分子力学

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基于HSA与GP60/SPARC相互作用力学生物学机制构建药物靶向递送系统及抗肿瘤应用
《医用生物力学》2024年第S01期225-225,共1页孟润 张瑞雅 王磊 周晓荣 王伯初 
国家自然科学基金项目,82172931
目的人血清白蛋白(HSA)能与其受体蛋白(GP60)/结合蛋白(SPARC)相互作用,但其相互作用的分子力学生物学机制目前仍不清楚,这阻碍了以HSA为基础构建药物靶向递送系统。本研究旨在阐明HSA与GP60/SPARC相互作用的分子力学生物学机制,为以HS...
关键词：靶向递送系统 力学生物学 肿瘤治疗效果 生物学机制 疏水相互作用 分子力学 SPARC 有效性评估 
分子阻尼器张力探针在细胞-整合素加载速率研究中的应用
《医用生物力学》2024年第S01期96-96,共1页李潮 刘肖君 王永亮 王贵学 
生物流变科学与技术教育部重点实验室(重庆大学)访问学者基金,CQKLBST-2022-001;国家自然科学基金项目,12032007,31971242
目的整合素作为细胞表面的一种重要受体,其与细胞外基质的相互作用对细胞的黏附、迁移、增殖等生理过程至关重要。然而,目前对整合素在这些过程中的动态行为和力学特性的认识仍然有限。本文将介绍一种基于分子阻尼器的DNA张力探针,通过...
关键词：细胞外基质 整合素 细胞力学 加载速率 表皮细胞 DNA 分子力学 爬行速度 
“点亮”细胞的机械力信号:从亚细胞至单分子
《医用生物力学》2024年第S01期86-86,共1页刘郑 
目的细胞在体内拥挤的环境中不仅通过挤来挤去以获得足够的生存空间,同时,细胞的生命过程也不断地受到挤压、拉伸、弯曲和拉扯细胞外基质(ECM)等过程产生的机械力调控。尽管细胞上每个受体上传递的机械力小得令人难以置信——分布在几p...
关键词：胚胎发育 免疫识别 肿瘤转移 特定蛋白质 分子力学 机械参数 单分子 同步测量 
新冠病毒刺突蛋白力学适应性演化研究
《医用生物力学》2024年第S01期92-93,共2页胡炜 叶杨 张同同 瞿赛思 张勇 李伟 马璐 杜雨棽 娄继忠 李振海 陈伟 无 
国家自然科学基金项目,T2394511,T2394510,92359303,92269101,12272216,32090044,82272300,82102893,12172371,T2394512;浙江省自然科学基金项目,LY23A020002;上海市自然科学基金项目,22ZR1423500;中科院战略性先导科技专项,XDB37020102;浙江省领军型创新创业团队引进项目,2022R01002
目的新冠病毒通过其刺突(Spike)蛋白与宿主细胞的受体(ACE2)相互作用,实现对宿主细胞的侵入,这是一个动态的力学过程。然而,对于力学因素是否能影响新冠病毒的演化,以及相关的力学分子机制,尚有待进一步揭示。方法本研究运用了生物膜力...
关键词：ACE2 力学因素 热力学平衡态 结构生物学 分子力学 宿主细胞 静态结构 生物膜 
热活化延迟荧光分子取代基位置对发光性质影响的理论研究
《厦门大学学报（自然科学版）》2023年第5期792-800,共9页沈钰 张晴 曹泽星 
国家自然科学基金(21873078,21933009)。
热活化延迟荧光(TADF)材料具有较高的激子利用率,在有机发光二极管(OLED)研究中备受关注.与蓝色和绿色TADF分子相比,红色TADF分子发光能隙窄,其激发态很容易以不发光的非辐射方式失活回到基态,因此,实验上很难获得发光效率较高的红色TAD...
