生物合成基因簇

作品数：182被引量：366H指数：9
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微生物天然产物生物及化学信息学最新进展
《中国抗生素杂志》2022年第7期625-630,共6页王梦源 常珊珊 解云英 
国家自然基金面上项目(No.81973219);国家自然基金青年项目(No.82104047);中国医学科学院医学与健康科技创新工程项目(No.2021-I2M-1-028)。
微生物天然产物一直是药物开发的重要源泉,而且目前仍是新结构天然产物的重要来源。但随着微生物天然产物基数的增加,重复发现已经成为制约其发展的主要因素,而基于生物信息学和化学信息学建立起来的基因组挖掘技术是解决这一问题的关...
关键词：微生物天然产物 生物信息学 化学信息学 生物合成基因簇 
锡林郭勒盟高原盐湖放线菌资源勘探及抗菌活性筛选被引量：2
《中国抗生素杂志》2022年第5期443-452,共10页赵思捷 王春苗 王聪聪 李甲 郑文 张璐 岳泽惠 李小俊 
国家自然科学基金(No.81703476);河北省自然科学基金(No.C2017405031);河北省教育厅省属高校基本科研业务费研究项目(No.JYT2020001,No.JYT2021010);河北省大学生创新创业训练计划项目(No.S202110092025)。
目的探究锡林郭勒盟高原盐湖放线菌的多样性、新颖性及抗菌活性,为新型抗菌活性产物的发掘储备菌种资源。方法采用20种分离培养基,以平板涂布法分离放线菌;依据16S rRNA基因的同源性对菌株进行分子鉴定;PCR检测代表菌株的Ⅰ型聚酮合酶(P...
关键词：盐湖 放线菌 多样性 抗菌活性 生物合成基因簇 
利普斯他汀高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA的全基因组测序与分析被引量：1
《中国抗生素杂志》2022年第1期28-34,共7页李辉 方志锴 郭霞凌 
湖南省制造强省专项(湘财企指[2018]64号);福建省公益类科研院所专项(No.2020R10050011)。
目的解析利普斯他汀(lipstatin)高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA(S.toxytricini AP617-N12CA)的基因组序列信息,为深入研究该菌株高产lipstatin的分子机理与调控机制奠定基础。方法联合应用三代单分子测序技术和二代高通量测序技术对AP...
关键词：毒三素链霉菌 利普斯他汀 全基因组测序 基因组完成图 线型质粒 生物合成基因簇 
一株红树林链霉菌所产抑菌活性化合物的分离及其生物合成基因簇的研究被引量：7
《中国抗生素杂志》2021年第12期1090-1101,共12页黄媛林 潘信利 陆璐 李喆 李菲 赵静 黄庶识 胡文进 
广西科学院基本业务费项目(No.2018YBJ303和No.2019YBJ101);广西海洋天然产物与组合生物合成化学重点实验室运行费项目(No.17-259-74);广西青年科学基金项目(No.2018GXNSFBA050021);广西科技计划科技基地和人才专项项目(No.AD17129019)。
目的分离鉴定一株红树林来源具有拮抗真菌活性的链霉菌MCCG 2008,分析其对植物病原真菌香蕉尖孢镰刀菌热带4号小种(Fusarium oxysporum f.sp.cubense tropical race 4)、苹果链格孢菌(Alternaria alstroemeriae)、珍珠李葡萄座腔菌(Botr...
关键词：红树林 微小链霉菌 植物病原真菌 放线菌素D 生物合成基因簇 
链霉菌沉默生物合成基因簇调控的研究进展被引量：3
《中国抗生素杂志》2020年第12期1201-1207,共7页陈瑞琦 梁冬梅 刘家亨 乔建军 财音青格乐 
国家重点研发计划资助项目(No.2017YFD0201400)。
本文以天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)中黄色色素coelimycin生物合成调控及开发策略的研究进展为代表,介绍了链霉菌中沉默生物合成基因簇调控激活的新进展,为链霉菌天然产物基因簇的挖掘和新次级代谢产物的发现提供研究思路。
关键词：链霉菌 次级代谢 沉默生物合成基因簇 黄色色素coelimycin 转录调控 
海洋青铜小单孢菌FIM 02-523全基因组测序及分析被引量：1
《中国抗生素杂志》2018年第11期1364-1370,共7页方志锴 江红 林风 连云阳 
国家"十三五"重大新药创制项目(No.2018ZX09711001-007-007和No.2018ZX09721001-002-005);国家重点研发计划项目(No.2018YFC0311001)
青铜小单孢菌(Micromonospora chalcea, M. chalcea)FIM 02-523能够合成对乏氧肿瘤细胞、艰难梭菌等具有活性的环脂肽类化合物rakicidins。利用Illumina HiSeq高通量测序平台,本研究首次对M. chalcea FIM 02-523进行全基因组测序,得到...
