脉动阵

作品数:124被引量:166H指数:5
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Smith-Waterman算法在脉动阵列上的实现及分析被引量:6
《计算机学报》2004年第1期12-20,共9页汪冬 唐志敏 
国家"九七三"重点基础研究计划 (G19990 3 2 80 0 );国家"八六三"高技术研究发展计划重点课题 (2 0 0 1AA11110 0 );中国科学院知识创新工程重点项目(KGCX1 SW 0 9)资助
Smith Waterman算法是一种经典的序列比对算法 ,在双序列比对的情况下具有比较好的性能 ,但是在大规模的序列比对时 ,其性能并不能令人满意 .脉动式阵列和Smith Waterman算法有比较好的吻合性 .该文通过在龙芯 1号处理器上附加一个脉动...
关键词:SMITH-WATERMAN算法 脉动阵列 序列比对算法 计算机 生物信息学 
脉动阵列算法自动综合的优化策略被引量:3
《计算机学报》1996年第9期661-667,共7页王树义 钱达源 
对于脉动阵列算法的自动综合方法,本文揭示了参数确定法和相关性变换法的本质联系,给出了相关性变换法适用问题类的一个新的高效寻优策略.
关键词:脉动阵列 自动综合 优化策略 计算机算法 
映射循环算法到脉动阵列的一种有效方法
《计算机学报》1994年第10期758-766,共9页王文红 张德富 
国家863高技术基金
本文提出了把任意。维嵌套循环算法映射和划分到2维固定大小的Systolic阵列的一种自动设计方法.由于考虑了数据相关性,运用该方法产生的VLSI算法的执行时间少,而且不会引起时空冲突.因为平面VLSI阵列容易构造,所...
关键词:VLSI 映射循环算法 脉动阵列 
一类脉动阵列算法的正确性与最优性
《计算机学报》1990年第2期81-87,共7页钱达源 李宪廷 
本文以脉动处理定理为基础,给出了一阶递归问题的脉动阵列算法的正确性证明,并证明了最优方案与问题尺寸及目标函数的独立性,从而降低了优化搜索的复杂度。文中提出了两个新的脉动阵列算法,用以阐述理论结果对复杂问题的应用。
关键词:脉动阵列 算法 正确性 最优性 
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