位点预测

作品数：87被引量：82H指数：5
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序列蛋白质-GDP绑定位点预测被引量：2
《计算机工程与应用》2016年第13期55-59,75,共6页石大宏 何雪 
国家自然科学基金(No.61373062)
正确地识别蛋白质-二磷酸鸟苷(Guanosine Diphosphate,GDP)绑定位点对于蛋白质功能分析和药物设计有非常重要的意义。蛋白质-GDP绑定位点预测是一个典型的不平衡学习问题。直接应用传统的机器学习方法是不合适的,而且会使预测结果偏向...
关键词：蛋白质-GDP绑定预测 位置特异性得分矩阵 稀疏表示 加权下采样 支持向量机 
多特征融合的蛋白质相互作用位点预测
《计算机工程与应用》2009年第16期50-52,59,共4页程家兴 杜秀全 王池社 
国家教育部博士点基金(No.200403057002);安徽大学研究生创新项目(No.20073056);安徽省高校青年基金(No.2007jql140);安徽省高校自然科学研究一般项目(No.KJ2007B066)~~
蛋白质相互作用位点预测为蛋白质功能和药物设计的理解提供重要线索。而蛋白质的各种特征为蛋白质相互作用位点预测提供了大量有用信息,特别是进化信息、残基序列邻近和空间邻近性。不同的蛋白质特征对蛋白质间的相互作用的贡献也不一...
关键词：蛋白质相互作用位点 蛋白质特征 序列谱 残基保守性 残基熵 支持向量机 
Weighted SVM在蛋白质磷酸化位点预测中的应用被引量：10
《计算机工程与应用》2006年第3期155-157,167,共4页赵凌志 刘颖 覃征 
国家自然科学基金资助项目(编号:10371063);国家科技攻关项目(编号:2004BA711A21);国家863高技术研究发展计划资助项目(编号:2003AA412020)
Weighted SVM是标准SVM针对非均衡样本的改进。首次将Weighted SVM用于蛋白质磷酸化位点的预测,在最新版的蛋白质磷酸化数据集PhosphoBase上,取得了目前为止最好的分类精度。k-fold交叉验证和独立测试集实验的结果表明,通过对样本数相...
关键词：WEIGHTED SVM 蛋白质磷酸化 生物信息学 数据挖掘 
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