关键词：M.chalcea FIM 02-523 全基因组测序 生物合成基因簇 Rakicidins 生物合成途径 
Albaflavenone和strepsesquitriol生物合成基因簇在链霉菌SR107菌株中的异源表达揭示二者有共同的生物合成前体epi-isozizaene（英文）
《中国抗生素杂志》2017年第2期98-106,共9页周媛 李善仁 赵贵石 朱敬 鲁春华 沈月毛 
中国博士后科学基金(No.2014M561915);山东大学自主创新基金(No.2014JC027)
三环倍半萜albaflavenone和strepsesquitriol的结构相似,但是其亚甲基桥的位置不同。在链霉菌Streptomyces sp.SR107菌株中,异源表达两个双基因基因簇scp和wcp,均产生同一个化合物4β,5β-epoxy-2-epi-zizaan-6β-ol(4),表明albaflaveno...
关键词：倍半萜 Albaflavenone Strepsesquitriol Epi-isozizaene合酶 
河南神仙洞放线菌资源勘探及抗菌活性筛选被引量：7
《中国抗生素杂志》2015年第9期641-648,共8页戴素娟 李静 刘少伟 李小俊 蒋忠科 姜蓉 孙承航 
2014年度中央级公益性科研院所基本科研业务专项(IMBF201407);国家自然科学基金(81172963和81321004);十二五"重大新药创制"科技重大专项(2012ZX09301-002-001-018)
目的勘探河南神仙洞放线菌多样性,以期发现药用微生物资源,为新抗生素发现奠定基础。方法采用10种分离培养基,以稀释涂布法分离放线菌;采用16S r RNA基因序列比对分析开展初步鉴别;经液体发酵,发酵液乙酸乙酯萃取,菌丝体丙酮浸提,获得...
关键词：洞穴 放线菌 多样性 生物合成基因簇 生物活性 
Actinoplanes sp.N902-109全基因组序列测定及分析被引量：3
《中国抗生素杂志》2015年第3期171-177,共7页黄鹤 芦现杰 胡海峰 
"十二五"重大仪器专项(2011YQ15007208);上海市科技攻关(12431901102);国药集团基金支持
Actinoplanes sp.N902-109是继吸水链霉菌ATCC292953后分离的第二株能够产生雷帕霉素的放线菌。采用Roche 454GS FLX测序技术和Sanger法PCR测序技术,我们首次完成了Actinoplanes sp.N902-109全基因组序列测定。Actinoplanes sp.N902-10...
关键词：ACTINOPLANES sp.N902-109 基因组测序 雷帕霉素 生物合成基因簇 
东方拟无枝酸菌中ECO-0501生物合成基因簇的筛选及其相关调控基因的初步分析被引量：2
《中国抗生素杂志》2013年第5期327-331,共5页申洋 黄鹤 朱丽 杨晟 戈梅 陈代杰 
国家自然科学基金(NFSC30672558);国家重大新药创制项目(2012ZX090301002-003)
ECO-0501是从东方拟无枝酸菌代谢物中分离到的一种新型线性多烯类化合物,其不但具有良好的抗菌活性,且体内毒性较低,目前处于临床前的开发。本文通过对东方拟无枝酸菌的菌落原位杂交,筛选到4个粘粒克隆NL5B,NL9-3-1,NL3-1C,NL3-3A,可以...
关键词：ECO-0501 东方拟无枝酸菌 菌落原位杂交 调控蛋白 
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