插入位点

作品数:112被引量:239H指数:8
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利用基因组测序技术鉴定家蚕转基因位点方法的建立
《西南大学学报(自然科学版)》2025年第4期113-122,共10页周昂 蒋晶晶 左伟东 陈欣 童晓玲 代方银 李春林 
国家自然科学基金项目(U20A2058,31830094);中央高校基本科研业务费自然科学项目(SWU-KQ22005)。
建立一种基于基因组测序技术高效鉴定家蚕转基因插入位点的方法,并分析测序深度对位点鉴定准确性的影响,从而为家蚕及其他物种利用基因组测序技术开展低成本、高通量的转基因位点鉴定提供参考。首先,采集两份家蚕转基因材料的蛹,进行全...
关键词:家蚕 转基因插入位点 基因组测序 测序深度 转基因鉴定 
ISDT:一种基于高通量测序数据的外源序列插入位点检测工具
《基因组学与应用生物学》2024年第9期1510-1520,共11页张镇 杨芊茹 杜含笑 李雨桐 陆晨琪 姜宁 
国家重点研发计划(2021YFC2501800,2022YFC2009802)资助。
精准识别外源序列插入位点对于转基因研究、基因编辑研究及疾病机制探索等领域至关重要。随着高通量测序技术的快速发展和广泛应用,越来越多的研究者将高通量测序技术应用到插入位点分析研究中来,深入探索外源序列插入事件。基于这样的...
关键词:高通量测序 外源序列 插入位点 精准识别 检测工具 
基于重测序鉴定GbTMEM214基因在陆地棉基因组的插入位点
《棉花学报》2024年第4期285-295,共11页程俊凌 赵亮 徐剑文 刘剑光 徐鹏 徐珍珍 郭琪 王月平 赵君 沈新莲 陈全家 肖松华 
农业生物育种重大项目(2023ZD04039-02-04);国家自然科学基金(31971904,31401727)。
【目的】利用农杆菌介导法获得了转GbTMEM214基因陆地棉品系,旨在明确转基因棉花株系中T-DNA插入位点的序列特征及检测方法,为其生物安全评价提供依据。【方法】基于基因组重测序技术,利用BLASTn将测序数据与陆地棉TM-1基因组序列进行...
关键词:转基因棉花 GbTMEM214 重测序 插入位点 侧翼序列 
血清AIF-1、Bmi-1、MAP19联合诊断宫颈癌的价值分析被引量:1
《疑难病杂志》2024年第8期971-975,共5页王汇博 陈慧君 朱敏 
国家自然科学基金资助项目(82173909)。
目的探究宫颈癌患者血清中同种异体移植物炎性因子1(AIF-1)、B细胞特异性莫洛尼白血病毒插入位点1(Bmi-1)、甘露聚糖结合凝集素相关蛋白19(MAP19)水平变化及对宫颈癌患者的诊断价值。方法选取2023年1—12月武汉大学中南医院妇产科收治...
关键词:宫颈癌 同种异体移植物炎性因子1 B细胞特异性莫洛尼白血病毒插入位点1 甘露聚糖结合凝集素相关蛋白19 诊断 
3D腹腔镜结肠癌根治手术疗效分析及预后评价
《河北北方学院学报(自然科学版)》2024年第4期1-5,共5页梁蕾 张伟 张金江 庞粉萍 苗建军 尚培中 李伟 
张家口市卫生健康和生物医疗专项重点研发计划项目(No.2221120D)。
目的探讨3D腹腔镜结肠癌根治手术疗效及安全性,分析Bmi-1和CDX-2表达与结肠癌临床病理特征及预后的关系。方法对比分析腹腔镜手术与开腹手术2组切口总长度、手术时间、术中失血量、清扫淋巴结数目、术后12 h疼痛评分、肠功能恢复时间及...
