位置权重矩阵

作品数：21被引量：66H指数：3
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酿酒酵母核小体定位理论模型的体外实验验证被引量：2
《生命科学研究》2014年第1期21-27,共7页王成爱 赵宏宇 邢永强 邵灵利 蔡禄 
国家自然科学基金资助项目(61072129);内蒙古自然科学基金资助项目(2013MS0514)
核小体定位对真核生物基因表达调控发挥着重要作用。前期基于核小体核心及连接区域的k-mer频次分布偏好性,构建了位置权重矩阵算法,并在酿酒酵母基因组内较好地预测了核小体占据率。利用该理论模型,以1 bp碱基为步长、147 bp碱基为窗口...
关键词：酿酒酵母 核小体定位 位置权重矩阵 盐透析法 体外实验 
基于序列特征的人类Pol Ⅱ启动子理论预测
《生命科学研究》2009年第5期403-407,共5页杨科利 许强 
宝鸡文理学院硕士启动项目(08113)
基于已知的人类Pol Ⅱ启动子序列数据,综合选取启动子序列内容和序列信号特征,构建启动子的支持向量机分类器.分别以启动子序列的6-mer频数作为离散源参数构建序列内容特征,同时选取24个位点的3-mer频数作为序列信号特征构建PWM,将所得...
关键词：启动子 离散增量 位置权重矩阵(PWM) 支持向量机(SVM) 
基于碱基关联二联体位置权重矩阵预测酵母转录因子结合位点被引量：3
《生命科学研究》2008年第2期115-120,共6页杨科利 许强 
宝鸡文理学院硕士科研启动项目(ZK0791;ZK0792)
基于已知的酵母转录因子结合位点数据资料,构建转录因子结合位点碱基关联二联体位置权重矩阵,整合碱基关联二联体位置权重矩阵和碱基保守性参量M2i,提出一种新的预测转录因子结合位点的方法(PWMSA).利用self-consistency和cross-validat...
关键词：转录因子结合位点(TFBS) 位置权重矩阵(PWM) 碱基保守性 
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