生物合成基因簇

作品数：182被引量：366H指数：9
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红树林来源链霉菌中2-羟基苯基噻唑啉衍生物及其生物合成基因簇分析
《热带海洋学报》2025年第2期64-72,共9页刘思妮 白猛 朱义广 罗小卫 高程海 刘永宏 徐新亚 蒋晓东 
广西科技基地和人才专项(桂科AD22035167);广西自然科学基金项目(2023GXNSFBA026139、2023GXNSFAA026313);广东省海洋药物重点实验室开放基金课题项目(LMM2022-4);广西中医药大学博士科研启动基金项目(2021BS022);广西中医药大学《桂派中医药传承创新团队》项目(2022A007);广西中医药大学第三批“岐黄工程”高层次人才团队培育项目(202407);广西八桂学者专项基金项目(05019055)。
文章探讨和分析了海南红树林沉积物来源链霉菌Streptomyces ardesiacus GXIMD 03502的次级代谢产物及相应生物合成基因簇。通过比对16S rDNA序列信息对菌株进行初步鉴定。综合运用多种色谱分离技术分离其次级代谢产物,结合波谱数据分析...
关键词：红树林放线菌 链霉菌 2-羟基苯基噻唑啉 生物合成基因簇 
泉州湾红树林根际土壤放线菌的分离鉴定及链霉菌W444次级代谢产物的鉴定
《微生物学报》2025年第2期597-613,共17页张文州 陈琳琳 林水森 林阳君 庄月娥 谢志新 江红 连云阳 骆祝华 彭飞 
泉州市科技计划(2023NS082);泉州医学高等专科学校校级课题重点科技项目(XJK2210A);泉州医学高等专科学校研究型教学项目(XJJK2308);自然资源部第三海洋研究所开放基金(HY202304)。
【目的】从泉州湾2种红树林的根际土壤中分离并鉴定放线菌,进行抗真菌活性初筛以获取目标菌株,并对链霉菌属(Streptomyces)W444的次级代谢产物进行分离与鉴定。【方法】从泉州湾洛阳江采集2种不同红树林植物的根际土壤样品,采用稀释涂...
关键词：泉州湾红树林 放线菌 吲哚类化合物 生物合成基因簇 
环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2全基因组测序及序列分析被引量：1
《微生物学通报》2024年第8期3085-3102,共18页阮文伟 付建红 崔凤真 铁瑞岚 徐国燕 阿依卡买尔·艾克拜尔 
国家自然科学基金(32260226);新疆维吾尔自治区“天山”创新团队计划(2022D14004);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D01A122)。
【背景】环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2是一株中度嗜盐放线菌,其次级代谢产物具有抑制蘑菇酪氨酸酶活性、抑制小鼠黑色素瘤B16细胞内酪氨酸酶活性及黑色素合成的作用。目前S.anulatus 89-2-2基因组序列分析尚未见报道,这限...
关键词：中度嗜盐链霉菌 酪氨酸酶抑制剂 全基因组测序 生物合成基因簇 
链霉菌次级代谢产物生物合成的调控研究进展
《中草药》2024年第14期4917-4929,共13页孟俊华 张少航 鲁曼霞 厉晓 龚婕 王炜 崔培梧 
国家自然科学基金资助项目(81973211/C0033375);湖南中医药大学研究生创新课题(校行研字[2022]20号-87);湖南中医药大学“十四五”重点学科-生物工程学科(校行发规字[2023]2号)。
链霉菌属微生物是生产抗生素的优势菌群,也是一些维生素和酶的重要来源,具有广阔的开发前景;然而,链霉菌代谢网络和调控机制的复杂性,及大量基因簇的沉默限制了其次级代谢产物的高效合成。快速发展的代谢工程技术为人为干预、调控链霉...
关键词：链霉菌 次级代谢产物 代谢调控 生物合成基因簇 非靶向调控 靶向调控 
链霉菌启动子及其应用研究进展
《微生物学通报》2023年第8期3588-3605,共18页董冀欣 周群 罗云孜 
国家重点研发计划(2018YFA0903300);国家自然科学基金(32071426)。
链霉菌天然产物因其显著的生物活性一直是新药开发的重要来源,测序技术的发展揭示了链霉菌强大的生物合成潜力。链霉菌中多数次级代谢生物合成基因簇(biosynthetic geneclusters,BGCs)在常规实验条件下表达水平低甚至不表达,这使得相关...
