内含子

作品数:789被引量:1904H指数:16
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嗜热Ⅱ型内含子Tel3c/4c-RT结构域活性位点分析
《微生物学通报》2022年第8期3049-3061,共13页花登雄 王鑫鑫 陈峥宏 洪伟 汪依航 俞青凤 谷俊莹 崔古贞 
国家自然科学基金(31760318,32160015);贵州省科技计划项目([2019]1441,[2020]1Z067);贵州医科大学培育项目(20NSP0004);大学生创新训练项目(S202010660052)。
【背景】嗜热Ⅱ型内含子是一类由内含子RNA和内含子编码蛋白(intron encoded protein,IEP)组成且在高温条件下能够在染色体上高频移动的反转录转座子,目前已被开发为高效基因打靶工具Thermotargetron,阐明其活性催化位点,对深入研究其...
关键词:大肠杆菌 嗜热Ⅱ型内含子 Thermotargetron Tel3c/4c 内含子编码蛋白 反转录结构域 
嗜热基因打靶系统Thermotargetron构建及其打靶效率检测
《生物技术》2022年第3期276-283,共8页花登雄 管玉祝 鲍江舰 洪伟 陈峥宏 张馨月 王鑫鑫 郑建国 谷俊莹 崔古贞 
国家自然科学基金项目(31760318);贵州省科技计划项目([2019]1441,[2020]1Z067);贵州医科大学培育项目(20NSP0004);大学生创新训练项目(S202010660052)。
[目的]在大肠杆菌中构建基于嗜热Ⅱ型内含子的高效Thermotargetron基因打靶系统,并验证其温度敏感性及打靶效率,为嗜热Ⅱ型内含子功能分析建立快速遗传检测平台。[方法]首先,以大肠杆菌lacZ基因为靶基因,根据嗜热Ⅱ型内含子碱基识别规...
关键词:大肠杆菌 Thermotargetron 嗜热Ⅱ型内含子 LACZ基因 遗传检测平台 
Ⅱ型内含子及其生物技术应用研究进展被引量:1
《生物工程学报》2022年第3期915-924,共10页崔古贞 花登雄 谷俊莹 陈峥宏 
国家自然科学基金(31760318);贵州省科技计划项目([2019]1441,[2018]5779-17)。
型内含子(groupⅡintrons)是一类具有自我剪接功能的核酶,能够通过“归巢”(retrohoming)机制高频插入到DNA靶位点。Ⅱ型内含子对DNA靶位点的识别和剪接具有高度专一性和高效性,这种特性使其在基因工程中具有重要的应用价值。文中首先...
关键词:Ⅱ型内含子 Targetron 基因编辑 生物技术应用 
解纤维梭菌脱水四环素诱导的ClosTron基因打靶系统构建被引量:2
《微生物学通报》2021年第9期2982-2990,共9页崔古贞 花登雄 管玉祝 鲍江舰 张馨月 谷俊莹 陈峥宏 洪伟 
国家自然科学基金(31760318);贵州省科技计划项目([2019]1441,[2018]5779-17,[2020]1Z067)。
【背景】解纤维梭菌是发酵木质纤维素生产乙醇的中温模式菌株,构建可控诱导的基因打靶技术是研究解纤维梭菌遗传调控的重要手段。【目的】在解纤维梭菌中构建脱水四环素诱导的ClosTron基因打靶系统。【方法】首先,分析解纤维梭菌对脱水...
关键词:解纤维梭菌 脱水四环素诱导系统 ClosTron Ⅱ型内含子 
脱水四环素诱导的大肠杆菌Targetron基因打靶系统构建
《现代预防医学》2021年第16期3005-3010,共6页崔古贞 花登雄 陈相好 陈峥宏 管玉祝 谷俊莹 
国家自然科学基金(31760318);贵州省科技计划项目([2019]1441,[2018]5779-17和[2020]1Z067)。
目的在大肠杆菌中构建脱水四环素诱导的Targetron基因打靶系统,为微生物遗传改造提供可控的新型Targetron基因打靶工具。方法首先,分析大肠杆菌对脱水四环素的敏感性,筛选合适的诱导剂浓度。其次,以绿色荧光蛋白为报告基因,构建脱水四...
