福建省科技厅青年人才基金(2008F306010107)

作品数:2被引量:15H指数:2
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多核CPU和GPU加速分子动力学模拟被引量:6
《计算机应用》2011年第3期843-847,共5页林江宏 林锦贤 吕暾 
福建省高校科研专项重点项目(JK2009002);福建省科技厅青年人才基金资助项目(2008F306010107)
在多核中央处理器(CPU)—图形处理器(GPU)异构并行体系结构上,采用OpenMP和计算统一设备架构(CUDA)编程实现了基于AMBER力场的蛋白质分子动力学模拟程序。通过合理地将程序划分为CPU单线程、CPU多线程和GPU多线程执行部分,高效地利用了...
关键词:分子动力学 图形处理器 多核中央处理器 AMBER力场 计算统一设备架构 OPENMP 
LU分解和Laplace算法在GPU上的实现被引量:9
《计算机应用》2011年第3期851-855,共5页陈颖 林锦贤 吕暾 
福建省高校科研专项重点项目(JK2009002);福建省科技厅青年人才基金资助项目(2008F306010107)
随着图形处理器(GPU)性能的大幅度提升以及可编程性的发展,已经有许多算法成功地移植到GPU上。LU分解和Laplace算法是科学计算的核心,但计算量往往很大,由此提出了一种在GPU上加速计算的方法。使用Nvidia公司的统一计算设备架构(CUDA)...
关键词:图形处理器 LU分解 Laplace算法 统一计算设备架构 共享存储器 
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