关键词：链霉菌 启动子 天然产物 生物合成基因簇 
青藏高原戈壁生境中一株链霉菌新种Streptomyces haixigobicum sp.nov.Qhu-G9的多相分类学鉴定及其次级代谢产物的基因组挖掘
《微生物学通报》2023年第5期1872-1886,共15页向信 殷恒霞 樊嘉凯 邓佳文 朱肇宇 邱庆辉 柳宇睿 张本印 
国家自然科学基金(81760633);生态学世界一流学科科技创新项目(2021-stxy-Y2);生物技术一流专业科技创新项目(2022-stxy-B8,2022-stxy-B9,2022-stxy-B22)。
【背景】青藏高原极端生境具有丰富的微生物资源,同时也是微生物药物的重要来源,但是大量微生物新资源尚待开发利用。【目的】对从青藏高原戈壁土壤中分离得到的一株链霉菌Qhu-G9进行多相分类鉴定及次级代谢产物生物合成潜力分析。【方...
关键词：青藏高原 戈壁 链霉菌 多相分类学 生物合成基因簇 
宁夏枸杞根际土壤链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组测序和次级代谢产物分析被引量：1
《中国医药生物技术》2023年第2期99-109,共11页胡运琪 许建韧 沈晓华 林文星 吴秀丽 南泽东 马晓莉 江志波 
国家自然科学基金地区科学基金项目(82160672);北方民族大学研究生创新项目(YCX22156);宁夏自然科学基金优秀青年项目(2022AAC05041)。
目的 分析链霉菌Ⅱ-2-2-2基因序列,挖掘潜在次级代谢能力生物合成基因簇。方法 采用IlluminaHiSeq+PacBio测序技术获得链霉菌Ⅱ-2-2-2的基因组草图序列,经antiSMASH(v6.0.1)平台分析次级代谢产物合成基因簇,采用高效液相色谱-四极杆-飞...
关键词：链霉菌Ⅱ-2-2-2 生物合成基因簇 基因组挖掘 分子网络 次级代谢物 
教酒链霉菌中卡西霉素生物合成基因簇的calU3基因功能分析
《基因组学与应用生物学》2023年第4期418-426,共9页苟丽霞 杨清浅 刘孟欣 汪志军 韩铁生 
国家自然科学基金项目(31700083);河北省自然科学基金项目(H2020209001)共同资助。
卡西霉素(calcimycin)是重要的离子载体抗生素,具有广泛的生物活性,其生物合成基因簇已从教酒链霉菌(Streptomyces chartreusis)NRRL3882的基因组DNA中成功克隆,但其生物合成途径尚未阐明。本研究拟分析卡西霉素生物合成途径中calU3基...
关键词：卡西霉素 生物合成 氧化还原酶 FAD依赖 calU3 
链霉菌沉默基因簇激活在天然产物生物合成中的研究进展被引量：2
《中国计量大学学报》2022年第2期272-280,共9页马正 施越 章金垚 俞晓平 
国家自然科学基金项目(No.31972320);浙江省自然科学基金项目(No.LZ22C140002)。
目的:本文概述了目前激活链霉菌沉默生物合成基因簇的研究进展,并对其应用进行了讨论和展望。方法:基因测序技术揭示链霉菌基因组中蕴含几十个次级代谢产物生物合成基因簇,而这些基因簇在常规培养条件下往往处于“沉默状态”,不表达或...
关键词：链霉菌 沉默生物合成基因簇 异源表达 核糖体工程 报告基因 激活 
福林霉素生物合成基因簇的组装和异源表达被引量：3
《微生物学报》2022年第1期291-304,共14页李兴 韩舒婷 马婧贤 陶美凤 康前进 白林泉 邓子新 
国家重点研发计划(2019YFA0905400);国家自然科学基金(31770034,21661140002,31830104);上海市自然科学基金(19ZR1475600)。
【目的】本研究旨在以来源于林可链霉菌NRRL2936中的nosokomycin B_(2)的生物合成基因簇(noso-BGC)为基础,组装获得完整的福林霉素生物合成基因簇(pho-BGC),再利用异源表达策略,激活pho-BGC的表达并通过底盘宿主的优选实现福林霉素发酵...
关键词：林可链霉菌NRRL2936 福林霉素 链霉菌宿主 异源表达 二级质谱分析 
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