MRNA-SEQ

作品数:9被引量:19H指数:3
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相关领域:农业科学生物学更多>>
相关作者:李志军罗来鑫李健强王彦芹许道军更多>>
相关机构:华南农业大学中国科学院遵义医科大学新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室更多>>
相关期刊:《中国药理学通报》《湖北师范大学学报(自然科学版)》《植物生理学报》《Neural Regeneration Research》更多>>
相关基金:国家自然科学基金新疆生产建设兵团科技计划项目湖南省研究生科研创新项目黑龙江省自然科学基金更多>>
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白藜芦醇靶向FLG抑制甲状腺癌细胞增殖、侵袭及迁移
《中国医院药学杂志》2024年第22期2606-2611,2627,共7页刘诗韵 刘仁炎 明庭文 刘经健 王珊 杨洋 陈琴华 朱军 
十堰市科技局项目(编号:22Y90);深圳市‘医疗卫生三名工程’项目(编号:SZZYSM202106004);中国医药教育协会“聚火优才”全国药学服务科研项目(编号:CMEAPC2023029)。
目的:探讨白藜芦醇(resveratrol,Res)对甲状腺癌细胞的作用,分析作用靶点及信号通路。方法:CCK-8法检测Res对甲状腺癌细胞TPC-1、FTC-133、BC-PAP存活率的影响,选择对Res耐受度最低的TPC-1细胞进行克隆试验、划痕试验、Transwell试验,检...
关键词:mRNA-seq分析 白藜芦醇 甲状腺癌 FLG p53信号通路 
Forebrain excitatory neuron-specific loss of Brpf1 attenuates excitatory synaptic transmission and impairs spatial and fear memory被引量:4
《Neural Regeneration Research》2024年第5期1133-1141,共9页Baicheng Zhao Hang Zhang Ying Liu Gaoyu Zu Yuxiao Zhang Jiayi Hu Shuai Liu Linya You 
supported by the National Natural Science Foundation of China,No. 81771228;Shanghai Association of Science and Technology,Nos. 22WZ2501700 and 23WZ2504500 (all to LY)
Bromodomain and plant homeodomain(PHD)finger containing protein 1(Brpf1)is an activator and scaffold protein of a multiunit complex that includes other components involving lysine acetyltransferase(KAT)6A/6B/7.Brpf1,K...
关键词:behavioral test Brpf1 CAMKIIa-Cre intellectual disability miniature excitatory postsynaptic current MRNA-SEQ 
基于mRNA-seq数据筛选Mn2+调控小鼠巨噬细胞的差异表达基因
《海军军医大学学报》2023年第5期589-594,共6页吴双双 陈晶 王云成 马一瑄 魏书宇 刘鸿雁 董亚尊 王北艳 崔玉东 马金柱 
黑龙江省自然科学基金联合引导项目(LH2019C047);大庆市指导性科技项目(zd-2020-62);留学归国科研启动基金计划(ZRCLG201905);黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目(YJSCX2021-Y104);大学生创新创业训练计划(202110223005,202110223007)。
目的对Mn^(2+)调控的小鼠巨噬细胞mRNA进行测序和生物信息学分析,筛选出差异表达的基因并分析其生物学功能,探究Mn^(2+)对小鼠巨噬细胞的调控作用。方法采用MnCl2和NaCl分别处理小鼠腹腔巨噬细胞24 h,利用m RNA-seq方法筛选出Mn^(2+)调...
关键词:mRNA测序 巨噬细胞  免疫调节 差异表达基因 
利用mRNA-seq和Ribo-seq技术研究低氧条件下SW620细胞的基因表达特征
《湖北师范大学学报(自然科学版)》2021年第4期30-37,共8页梅勇 梁绮华 邓载安 汪劲松 
深圳技术大学校企合作项目(编号:2019010802002)。
低氧是结直肠癌肿瘤组织的重要特征和结直肠癌预后不良的重要因素。然而,低氧如何调控直肠癌细胞的基因表达机制仍待深入分析。通过转录组学和翻译组学联合分析揭示了低氧条件下基因表达特征。首先利用化合物CoCl 2处理SW620细胞成功模...
