. 2193和Bna.2260,序列拼接得到2个cDNA序列(BnaCBF-1和BnaCBF-2)。通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜‘沪油15'的DNA和cDNA中克...
关键词:转录因子 CBF 生物信息学 甘蓝型油菜'沪油15’ 
甘蓝型油菜中一类AP2/ERF转录因子的克隆和生物信息学分析被引量:15
《中国生物工程杂志》2008年第5期29-40,共12页庄静 周熙荣 孙超才 管帮超 彭日荷 乔玉山 章镇 高峰 蔡斌 熊爱生 姚泉洪 
国家“863”计划(2006AA10Z117,2006AA06Z358);上海市青年科技启明星和优秀学科带头人计划(06XD14017)资助项目
AP2/ERF转录因子家族是植物中广泛存在的一类转录因子,AP2/ERF这类转录因子主要参与植物的细胞周期、生长发育以及生物和非生物胁迫相关基因的表达调控。由于拟南芥和油菜同属于芸薹属,具有相似的基因信息,利用油菜UniGene数据库,以拟南...
关键词:AP2/ERF转录因子 克隆 生物信息学 甘蓝型油菜 沪油15 
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