国家自然科学基金(31071461)

作品数:5被引量:24H指数:2
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茎瘤芥BjMYB1两个转录本的克隆与遗传转化研究被引量:1
《四川大学学报(自然科学版)》2016年第4期888-894,共7页王微娜 孙全 江怀仲 杨璨 何晓红 牟军 蔡应繁 
国家自然科学基金(31071461);重庆市自然科学基金(cstc2012jjA80037);重庆市重点科技攻关项目(cstc2011AB1095);重庆市教委项目(KJ130502)
本研究根据茎瘤芥转录组测序筛选获得了一个MYB基因片段.通过RACE的方法,克隆得到了两条长度分别为975bp和864bp的全长序列,分析发现可能为茎瘤芥MYB基因的两种不同选择性拼接形式,并命名为BjMYB1-3和BjMYB1-4.对BjMYB1-3和BjMYB1-4做...
关键词:茎瘤芥 MYB转录因子 亚细胞定位 遗传转化 
黄连基因组勘测与分析被引量:1
《四川大学学报(自然科学版)》2014年第6期1330-1334,共5页孙全 何晓红 牟军 蔡应繁 
国家自然科学基金(31071461);重庆市自然科学基金(cstc2012jjA80037);重庆市教委自然科学基金(KJ130502)
本研究基于下一代测序技术,对黄连基因组进行了勘测,构建了两个插入片段大小分别为200bp和500bp的文库,进行了深度约30X的测序。通过测序获得了54Gb的原始数据,过滤后得到44.8G数据。通过SOAP de nove软件组装后初步获得了contig和Scaff...
关键词:黄连 基因组 测序 分析 
系统发育基因组学研究进展被引量:18
《遗传》2014年第7期669-678,共10页王章群 解增言 蔡应繁 舒坤贤 黄飞飞 
国家自然科学基金项目(编号:31071461);重庆邮电大学博士启动基金项目(编号:A2009-18;A2011-01)资助
系统发育基因组学是利用全基因组数据构建系统发育树的新领域。全基因组数据能有效消除横向基因转移和类群间基因进化速率差异等因素对系统发育树的影响。根据所使用的全基因组数据的类型,可以将系统发育基因组学方法分为以下5类:多基...
关键词:系统发育 系统发育树 系统发育基因组学 基因含量 序列短串 
茎瘤芥AP2/EREBP转录因子基因BjABR1的克隆和表达分析被引量:1
《园艺学报》2014年第1期89-98,共10页向浏欣 夏玉先 蔡应繁 付于银 王小艳 刘吉军 
国家自然科学基金项目(31071461);重庆市科技攻关项目(CSTC,201lAB1095);重庆市自然科学基金项目(CSTC,2011AB1095);重庆市教委科学技术研究项目(CSTC,KJ130510,KJ110506,KJ130509,KJ130502)
以茎瘤芥(Brassica juncea var.tumida Tsen et Lee)‘永安’为材料,通过RACE和RT-PCR技术得到1个AP2/EREBP转录因子基因的cDNA全长序列和基因组DNA(gDNA)序列,该基因与拟南芥AtABR1基因的氨基酸序列相似性高达72%,因此命名为BjABR1(Gen...
关键词:BjABR1 茎瘤芥 基因克隆 表达分析 转录因子 
茎瘤芥根和茎组织转录组比较分析被引量:3
《四川大学学报(自然科学版)》2013年第5期1090-1096,共7页孙全 蔡应繁 何晓红 曾鑫 江怀仲 王微娜 
国家自然科学基金(31071461);重庆市重点科技攻关项目(cstc 2011AB1095);重庆市自然科学基金(cstc2012jjA80037;cstc2009BA1088);重庆市教委项目(KJ130502)
茎瘤芥是十字花科芸薹属植物的变种.本研究在前期的转录组测序和数字基因表达谱(DGE)测序的基础上进一步对榨菜的根组织进行了测序和分析.通过高通量RNA-Seq测序我们获得了高质量的数字基因表达谱数据超过一千万条,其中有约71%能比对到...
关键词:茎瘤芥 转录组测序 数字基因表达谱 根组织 茎组织 差异表达分析 
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