单倍型分析

作品数：127被引量：297H指数：9
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水稻核心种质耐盐鉴定与分子标记开发应用
《植物遗传资源学报》2025年第3期470-480,I0002-I0013,共23页王世壮 聂亚敏 黄婧芬 张巧玲 郑崇珂 谢先芝 王艳艳 邢梦 陈文熹 陈子易 郑晓明 王文生 杨庆文 乔卫华 
国家重点研发项目(2021YFD1200100);中国农业科学院南繁专项(YYLH2402)。
水稻是盐敏感植物,土壤盐渍化对水稻产量影响巨大。发掘并聚合耐盐基因的优异单倍型,创制耐盐种质,对于水稻耐盐品种选育及我国盐碱地的高效利用都具有重要意义。本研究首先对水稻3K数据库的236份核心种质进行苗期及大田耐盐鉴定,筛选...
关键词：水稻种质资源 耐盐鉴定 单倍型分析 分子标记 
大豆CAX基因家族鉴定及GmCAX13单倍型分析
《大豆科技》2025年第1期8-14,共7页宋臻 张滨烁 王思慧 李浩伟 刘洋 程鹏 周润南 李明阳 王志阳 崔一凡 赵莹 
黑龙江省自然科学基金会(TD2022C003、YQ2022C010);国家重点研发计划(2021YFD1201104-02、2021YFF1001202);国家自然科学基金会(U20A2027、31971899、32272093、32272072)。
阳离子/质子交换器(CAX)参与多种细胞生理功能调控。为探究CAX基因在大豆生长发育过程中的作用,文章通过生物信息学方法对大豆CAX基因家族进行鉴定和表达分析。结果表明,大豆全基因组中共鉴定获得15个GmCAX基因,被分为5个亚家族。共线...
关键词：大豆 CAX基因家族 系统发育分析 表达模式分析 
谷子SiNF-YA亚家族基因的生物信息学分析与抗旱基因挖掘
《河北大学学报(自然科学版)》2025年第1期82-90,共9页王春芳 张霈涵 史慎奎 杨佳怡 王玉芳 祁东梅 
承德市基础研究项目(202305B093);河北民族师范学院青年基金项目(QN2019003)。
为探究谷子(Setaria italica)SiNF-YA亚家族基因的功能,首先,利用多个在线网站对谷子10个SiNF-YA亚家族基因进行了相关的生物信息学分析;其次,利用Ubuntu系统和RStudio软件对谷子SiNF-YA基因进行单倍型分析;最后,通过对转录组数据的分析...
关键词：谷子 SiNF-YA亚家族基因 抗旱 生物信息学分析 单倍型分析 
谷子SiNF-YA1基因的单倍型和表达分析
《江苏农业科学》2025年第1期26-32,共7页王春芳 吕鹏雁 史慎奎 张霈涵 林伟 祁东梅 
承德市基础研究项目(编号:202305B093)。
谷子(Setariaitalica)具有较高的营养价值和较强的抗逆性,而谷子抽穗期是决定农作物品种适应性的重要性状,开展谷子抽穗期相关基因的单倍型变异规律研究,对培育高产高效新品种具有重要意义。NF-Y家族作为一类转录因子,可以与启动子序列...
关键词：谷子 SiNF-YA1基因 单倍型分析 抽穗期 光周期 
水稻短穗小粒突变体spsg的鉴定与基因定位
《浙江师范大学学报（自然科学版）》2024年第4期418-427,共10页王紫瑶 罗会超 刘鹏程 叶亚峰 马伯军 刘斌美 陈析丰 
国家自然科学基金资助项目(32071987,32101697);浙江省自然科学基金资助项目(LQ22C130005,LZ23C130004)。
为研究穗发育相关基因的分子机制,对水稻“武运粳7号”辐射诱变,筛选到1个短穗小粒突变体spsg(short panicle and small grain),调查统计了该突变体的各项农艺性状,对其粒子进行扫描电镜观察,利用图位克隆技术对目的基因进行精细定位、...