关键词:大肠杆菌 脱水四环素诱导系统 EGFP Targetron Ⅱ型内含子 
内含子编码蛋白Mg2+结合位点功能分析及验证被引量:3
《生物技术通报》2020年第10期165-172,共8页崔古贞 陈相好 洪伟 张峥嵘 綦廷娜 陈峥宏 
国家自然科学基金项目(31760318,31601012);贵州省科技计划项目(黔科合基础[2018]1132,[2019]1441);贵州医科大学培育项目(黔科合平台人才[2018]5779-17)。
旨为筛选并构建II型内含子编码蛋白Mg2+结合位点突变体,验证该位点突变对II型内含子“归巢”效率的影响。利用生物信息学技术筛选关键位点,利用定点突变技术构建突变体,利用Targetron及蓝白斑计数法验证其“归巢”效率。结果显示,筛选到...
关键词:Ⅱ型内含子 内含子编码蛋白 Mg2+结合位点 Targetron 反转录结构域 
L1.LtrB内含子编码蛋白反转录结构域关键催化位点分析及功能验证被引量:5
《微生物学报》2019年第12期2357-2366,共10页陈相好 张峥嵘 刘芳 陈峥宏 洪伟 綦廷娜 谷俊莹 崔古贞 
国家自然科学基金(31760318,31500078,31560318,31601012);贵州省科技计划项目(黔科合基础[2018]1132,[2019]1441);贵州省教育厅自然科学研究项目(黔教合KY字[2014]216);贵州省研究生科研基金立项项目(11348)~~
【目的】筛选影响Ll.LtrB内含子编码蛋白(Intron encoded protein,IEP)反转录功能的关键催化位点,并获得无反转录活性的IEP突变体。【方法】首先,利用NCBI数据库,通过序列比对及同源建模方法筛选影响IEP反转录功能的关键氨基酸催化位点...
关键词:Ll.LtrB Ⅱ型内含子 内含子编码蛋白 反转录 Targetron 
大肠杆菌Targetron基因打靶载体构建及应用
《贵州医科大学学报》2019年第7期745-750,共6页黄瑾 陈相好 吴晓娟 张峥嵘 谷俊莹 陈峥宏 崔古贞 
国家自然科学基金(31760318,31500078,31560318,31601012);贵州省科技计划项目[黔科合基础(2018)1132];贵州省研究生科研基金立项项目(11348)
目的:构建基于细菌Ⅱ型内含子的Targetron基因打靶载体,并在大肠杆菌中验证其功能。方法:以构建的pSY7载体为基础、以大肠杆菌lacZ基因为例,选择lacZ-1683a和lacZ-1874s位点为靶位点,利用在线设计软件设计打靶引物,通过重叠延伸PCR方法...
关键词:Ⅱ型内含子 打靶载体 大肠杆菌 重叠延伸PCR Targetron基因 
高效严谨型大肠杆菌Targetron基因打靶系统的构建被引量:5
《生物技术通报》2019年第6期213-220,共8页陈相好 谷俊莹 崔古贞 刘芳 王彩霞 陈峥宏 洪伟 蔡梦迪 张峥嵘 綦廷娜 廖永慧 
国家自然科学基金项目(31500078,31560318,31601012,31760318);贵州省科技计划项目(黔科合基础[2018]1132);贵州省教育厅自然科学研究项目(黔教合KY字[2014]216);贵州省研究生科研基金立项项目(11348);贵州省大学生创新创业训练计划项目(201710660022)
构建高效严谨型大肠杆菌Targetron 基因打靶系统。将来源于pET28a 的T7-lac 操纵子与来源于pSY6 的II 型内含子组装构建大肠杆菌IPTG 诱导型Targetron 质粒系统。以lacZ 基因为例,选择lacZ-635s 和lacZ-1063a 两个位点为靶位点,利用构建...
关键词:Targetron II 型内含子 诱导系统 大肠杆菌 LACZ 
黔北麻羊DKK1基因CDS区及部分内含子的多态性与生物信息学分析被引量:1
《西南农业学报》2018年第1期211-216,共6页封竣淇 罗卫星 张依裕 蔡惠芬 罗铮 徐伟 翁吉梅 陈说 
贵州省农业科技攻关项目[黔科合NY字(2015)3010-1];贵州省科技计划项目(子项目)创新载体建设项目"仁怀农业科技园黔北麻羊生态循环示范区建设"(ZJNLT-RH-RHKJJ-002)
【目的】为黔北麻羊种质资源的综合开发利用提供参考。【方法】应用DNA池结合PCR产物直接测序方法检测黔北麻羊DKK1基因CDS区及部分内含子的多态性,应用生物信息学方法对黔北麻羊DKK1基因的蛋白特性进行预测和分析。【结果】在黔北麻羊...
关键词:黔北麻羊 DKK1基因 多态性 生物信息学 
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