棉花基因组

作品数：24被引量：199H指数：7
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棉花基因组中赤霉素氧化酶基因的鉴定与分析被引量：1
《江苏农业学报》2020年第3期553-560,共8页赵亮 狄佳春 陈旭升 
国家自然科学基金青年科学基金项目(31401429);江苏省自然科学基金面上基金项目(BK20181245)。
根据赤霉素氧化酶氨基酸序列的保守结构域和生物学信息,对棉花2个二倍体野生种(A基因组的亚洲棉和D基因组的雷蒙德氏棉)和2个异源四倍体遗传标准系(陆地棉TM-1和海岛棉H7124)进行了全基因组的查找。结果表明,在2个二倍体野生种的A和D基...
关键词：棉花 赤霉素 赤霉素氧化酶 基因家族 
转GbVe1基因在棉花基因组中的整合与定位分析被引量：2
《棉花学报》2019年第1期1-11,共11页陈天子 凌溪铁 杨郁文 张保龙 
国家重点研发计划(2016YFD0101418)
【目的】明确转GbVe1基因棉花的插入位点序列特征。【方法】Southern杂交筛选低拷贝基因插入的转基因棉花株系,以hiTAIL-PCR(Polymerase chain reaction)获取其T-DNA侧翼序列,然后根据获得的T-DNA侧翼序列设计特异PCR引物,验证插入位点...
关键词：侧翼序列 GbVe1 棉花 插入位点 
棉花基因组封阻DNA制备方法探讨
《中国棉花》2019年第2期12-15,共4页刘玉玲 王聪 刘鹏飞 王元昌 刘方 彭仁海 
河南省科技创新杰出人才(2018JR0009);河南省科技攻关项目(182102110048)
棉花基因组大,重复序列含量高,在荧光原位杂交研究中,需要利用基因组封阻DNA降低背景信号。本试验以棉花基因组DNA为材料,通过煮沸法和超声波法进行处理,探讨棉花基因组封阻DNA的制备方法。结果表明,DNA样品沸水浴70min和80 min时,DNA...
关键词：棉花 封阻DNA 煮沸法 超声波 
棉花基因组中SABATH甲基转移酶基因家族的查找与分析
《江苏农业科学》2018年第17期38-42,共5页赵亮 狄佳春 陈旭升 
国家自然科学基金青年科学基金(编号:31401429);江苏省自然科学基金青年基金(编号:BK20140747);江苏省农业科技自主创新资金[编号:(CX(14)5007)]
甲基化作用广泛存在于生物体内,在许多生物进程中发挥着关键的修饰作用,包括基因和代谢的调控。甲基化由甲基转移酶(methyltransferases,简称MTs)依赖S-腺苷-L-甲硫氨酸(S-adenosine-L-methionine,简称SAM)作为甲基供体催化形成相对应...
关键词：棉花 甲基转移酶 SABATH 基因家族 次生代谢 
棉花基因组结构进化研究进展被引量：5
《基因组学与应用生物学》2017年第3期1090-1095,共6页杨南山 王金朋 王希胤 
华北理工大学研究生创新项目(2016S41)资助
近年来,随着测序技术的发展,棉花多个亚基因组相继被测出,在全基因组水平上对棉花基因组结构与进化就有了新的认识。多倍化在植物进化过程中是普遍存在的,最新的研究表明,棉花在其进化过程中经历了复杂的多倍化过程,也造成了棉花的基因...
关键词：棉花 比较基因组学 全基因组加倍 
利用涡旋混合器对棉花基因组DNA提取方法的优化及SSR技术应用被引量：2
《中国棉花》2016年第5期18-20,共3页赖成霞 高丽娟 努斯热提.吾斯曼 李春平 刘忠山 张大伟 孔杰 
新疆科技厅高技术项目(201211107);新疆农业科学院三院基金--新疆棉花育种与监测中心基础设施条件建设(2014);新疆维吾尔自治区公益性科研院所基本科研业务经费项目(KY2013056)
为获得80个陆海杂交高代自交系材料的幼嫩叶片的高纯度、高完整性的DNA,应用涡旋混合器对传统的棉花基因组DNA的提取过程进行改进。结果显示:获得的棉花基因组DNA具有高完整性、高纯度的特性,SSR分子标记结果明显。利用涡旋混合器能有...
关键词：涡旋混合器 棉花 DNA提取 SSR 
棉花基因组数据库中CPS&KS基因的查找与分析
《江苏农业学报》2016年第1期27-33,共7页赵亮 狄佳春 陈旭升 
国家青年科学基金项目(31401429);江苏省青年基金项目(BK20140747)
为了探究赤霉素合成关键酶CPS&KS类基因在棉花中的分布情况,分析了已发表的拟南芥CPS&KS基因编码的蛋白质氨基酸序列,发现该类基因存在2个保守结构域,Terpene_synth和Terpene_synth_C,其在Pfam数据库中的种子文件分别为PF01397和PF0393...
关键词：棉花 赤霉素合成酶 柯巴基焦磷酸合酶(CPS) 内根-贝壳杉烯合酶(KS) 
棉属四倍体AD_1与二倍体A_2、D_5基因组的同源SSR分析被引量：1
《遗传》2015年第2期192-203,共12页孙高飞 何守朴 潘兆娥 杜雄明 
"十二五"国家支撑计划项目(编号:2013BAD01B03)和科技部;财政部国家科技基础条件平台项目(编号:2012-014)资助
SSRs(Simple sequence repeats)是一类广泛存在于动植物基因组的DNA短串联重复序列,是重要的基因组分子标记。比较不同基因组同源SSR的差异,有利于了解相近物种间的进化过程。文章使用雷蒙德氏棉基因组(D5)、亚洲棉基因组(A2)全基因组...
关键词：SSR 棉花基因组 同源SSR 进化 
NaCl和Na_2CO_3对不同棉花基因组的DNA甲基化影响被引量：14
《中国农业科学》2014年第16期3132-3142,共11页陆许可 王德龙 阴祖军 王俊娟 樊伟丽 王帅 赵小洁 张天豹 叶武威 
国家863计划项目(2013AA102601)
【目的】探究不同盐胁迫后的棉花基因组DNA甲基化变化情况,并比较分析叶片和根部DNA甲基化变化差异,进而探究DNA甲基化与棉花耐盐性之间的关系。【方法】以陆地棉耐盐品种中9806和盐敏感品种中S9612为试验材料,分别用NaCl和Na2CO3(浓度...
关键词：棉花 DNA甲基化 MSAP 盐胁迫 实时荧光定量PCR 
适用于PCR的棉花基因组DNA快速、批量制备方法的探讨被引量：1
《中国棉花》2014年第8期10-14,共5页张大伟 李海燕 张道远 杨红兰 李春平 刘忠山 徐建辉 
"十二五"国家863计划"分子聚合培育早熟;多抗棉花新品种"(2012AA10);棉花新品种"新陆早50号"高产优质栽培技术集成与示范推广(2012GB2G400496)
通过筛选和优化传统CTAB-SDS法的操作步骤,建立了一种快速、批量提取棉花基因组DNA的方法。结果表明:利用该方法提取的DNA含量高,能够满足PCR的要求。初步解决了棉花基因组DNA提取步骤复杂、耗时耗力的问题,为转基因作物育种领域的分子...
关键词：棉花 DNA提取 PCR 批量制备 
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