关键词:SW620 低氧 HIF1-α MRNA-SEQ Ribo-seq 
基于mRNA-Seq筛选贵州白山羊抗捻转血矛线虫病相关下调表达基因的研究
《黑龙江畜牧兽医》2021年第11期1-5,共5页吴震洋 付玉华 安清明 孟金柱 赵园园 王大会 冉辉 李丽 
国家自然科学基金项目(31702097);贵州省科技厅联合基金项目(黔科合LH字[2016]7311号);贵州省教育厅创新群体重大项目(黔教合KY字[2016]052号);贵州省普通高等学校科技拔尖人才支持计划项目(黔教合KY字[2017]089)。
为了研究贵州白山羊抗捻转血矛线虫病的抗病机理并挖掘相关重要调控因子,试验采用转录组测序的方法对自然感染捻转血矛线虫的贵州白山羊血液进行研究,利用生物信息学方法分析试验组和对照组血液中差异表达基因并构建相关的基因调控通路...
关键词:捻转血矛线虫 转录组测序 差异表达基因 贵州白山羊 免疫应答 线粒体基因 
基于mRNA-Seq技术分析猪瘟兔化弱毒株感染家兔后脾脏转录组学变化被引量:1
《黑龙江畜牧兽医》2021年第7期6-13,共8页邓玲聪 廖青 邓吉平 纪佳雨 袁露露 许道军 
国家自然科学基金项目(31201968);2019年湖南省研究生科技创新项目(CX20190510)。
为了探究猪瘟兔化弱毒株(Chinese strain, C株)在家兔体内的病毒清除机制,试验以新西兰兔为材料,适应性喂养7 d后随机分为3组,即1个对照组和2个试验组,每组6只。2个试验组家兔分别在感染C株后第5天和第9天耳缘静脉注射空气处死,取出脾脏...
关键词:猪瘟兔化弱毒株 脾脏 MRNA-SEQ 转录组分析 GO功能富集分析 KEGG信号通路分析 
FH/Wjd大鼠与SD大鼠焦虑易感性比较被引量:3
《中国药理学通报》2020年第5期722-726,共5页熊庭旺 吴芹 刘杰 刘波 徐云燕 王丽娜 张玮 张成宸 石京山 
国家自然科学基金资助项目(No 81473201,81773739);贵州省教育厅石京山药理学导师工作室[No GZS-2016(7)]。
目的以SD大鼠为对照,观察FH/Wjd大鼠是否具有焦虑易感性。方法高架十字迷宫、旷场实验检测SD大鼠、FH/Wjd大鼠焦虑行为;高效液相色谱电化学技术检测皮层DA、5-HT及其代谢产物的含量,并计算DA、5-HT的代谢率;ELISA检测皮层COMT、MAO活性...
关键词:FH/Wjd大鼠 SD大鼠 焦虑 多巴胺 5-羟色胺 HPA轴 COMT MRNA-SEQ 
Hunt for the tipping point during endocrine resistance process in breast cancer by dynamic network biomarkers被引量:9
《Journal of Molecular Cell Biology》2019年第8期649-664,共16页Rui Liu Jinzeng Wang Masao Ukai Ki Sewon Pei Chen Yutaka Suzuki Haiyun Wang Kazuyuki Aihara Mariko Okada-Hatakeyama Luonan Chen 
This work was supported by grants from the National Key R&D Program of China (2017YFA0505500);Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Sciences (XDBl3040700);the National Natural Science Foundation of China (11771152,91529303,31771476,31571363,31771469,91530320,61134013,81573023,81501203,and 11326035);Pearl River Science and Technology Nova Program of Guangzhou (201610010029);FISRT,Aihara Innovative Mathematical Modeling Project from Cabinet Office,Japan;Fundamental Research Funds for the Central Universities (2017ZD095);JSPS KAKENHI (15H05707);Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (3901) and SPS KAKENHI (15KT0084,17H06299,17H06302,and 18H04031);RIKEN Epigenome and Single Cell Project Grants to M.O.-H.This work was performed in part under the International Cooperative Research Program of Institute for Protein Research,Osaka University (ICRa-17-01 to L.C.and M.O.-H.).
Acquired drug resistance is the major reason why patients fail to respond to cancer therapies.It is a challenging task to deter.mine the tipping point of endocrine resistance and detect the associated molecules.Derive...
关键词:drug resistance breast cancer TIPPING POINT dynamic NETWORK biomarker (DNB) molecular NETWORK MRNA-SEQ 
基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析被引量:2
《植物生理学报》2018年第5期879-885,共7页王彦芹 沈李丽 罗来鑫 李健强 李志军 
新疆生产建设兵团科技计划项目(2012BB045);国家自然科学基金(31460071和31660085)~~
以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料,利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的m RNA-Seq测序结果进行分析。结果表明,花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个,下调表达...
关键词:沙漠植物 花花柴 干旱胁迫 MRNA-SEQ 耐旱相关基因 
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