关键词：水稻 短穗 小粒 基因定位 单倍型分析 
谷子SiNF-YB亚家族基因的单倍型与功能分析
《河北农业大学学报》2024年第5期28-37,共10页王春芳 祁东梅 张霈涵 林伟 史慎奎 
河北省高等学校科学技术研究项目(ZD2022151);承德市基础研究项目(202305B093).
谷子属于短日照植物,是我国北方重要的杂粮作物,随着对谷子的深入研究,越来越多与逆境相关的转录因子被发现,其中NF-Y家族便是一类可以与启动子中CCAAT-box相结合的转录因子,包括3个亚家族NF-YA、NF-YB、NF-YC。本研究针对谷子SiNF-YB...
关键词：谷子 NF-YB 转录因子 单倍型分析 表达量 
水稻耐冷基因qCTS-9的核苷酸多样性及单倍型分析
《植物遗传资源学报》2024年第10期1748-1755,I0034-I0039,共14页郭玉静 陈祖武 董铮 李小湘 刘文强 郭梁 薛可欣 郑晓明 逄洪波 潘孝武 
湖南省科技创新计划项目(2023NK1010,2021NK1011);国家自然科学基金项目(32341026)~~。
qCTS-9是在多种苗期低温条件下稳定发挥作用的水稻耐冷基因,研究其耐冷优异单倍型及适应性进化模式,有利于为水稻耐冷育种提供基因资源和技术支撑。本研究利用116份栽培稻(Oryza sativa L.)和37份普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.),对...
关键词：水稻 耐冷性 qCTS-9 核苷酸多样性 单倍型 驯化 
谷子抗锈病反应相关MAPKK家族成员的鉴定与分析
《华北农学报》2024年第5期193-203,共11页龚珂珂 张梦雅 李志勇 刘佳 马继芳 董志平 贾小平 白辉 
河北省农林科学院基本科研业务费试点经费包干制项目(HBNKY-BGZ-02);河北省自然科学基金(C2024301092);国家自然科学基金(31872880);国家现代农业产业技术体系专项(CARS-06-14.5-A25)。
丝裂原活化蛋白激酶(MAPKK或MKK)在植物的生长发育与胁迫响应等过程中发挥着重要作用。为了鉴定谷子抗锈病相关的MAPKK基因,为谷子抗锈病机理研究和抗病分子育种提供候选基因,运用生物信息学方法在全基因组水平上鉴定与分析谷子MAPKK基...
关键词：谷子 MAPKK 锈病 Real-time PCR 单倍型分析 
谷子抽穗期基因SiGI的表达与单倍型变异分析被引量：3
《植物遗传资源学报》2024年第9期1552-1564,共13页姚琦 智慧 孟强 袁迪 张彬 刁现民 贾冠清 
国家重点研发计划(2023YFD1200704,2023YFD1200700);国家谷子高粱产业技术体系(CARS06-14.5-A04);中国农业科学院创新工程(01-ICS-07)。
谷子抽穗期是决定品种适应性的关键性状,解析抽穗期关键基因的表达规律及其单倍型变异特点可为提升品种改良效率奠定基础。本研究通过全基因组关联分析,发现了一个与抽穗期紧密相关的关联信号,该信号定位于谷子5号染色体的11062649 bp处...
关键词：全基因组关联分析 单倍型分析 节律性表达 抽穗期 谷子 
野生二粒小麦粒重相关基因GW2的克隆及其单倍型分析
《麦类作物学报》2024年第8期966-974,共9页王利 魏新雨 杨文琪 贾彦哲 李冰冰 吕树作 聂小军 
国家重点研发计划项目(2021YFD1900190)。
野生二粒小麦作为普通小麦A、B基因组供体,具有遗传类型多、变异丰富,以及粒重、粒大、抗病、耐逆等优良特性,一直是小麦遗传改良重要的种质资源和基因库。GW2(grain width 2)基因是调控水稻、小麦等谷类作物籽粒重量和宽度的关键基因,...
关键词：野生二粒小麦 GW2 单倍型 遗传多样性 
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