国家自然科学基金(31160234)

作品数:19被引量:12H指数:2
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相关作者:丰继华胡焕李泽华周晓雯卢英更多>>
相关机构:云南民族大学包头师范学院四川电力设计咨询有限责任公司更多>>
相关期刊:《计算机仿真》《生物物理学》《阴山学刊(自然科学版)》《基因组学与应用生物学》更多>>
相关主题:核小体核小体定位模式生物转录起始位点真核更多>>
相关领域:生物学电气工程农业科学医药卫生更多>>
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基于SCD文件聚类分析自动生成接线图的方法被引量:1
《计算机仿真》2022年第10期84-88,98,共6页范力栋 丰继华 王星宇 
国家自然科学基金(31160234)。
智能变电站配置描述(SCD)文件通常缺少对电气接线拓扑关系的配置,且信息十分抽象,无法直观可视地查看主接线图,给工作人员理解造成困难。提出了一种采用图团体聚类算法自动生成接线图的方法,通过分析SCD文件中所有智能电子设备(IED)之...
关键词:智能变电站配置描述文件 图团体聚类算法 智能电子设备 接线图 自动生成 
基于绝缘密度HiCID算法的染色质接触域边界检测被引量:1
《生物学杂志》2021年第2期105-111,共7页黄月月 丰继华 刘珂 范力栋 
国家自然科学基金(31160234);云南民族大学研究生创新基金项目(2018YJCXS185)。
针对现有基于Hi-C数据的接触域边界检测算法进行改进,提出用绝缘密度统计量来表征接触域边界强度变化的绝缘密度算法(Hi-C insulation density,HiCID)。HiCID算法将网络增强技术嵌入预处理过程对原始Hi-C数据进行降噪,根据绝缘子结合蛋...
关键词:染色质接触域 定向分化 网络增强 绝缘密度算法 绝缘子结合蛋白 
基于染色体三维结构共调控域基因功的分析
《基因组学与应用生物学》2020年第11期5067-5074,共8页黄月月 丰继华 刘珂 牟锦 郭亚茹 
国家自然科学基金(31160234);云南民族大学研究生创新基金项目(2018YJCXS185)共同资助。
真核生物的染色质在细胞核中高度折叠且有序排列,这种三维结构对基因的转录、调控和表达等细胞进程具有重要的生物学意义。本研究基于酵母染色体三维结构模型,用3σ准则筛选高分辨率Hi-C(highthroughput chromosome conformation captur...
关键词:Hi-C数据 染色体三维结构 共调控区域 基因功能 
真核模式生物核小体分布参数模型分析被引量:1
《生物学杂志》2020年第2期37-40,共4页丰继华 郭亚茹 牟锦 黄月月 刘珂 范力栋 
国家自然科学基金(31160234)。
真核生物核小体空间分布影响着遗传信息的传递,是表观遗传和基因工程的研究基础,对其进行数学建模是研究DNA三维结构与基因调控的基本途径,但空间维度建模素来为科学研究的难题。为比较单细胞与多细胞生物基因转录起始位点周围核小体分...
关键词:核小体 真核模式生物 转录起始位点(TSS) 果蝇 酵母 正弦复合模型 
基于希尔伯特-黄变换的核小体定位特征提取
《生物信息学》2019年第4期237-248,共12页刘珂 丰继华 黄月月 郭亚茹 牟锦 
国家自然科学基金(No.31160234)
核小体是染色体折叠的整体结构,它们的空间分布与基因组活动的调节密切相关,是基因工程和表观遗传的重要研究领域。为进一步研究核小体定位特征的物种间差异性,将希尔伯特-黄变换(HHT)引入到酵母和果蝇两个不同物种的定位信号中,从多个...
关键词:核小体 真核模式生物 希尔伯特-黄变换(HHT) 果蝇 酵母 
基于Hi-c数据的酵母染色体三维结构重构
《生物信息学》2019年第3期182-188,共7页丰继华 牟锦 郭亚茹 
国家自然科学基金项目(No.31160234)
通过染色体交互频率数据(Hi-c)来预测染色体三维空间结构是近年表观遗传研究热点。研究表明染色体三维空间结构在生物基因表达、调控等方面起到重要作用,对其进行三维重构是研究细胞代谢过程的基本途径。针对酵母Hi-c数据在不同染色体...
关键词:Hi-c数据 三维结构 梯度上升算法 
基于遗传算法酵母核小体定位性质预测
《生物信息学》2019年第2期95-101,共7页郭亚茹 丰继华 于华峥 牟锦 黄月月 刘珂 
国家自然科学基金项目(31160234)
在DNA序列上,定位模糊的特殊核小体与定位良好的普通核小体同时存在于染色体区域内,但由于二者的化学性质差异不明显,区分较为困难。本文针对实验核小体在真核基因转录起始位点周围的分布规律和保守性建立了一个核小体分布模型,并在前...
关键词:核小体定位 酵母 分布模型 遗传算法 
3种条件下基因功能对核小体定位影响的研究
《基因组学与应用生物学》2017年第12期5143-5150,共8页周晓雯 胡焕 丰继华 李泽华 陈静 于华峥 
国家自然科学基金项目(31160234);云南民族大学研究生创新基金项目(2016YJCXSY13)共同资助
为研究基因功能对核小体定位的影响,本研究对ISW2敲除型、野生型(WT)和富营养培养条件下(YPD)的酵母核小体占位率的实验数据进行聚类、比较、分析后,发现有9种基因功能对核小体的定位产生了显著影响,为今后进一步了解基因功能与核小体...
关键词:核小体定位 基因功能(GO) ISW2 野生型 富营养培养 
人类基因组核小体定位研究进展
《基因组学与应用生物学》2017年第1期222-226,共5页周晓雯 丰继华 李泽华 于华峥 陈静 
国家自然科学基金项目(31160234)资助
近些年来,人类健康和疾病一直都是研究者们关注的焦点,因此表观遗传学研究也成为了研究热门。在对表观遗传学进行研究的过程中,研究者们发现核小体定位、组蛋白修饰和染色质重塑等方面的问题已经成为了表观遗传学研究中的重要研究内容...
关键词:核小体 核小体定位 人类 表观遗传学 
不同转录率下真核模式生物核小体位置研究
《云南民族大学学报(自然科学版)》2016年第1期81-86,共6页魏恨恨 丰继华 胡焕 周晓雯 李泽华 
国家自然科学基金(31160234);云南省应用基础研究计划(2011FB082);省高校重点实验室开放基金(MWK201104);云南民族大学研究生创新基金(2015YJCXY256)
真核生物中核小体的位置在不同转录率基因上是不同的.我们通过对热冲击前后酵母核小体位置实验数据、酵母转录率数据进行统计分析和比较后,发现在压力环境下,敏感上表达基因中的高转录水平基因与敏感下表达基因中低转录水平基因上的核...
关键词:平衡位置 热冲击 转录水平 敏感表达基因 
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