生物信息学方法

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通过生物信息学方法预测慢性脑低灌注的免疫治疗靶点
《生物医学工程学杂志》2025年第2期382-388,395,共8页赵梅 薛艳鹏 田青青 杨赫 蒋晴 于孟凡 陈鑫 
海南省自然科学基金(高层次人项目)(822RC872)。
慢性脑低灌注(CCH)在血管性痴呆(VD)的发生和发展中起着重要作用。近年来的研究表明,脑缺血过程中涉及多阶段的免疫炎症反应,因而脑缺血的免疫治疗逐渐受到关注。本研究旨在通过生物信息学方法,从免疫学的视角确定CCH的潜在免疫治疗靶...
关键词:慢性脑低灌注 免疫治疗 生物信息学 
基于生物信息学方法挖掘调控肾透明细胞癌发生的分子生物标志物
《现代泌尿外科杂志》2025年第3期215-222,共8页郭峰 王晨宇 史振峰 赵建华 樊文龙 艾合买提·卡德尔 倪泽称 
新疆维吾尔自治区自然科学基金面上项目(No.2021D01C189)。
目的采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因(DEGs),并对...
关键词:分子生物学 生物信息学 表观遗传学 差异表达基因 肾透明细胞癌 加权基因共表达网络分析 淋巴细胞胞质蛋白2 
基于生物信息学方法对HDACi治疗黑色素瘤的免疫学机制探讨
《实用手外科杂志》2025年第1期77-81,共5页苏俊 战杰 王思夏 景艺迪 龙友琪 武睿睿 孙鹏 
2019年辽宁省科技厅自然基金知道计划(项目编号:2019-ZD-0330)。
目的利用生物信息学分析方法对基因芯片数据进行分析,筛选出影响黑色素瘤发生发展过程中的核心基因和关键通路,探索其分子机制并发现黑色素瘤潜在生物标志物,为分子诊断、靶向治疗和预后评估提供线索。方法从基因表达数据库(GEO)中筛选...
关键词:黑色素瘤 生物信息学分析 HDACI 免疫学机制 
基于生物信息学方法鉴定抑郁症与帕金森病共同关键基因
《全科医学临床与教育》2025年第2期105-108,137,F0002,F0003,共7页王杰 陈聪聪 王璐茜 
浙江省自然科学基金项目(LQ19H090011)。
目的采用生物信息学方法分析重度抑郁症(MDD)和帕金森病(PD)的基因数据,寻找MDD与PD的共同关键基因。方法从GEO数据库获取MDD与PD的基因数据集,使用GEO2R进行分析筛选出共同差异基因。通过基因本体论、京都基因与基因组百科全书数据库...
关键词:抑郁症 帕金森病 差异基因 通路富集分析 生物信息学分析 
利用生物信息学方法寻找作物中潜在的胞外ATP受体蛋白质
《兰州大学学报(自然科学版)》2025年第1期76-83,共8页桑鹤天 张悦婧 石珍珍 冯汉青 
国家自然科学基金项目(32460074,31870246);甘肃省自然科学基金重点项目(24JRRA124);甘肃省重点研发计划项目(22YF7NA119;23YFNA0022);甘肃省高等学校产业支撑计划项目(2023CYZC-20);甘肃省科技重大专项(22ZD1NA001);甘肃省青年科技基金项目(24JRRA670);西北师范大学新农村发展研究院开放基金;西北师范大学研究生科研资助项目(2021KYZZ01037);西北师范大学优秀博士论文培养资助项目;甘肃省科技计划(优秀博士)资助项目(23JRRA697,23JRRA707)。
为分析作物中的胞外ATP受体蛋白质,通过NCBI数据库获取拟南芥外ATP受体蛋白质L-型凝集素受体样激酶1.9(lecRK-1.9)和L-型凝集素受体样激酶1.5(lecRK-1.5)的氨基酸序列,通过BLAST比对和同源树构建,以油菜和玉米为例,在两种作物中筛选与le...
关键词:生物信息学 胞外ATP受体 蛋白质亲缘分析 
综合生物信息学方法识别精神分裂症状中关键线粒体自噬基因
《昆明医科大学学报》2025年第1期23-35,共13页廉坤 李咏梅 施诚龙 陈怡兰 张磊 杨薇 许秀峰 
云南省精神心理疾病临床医学研究中心(202102AA100058);昆明理工大学医学联合专项(KUSTYX2022002)。
目的利用3D脑类器官的单细胞及外周血转录组数据,结合机器学习,深入分析线粒体自噬基因在精神分裂症(schizophrenia,SCZ)中的作用。方法结合两种机器学习算法,通过外周血RNA测序数据,识别精神分裂症和健康对照组之间表达存在差异的线粒...
关键词:精神分裂症 线粒体自噬 神经元 单细胞测序 机器学习 
基于生物信息学方法对慢性阻塞性肺疾病气道黏膜免疫能力下降相关基因的筛选及验证
《海南医学》2024年第24期3497-3502,共6页杨洋 申思 鲁雪霞 王志霞 张志强 
河南省医学科技攻关计划联合项目(编号:LHGJ20210504)。
目的探索慢性阻塞性肺疾病(COPD)气道黏膜免疫能力下降的相关基因及其作用机制。方法挖掘公共GEO数据库,根据既往发表的健康组人群和COPD人群转录组学测序数据(GEO数据库:GSE239897)发掘可能导致COPD患者气道黏膜免疫能力下降的相关基因...
关键词:慢性阻塞性肺疾病 气道黏膜免疫 生物信息学 神经元凋亡抑制蛋白 核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白4 
基于生物信息学方法对扩张型心肌病患者中衰老相关基因的综合分析
《心脑血管病防治》2024年第10期19-22,36,共5页夏冉冉 徐剑 李蓓 
目的利用生物信息学方法综合分析扩张型心肌病(DCM)患者中衰老相关基因。方法从CellAge数据库提取衰老细胞相关基因,GEO数据库中与DCM相关的数据集GSE19303、GSE17800和GSE42955,然后利用R语言鉴定出GSE19303和GSE17800的差异表达基因...
关键词:扩张型心肌病 细胞衰老相关基因 生物标志物 生物信息学 
基于孟德尔随机化和生物信息学方法鉴定胶质瘤发病关键基因及实验验证
《锦州医科大学学报》2024年第4期1-10,共10页赵茜 冯晓诗 苗野 
辽宁省教育厅高等学校基本科研青年项目,项目编号:JYTQN2023430;锦州市指导性科技计划项目,项目编号:JZ2023B058。
目的鉴定和验证胶质瘤发生发展及预后的相关基因。方法利用孟德尔随机化方法筛选与胶质瘤发生风险相关的蛋白。基于TCGA数据库获取胶质瘤组织与癌旁组织的差异表达基因,整合风险蛋白和差异表达基因,并使用LASSO回归分析进一步筛选关键基...
关键词:胶质瘤 孟德尔随机化 差异表达分析 预后 LGALS3BP 
基于生物信息学方法在肝癌预后基因中鉴定与空气污染相关潜在标志物
《华北理工大学学报(自然科学版)》2024年第2期18-31,40,共15页杨宸 刘松柏 高超旭 武轶杰 王巍杰 
国家自然科学基金面上项目(81970138)。
空气污染是肝细胞癌(HCC)发病的重要原因。本文从癌症基因组图谱(TCGA)数据库、国际肿瘤基因组协作组(ICGC)数据库和CTD数据库下载的三个基因集,得到HCC在发生发展过程中受空气污染影响的共同关联基因。利用DAVID数据库、Metascape在线...
关键词:肝癌 空气污染物 生物信息学 预后分析 
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