线型质粒

作品数:14被引量:11H指数:2
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相关作者:覃重军杨勇沈美娟代玉梅周敏更多>>
相关机构:中国科学院上海生命科学研究院中国科学院大学福建省微生物研究所中山大学更多>>
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利普斯他汀高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA的全基因组测序与分析被引量:1
《中国抗生素杂志》2022年第1期28-34,共7页李辉 方志锴 郭霞凌 
湖南省制造强省专项(湘财企指[2018]64号);福建省公益类科研院所专项(No.2020R10050011)。
目的解析利普斯他汀(lipstatin)高产菌株毒三素链霉菌AP617-N12CA(S.toxytricini AP617-N12CA)的基因组序列信息,为深入研究该菌株高产lipstatin的分子机理与调控机制奠定基础。方法联合应用三代单分子测序技术和二代高通量测序技术对AP...
关键词:毒三素链霉菌 利普斯他汀 全基因组测序 基因组完成图 线型质粒 生物合成基因簇 
拟诺卡氏菌线型质粒pNPL1的测序和分析被引量:1
《微生物学通报》2014年第7期1376-1381,共6页田新莉 钟莉 覃重军 
国家自然科学基金项目(No.31121001)
【目的】检测和分析稀有放线菌中新的线型质粒。【方法】从植物内生菌中分离链霉菌之外的放线菌菌株,检测、测序和分析线型质粒。【结果】从中草药植物紫花前胡的叶片中分离到一株内生放线菌25L-1-1c,经过16S rRNA基因序列比对属于拟诺...
关键词:拟诺卡氏菌 线型质粒 测序 分析 
链霉菌质粒的复制与进化被引量:2
《微生物学通报》2013年第10期1822-1830,共9页覃重军 
国家自然科学基金项目(No.31121001,31100063,31000042,31200059)
近年来,随着大质粒提取和检测技术的发展,尤其是高通量DNA测序技术的应用,使得链霉菌大的环型质粒和线型质粒的研究取得了较快的进展。相比于研究透彻的细菌Theta型复制的质粒,链霉菌Theta型质粒在复制区的结构、复制蛋白和调控蛋白作...
关键词:链霉菌 线型质粒 环型质粒 噬菌体 复制 进化 
西藏土壤中分离的链霉菌含有丰富的线型和环型质粒
《微生物学通报》2012年第11期1636-1641,共6页代玉梅 杨勇 范云 周敏 沈美娟 钟莉 蔡晓布 覃重军 
国家973计划项目(No.2011CBA00801);国家自然科学基金项目(No.31121001);中国科学院知识创新工程项目(No.KSCX2-EW-G-13)
【目的】研究极端自然环境对链霉菌线型和环型质粒分布的影响。【方法】从西藏高原采集了20份土壤样品,分离和初步鉴定链霉菌,提取和检测质粒DNA。【结果】从中分离到46株链霉菌,其中有23株菌含有1 4个线型质粒,大小在19 650 kb之间,8...
关键词:链霉菌 线型质粒 环型质粒 
五个链霉菌线型质粒端粒的克隆和分析被引量:2
《微生物学报》2010年第8期1008-1013,共6页杨勇 代玉梅 陈振华 覃重军 
国家自然科学基金(30870067;30770045;30325003);国家"863计划"(2007AA021503);中国科学院知识创新工程项目(KSCX2-YW-G-014)~~
本室从西藏采集的土壤样品中分离到了一批链霉菌,利用脉冲电泳确定了其中5株链霉菌含有较小的线型质粒。【目的】克隆、测序和分析5个线型质粒的端粒。【方法】采用改良的"在凝胶中进行DNA碱处理和限制性内切酶酶切"的方法来克隆线型质...
关键词:链霉菌 线型质粒 端粒 复制 
红球菌线型质粒pNSL1的克隆、测序和复制区的鉴定
《微生物学报》2010年第8期1098-1103,共6页朱颖旻 许铭翾 沈美娟 陈振华 覃重军 
国家自然科学基金(30870067;30770045;30325003);国家"863计划"(2007AA021503);中国科学院知识创新工程项目(KSCX2-YW-G-069)~~
从红球菌NS1中检测到两个线型质粒pNSL1和pNSL2。【目的】克隆、测序和分析pNSL1,并鉴定质粒的复制区。【方法】利用脉冲电泳方法从凝胶中回收大量的质粒DNA,进行鸟枪法克隆、测序和拼接,通过生物信息学分析和实验证明质粒的自主复制区...
关键词:红球菌 线型质粒 端粒 复制 
小葱植物内生链霉菌线型质粒pYY8L的端粒与复制区的克隆和鉴定
《微生物学报》2010年第4期452-458,共7页杨勇 钟莉 田新莉 成秋香 陈振华 覃重军 
国家自然科学基金(30870067;30770045;30325003);国家"863计划"(2007AA021503);中国科学院知识创新工程项目(KSCX2-YW-G-014)~~
从小葱植物中分离到一株编号为36R-2-1B的链霉菌菌株,该菌株含有一个约为280kb的线型质粒pYY8L。【目的】克隆、测序和分析pYY8L新的端粒和复制区。【方法】采用改良的"在凝胶中进行DNA碱处理与酶切"的方法来克隆大的线型质粒pYY8L的端...
关键词:链霉菌 线型质粒 端粒 复制 
水稻植物内生链霉菌中线型和环型质粒的检测被引量:1
《微生物学通报》2008年第10期1562-1564,共3页田新莉 周敏 周世宁 覃重军 
国家自然科学基金项目(No.30325003,No.30770045);国家“863计划”(No.2007AA021503);中科院项目(No.KSCX2-YW-G-014)资助
以广东番禺和五山地区水稻植株中分离到的内生链霉菌为对象,调查可能存在的内源质粒。利用脉冲电泳技术从8个菌株中检测到大小在60kb^410kb的线型质粒,其中4个菌株的线型质粒可能有保守的端粒复制基因。该结果与土壤链霉菌中检测到线型...
关键词:水稻内生链霉菌 线型质粒 环型质粒 检测方法 
水稻内生链霉菌中的线型和环型质粒
《微生物学通报》2008年第10期1680-1680,共1页赫荣乔 
植物内生放线菌的研究是一个近年来兴起的学科领域,在进一步探索和开发微生物资源方面,植物内生放线菌逐渐成为相关领域同行的关注热点。本期介绍了“中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所”田新莉、覃重军与“中山大学生命科...
关键词:水稻内生链霉菌 线型质粒 环型质粒 端粒酶tap基因 
游动双孢菌线型质粒pPR2的全序列测定及分析被引量:1
《微生物学报》2008年第10期1295-1300,共6页杨勇 覃重军 
国家自然科学基金(30325003;30770045);"863计划"(2007AA021503);中国科学院知识创新工程项目(KSCX2-YW-G-014)~~
【目的】获得游动双孢菌线型质粒pPR2的全序列,并揭示新型的端粒复制蛋白和可能的中间复制位点。【方法】用分段克隆的方法和序列拼接获得pPR2的全序列,利用软件分析端粒DNA的二级结构和可能的端粒复制蛋白,利用链霉菌原生质体转化的方...
关键词:游动双孢菌 线型质粒 全序列 端粒 复制 
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