关键词：热活化延迟荧光 激发态 取代基位置效应 含时密度泛函理论 量子力学/分子力学组合方法 
基于丁酸钠的新型HDAC4抑制剂的设计与模拟被引量：1
《化学研究与应用》2023年第7期1556-1564,共9页贾梦珠 韩迪 路嘉瑞 高云龙 徐永涛 
国家自然科学基金(21603180)资助;河南省高校科技创新人才(22HASTIT050)资助;河南省科技攻关项目(202102310875)资助。
组蛋白的乙酰化水平异常与多种癌症相关。研究表明,与组蛋白乙酰化水平调控相关的组蛋白去乙酰化酶4(Histone deacetylase 4,HDAC4)在鼻咽癌、胃癌、直肠癌等癌症患者体内的表达明显高于正常水平。本研究以对HDAC4具有一定活性的丁酸钠(...
关键词：组蛋白去乙酰化酶4抑制剂 基于片段的药物设计 分子动力学模拟 分子力学/广义波恩模型表面积 ADMET预测 
细胞色素P450 Kemp消除酶的改造及新型催化机制解析
《Chinese Journal of Catalysis》2023年第4期191-199,共9页李爱涛 汪倩 宋希彤 张小栋 黄建文 陈纯琪 郭瑞庭 王斌举 Manfred T.Reetz 
国家重点研发计划(2019YFA0906400);湖北省生物催化与酶工程技术引智创新示范基地项目(2019BJH021);湖北省自然科学基金创新团体项目(2020CFA011);省部共建生物催化与酶工程国家重点实验室自主研发项目.
传统的Kemp消除反应可以通过氢氧化钾和三烷基胺等碱性物质,催化底物苯并异恶唑开环生成产物2-氰基苯酚.三十年来,Kemp消除反应一直被用作模式反应来设计或定向进化新型生物酶催化剂,从而揭示未知的酶催化机制的复杂性,增强对酶催化机...
关键词：Kemp消除反应 氧化还原机理 P450单加氧酶 量子力学/分子力学 X射线结构 饱和突变 
密度泛函理论与分子力学方法研究沥青质分子间的π-π堆积作用被引量：3
《中国石油大学学报（自然科学版）》2023年第1期189-196,共8页罗辉 吕慧栋 周嘉安琪 邓文安 李传 南国枝 
国家自然科学基金联合基金项目(U20B6003);中央高校基本科研业务费专项(20CX02201A)。
为准确描述沥青质分子间的π-π堆积作用,采用密度泛函理论(DFT)和分子力学(MM)方法研究π-π堆积的势能面、质心距离(Re)和相互作用能(ΔEe)。结果表明,DFT-D、DFT/mGGA、MM以及采用DNP+基组的DFT/GGA方法在描述苯和沥青质的S型、T型...
关键词：沥青质聚集体 Π-Π堆积作用 密度泛函理论 分子力场 
神东煤分子结构的模拟研究被引量：2
《煤化工》2021年第5期78-81,90,共5页白盼盼 梁志永 苏小平 
利用Materials Studio(MS)软件对基于物理表征参数获得的神东煤分子结构进行了模拟优化和量子力学计算。结果表明:经分子力学优化计算,神东煤分子结构的总能量降低,可获得合理的立体构型;经分子动力学优化计算后,可获得神东煤分子结构...
关键词：神东煤 分子结构 分子力学 分子动力学 量子力学 键能 键长 键角 
多尺度理论模拟助力解决金属酶催化机理核心问题--厦门大学王斌举教授
《科技成果管理与研究》2021年第9期5-7,共3页王娜 
多尺度理论模拟方法包括量子化学计算、分子动力学模拟、量子力学-分子力学组合方法,以及从头算动力学模拟。多年来,厦门大学王斌举教授一直从事溶液和蛋白质环境中化学反应过程的多尺度模拟相关工作,在水介质中化学反应的理论研究,多...
关键词：化学反应过程 催化机理 金属酶 活性氧物种 多尺度方法 科研成果 量子化学计算 分子力学 
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