关键词:结肠癌 B细胞特异的莫洛氏鼠白血病病毒插入位点1 尾型同源盒转录因子-2 肿瘤转移 预后 免疫组织化学 
B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒插入位点1在头颈部鳞状细胞癌中的研究进展
《癌症进展》2023年第17期1861-1864,共4页刘智权 陈钟 黄天悦 陈璎珞 曾丽萍 
国家级大学生创新创业训练计划项目(202212631002);厦门市医疗卫生指导性项目(3502Z20224ZD1308);厦门医学院教学改革研究项目(XBJG202020020)。
在中国,头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)占全部恶性肿瘤的3%,严重影响患者的生命健康。多数研究显示,B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒插入位点1(BMI1)基因在HNSCC中异常表达,其通过调节肿瘤细胞的干性促进肿瘤的发生发展,是一个具有巨大潜力的...
关键词:头颈部鳞状细胞癌 B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒插入位点1 增殖 上皮-间充质转化 肿瘤干细胞 免疫治疗 
单增李斯特菌前噬菌体的分布及遗传特征分析被引量:1
《疾病监测》2023年第5期529-536,共8页纪顺师 王艳 宋泽萱 毛盼 李玲玲 陈晋妮 刘凌云 孙晖 罗霞 叶长芸 
中国疾病预防控制中心传染病所自主课题(No.2021ZZKT003)。
目的 了解单增李斯特菌基因组中前噬菌体分布状况和基因组特征。方法 自公共数据库GenBank获得275株单增李斯特菌的全基因组序列,运用前噬菌体在线预测软件(PHASTER)对其携带的前噬菌体进行预测。并对预测的完整前噬菌体进行聚类分析、...
关键词:单增李斯特菌 前噬菌体 插入位点 整合酶 
BWEL-SPF鸡基因组内源禽白血病病毒基因插入位点识别和验证
《黑龙江畜牧兽医》2023年第7期15-19,25,共6页王梓一 袁一铭 连玲 
国家自然科学基金项目(U1901206);国家重点研发计划项目(2021YFD1300600);家养动物种质资源库项目(CARS-40)。
为了探究生物信息学软件识别禽白血病病毒E(Avian leukosis virus subgroup E, ALVE)基因插入位点的准确性,试验采用obsERVer流程和位点特异性PCR方法,测定了3只BWEL-SPF鸡全基因组测序数据中的ALVE基因插入位点,并验证了obsERVer流程...
关键词:BWEL-SPF鸡 禽白血病病毒E亚群 obsERVer流程 全基因组重测序数据 插入位点 
非小细胞肺癌组织DCLK1和Bmi-1蛋白表达及其与三维适形放疗效果的相关性研究被引量:5
《现代检验医学杂志》2022年第6期177-182,187,共7页杨开华 周乐源 
无锡市首届“双百”中青年医疗卫生拔尖人才基金(BJ2020053)。
目的探讨非小细胞肺癌(non small cell lung cancer,NSCLC)组织双肾上腺素样激酶1(dou-blecortin-like kinase 1,DCLK1)、B细胞特异性莫洛氏鼠白血病病毒插入位点一(B cell specific moloney leukemia virus insert site-1,Bmi-1)蛋白...
关键词:非小细胞肺癌 双肾上腺素样激酶1 B细胞特异性莫洛氏鼠白血病病毒插入位点一 三维适形放疗 
水稻立枯病原菌尖孢镰孢菌致病力降低T-DNA突变体的筛选与插入位点鉴定被引量:4
《东北农业大学学报》2022年第11期10-18,共9页张俊华 杨松润 彭莉莉 王亮 杨明秀 徐晓凤 倪哲 李培宁 
黑龙江省自然科学基金项目(C2017032);黑龙江省应用技术研究与开发计划项目(GA19B104);国家重点研发计划项目(2018YFD0300105)。
为深入研究水稻立枯病原菌尖孢镰孢菌(Fusarium oxysporum Schelcht)致病分子机理,利用根癌农杆菌介导遗传转化技术构建尖孢镰孢菌突变体库,筛选致病力降低突变体,检测其T-DNA插入数量和位点。结果表明,691个突变体库构建成功,且突变体...
关键词:水稻立枯病 尖孢镰孢菌 T-DNA 致病力 插入位点 
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