转录调控网络

作品数:38被引量:160H指数:6
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多发性硬化症小胶质细胞转录调控网络分析
《上海交通大学学报(医学版)》2025年第1期29-41,共13页蔡蔷薇 孙锋 吴文玉 邵付明 高正良 金盛凯 
目的:通过单细胞核转录组分析,探讨多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)中小胶质细胞在灰质与白质的基因差异性表达及其在疾病进展中的作用,鉴定疾病相关的关键转录调控网络。方法:从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中获...
关键词:多发性硬化症 小胶质细胞 单细胞核转录组 富集分析 转录调控网络 
基于单细胞多组学数据解析结直肠癌动态调控扰动被引量:1
《海南医学》2024年第11期1533-1544,共12页徐琪 禹雷 潘涛 张娅 李永生 
海南医学院国家级自然科学研究项目培育基金重点项目(编号:JBGS202103);海南省自然科学基金青年基金项目(编号:823QN249)。
目的探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点。方法首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验室(EMBL)收...
关键词:结直肠癌 单细胞多组学数据 转录调控网络 细胞分子特征 
癌症中甲基化改变对增强子活性的影响被引量:1
《国际老年医学杂志》2024年第2期193-198,共6页谢云霄 丁娜 
中国博士后科学基金面上资助项目(第69批)。
目的 分析识别癌症中甲基化改变对增强子活性的影响。方法 分别从人类增强子数据库FANTOM5、甲基化DNA结合转录因子数据库MeDReaders及分子特征数据库MSigDB中获取增强子、转录因子结合位点及分子通路数据等信息,识别受甲基化影响的活...
关键词:增强子 甲基化 转录调控网络 功能富集 生存分析 
耗竭T细胞命运决定的分子机制研究新进展
《国际输血及血液学杂志》2023年第6期491-496,共6页沈昱灿 施均 
国家自然科学基金项目(81670120)。
耗竭T细胞是慢性、持续性肿瘤抗原刺激环境下,T细胞分化的"失能"状态。明确耗竭T细胞命运决定过程中的关键分子靶点及信号通路,能够优化抗程序性死亡因子(PD)-1/PD-配体(PD-L)1肿瘤免疫治疗策略,也将推动更持续高效嵌合抗原受体T细胞(CA...
关键词:T淋巴细胞 T细胞耗竭 免疫疗法 异质性 转录调控网络 代谢重编程 
番茄果实叶绿素代谢转录调控网络研究进展被引量:5
《园艺学报》2023年第9期2031-2047,共17页张巧丽 陈笛 宋艳萍 朱鸿亮 罗云波 曲桂芹 
国家重点研发计划课题(2022YFD2100101);国家自然科学基金项目(31972128)。
番茄(Solanum lycopersicum)果实中的叶绿素含量影响包括糖代谢在内的众多代谢过程,进而影响番茄成熟后的品质。叶绿素含量在很大程度上受转录水平调控。在介绍叶绿素合成与降解过程基础上,重点综述了BEL1-LIKE HOMEODOMAIN、MYB和ARF...
关键词:番茄 果实 叶绿素代谢 转录因子 调控机制 靶基因 调控网络 
基于转录组的肝豆状核变性调控网络的构建和分析被引量:1
《生物工程学报》2022年第10期3844-3858,共15页杨晓曦 何松 李潇瑾 周冬虎 伯晓晨 黄坚 
北京市博士后工作经费资助项目(2021-ZZ-012);北京友谊医院科研启动基金资助项目(yyqdkt2020-52)。
本研究旨在利用生物信息学方法构建经铜诱导的ATP7B基因敲除HepG2细胞系的转录调控网络。探讨关键转录因子在肝豆状核变性发生、发展中的潜在作用机制。收集公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中包含野生型、ATP7B基因敲...
关键词:肝豆状核变性 ATP7B基因敲除 差异表达基因 转录调控网络 差异表达转录因子 
基于转录调控网络识别老年期抑郁症的诊断标志物被引量:1
《临床与病理杂志》2022年第8期1952-1960,共9页邓志芳 刘珏 肖晗 高雯琪 
国家自然科学基金(81903592);武汉市临床医学科研项目(WX20C15);武汉市黄鹤英才-优秀青年人才项目。
目的:老年抑郁障碍的自杀和血管性痴呆等风险较高,本研究基于基因转录调控网络,整合并利用生物信息学分析,探索老年期抑郁症(ger iat r ic depression,GD)的诊断生物标志物。方法:从公共数据库Gene Expression Omnibus(GEO)中下载基因...
关键词:转录调控网络 差异表达基因 老年期抑郁症 诊断 
科学家揭示丁香假单胞菌转录调控网络
《农药市场信息》2021年第1期49-50,共2页刘刚 
高通量(SELEX)技术即指数富集的配体系统进化技术(HT-SELEX),利用该技术可以从DNA随机序列库中(含40核昔酸长DNA片段)筛选出特异性与靶物质高度亲和的核酸适体,是严健教授在瑞典学习期间建立起来的一种用作高通量定量分析DNA-蛋白质相...
关键词:丁香假单胞菌 SELEX技术 核酸适体 指数富集的配体系统进化技术 核昔酸 靶物质 随机序列 调控网络 
植物响应高温胁迫的信号转导和转录调控机制研究进展被引量:7
《分子植物育种》2020年第24期8109-8118,共10页王改妮 白万鹏 王锁民 
国家自然科学基金重点项目(31730093);兰州大学中央高校基本科研业务费专项资金(lzujbky-2018-k01)共同资助。
随着温室效应加剧,全球气候变暖,高温灾害性气候已成为世界上许多农业地区面临的严峻挑战,严重抑制农作物生长发育并导致其产量锐减、品质下降。因此培育耐热品种已成为当前作物育种的重要目标,而作物耐热基因的发掘将为耐热新品种的培...
关键词:高温 植物耐热性 热信号转导途径 转录调控网络 热激转录因子 
植物次生细胞壁生物合成的转录调控网络被引量:15
《植物学报》2020年第3期351-368,共18页张雨 赵明洁 张蔚 
国家自然科学基金(31772342)。
植物次生细胞壁包含纤维素、半纤维素和木质素,赋予细胞壁机械强度及疏水性,这种特性对植物直立生长、水分和营养物质运输以及抵御生物和非生物胁迫十分重要。该文总结了调控次生细胞壁生物合成的转录因子及其调控机制,包括NAC转录因子...
关键词:NAC转录因子 MYB转录因子 次生细胞壁 生物合成 调控网络 
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