位点预测

作品数：87被引量：82H指数：5
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基于机器学习的RNA编辑位点预测方法综述
《生物信息学》2019年第1期1-8,共8页冷嘉承 吴凌云 
国家自然科学基金(No.11631014; No.91730301;No.11661141019)
RNA编辑是一个十分重要的生物细胞分子机制。作为转录后修饰的一步,它可以增加蛋白质组学多样性,改变转录产物的稳定性,调节基因表达等。RNA编辑失调会导致各种疾病,包括神经疾病和癌症。在动物中,腺苷到肌苷(A-to-I)的编辑是最普遍的...
关键词：RNA编辑 高通量测序 A-to-I 机器学习 
杨树蛋白质磷酸化位点预测被引量：1
《生物信息学》2015年第3期165-169,共5页高光芹 黄家荣 周俊朝 谢鹏芳 
河南省高等学校重点科研项目
以小黑杨磷酸化蛋白质组为研究对象,用人工神经网络表达丝氨酸、苏氨酸等残基位点的磷酸化与氨基酸序列的结构特征之间的非线性关系,建立了BP人工神经网络模型,并用磷酸化数据对所建模型进行训练和分析,得适宜的结构为21×16∶8∶4,拟...
关键词：小黑杨 磷酸化蛋白质 磷酸化位点 人工神经网络 
基于二层特征筛选的HIV-1蛋白酶特异位点预测被引量：1
《生物信息学》2012年第4期274-279,共6页袁啸尘 钮冰 尹京苑 
上海市优秀青年教师基金(SHU10022);国家自然科学基金(20973108)
在抗艾滋病治疗中,HIV-1蛋白酶抑制剂发挥着重要作用。对于HIV-1蛋白酶裂解作用位点的研究有助于找到新的治疗靶点。为了对HIV-1蛋白酶特异位点进行预测,本研究用氨基酸索引数据库(Amino Acid Index,AAIndex)中的531个氨基酸物理化学性...
关键词：变量筛选 支持向量机 10折交叉验证 预测模型 HIV-1蛋白酶 
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