RNA组学

作品数：26被引量：75H指数：4
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相关作者：屈良鹄马军胜王法琦金一和刘薇更多>>
相关机构：中山大学广西中医药大学浙江大学南方医科大学更多>>
相关期刊：《中国真菌学杂志》《环境昆虫学报》《生态毒理学报》《中国科学：生命科学》更多>>
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基于mRNA组学构建弥漫大B细胞淋巴瘤预后模型
《徐州医科大学学报》2024年第3期195-201,共7页王玉波 马东慎 骆丹 范美婷 刘慧 
徐州市科技计划重点研发项目(KC21207)。
目的 根据mRNA组学数据筛选弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)预后相关基因并建立预后模型。方法 从TCGA数据库下载NCICCR-DLBCL数据集中234例DLBCL患者mRNA组学数据和预后数据作为训练集,从GEO数据库下载GSE87371数据集中223例DLBCL患者相应数...
关键词：MRNA CD70 弥漫大B细胞淋巴瘤 TCGA数据库 预后模型 生存分析 
基于miRNA组学探讨慈菇消脂方调控TGF-β1诱导LX2细胞活化的作用机制被引量：2
《中药药理与临床》2023年第3期32-39,共8页任真 马燕花 杨少军 赵秀萍 王莉 王爱娣 
国家自然科学基金地区基金项目(编号:81860821)。
目的:运用生物信息学方法筛选慈菇消脂方干预人肝星状LX2细胞中差异表达微小RNA(micro RNA,miRNA),并进一步探讨差异miRNA对活化LX2细胞刺猬(Hedgehog, Hh)信号通路的影响及慈菇消脂方含药血清的干预机制。方法:CCK-8法检测不同浓度含...
关键词：慈菇消脂方 生物信息学 微小RNA-199a-5p 刺猬信号通路 肝星状细胞 
基于miRNA组学的数据增强算法
《电子科技大学学报》2023年第2期182-187,共6页周丰丰 孙燕杰 范雨思 
国家自然科学基金(62072212,U19A2061);吉林省中青年科技创新创业卓越人才(团队)项目(创新类)(20210509055RQ);吉林省大数据智能计算实验室(20180622002JC)。
近年来,诸多研究揭示了miRNA的表达和疾病之间的关系,特别是其与肿瘤的发生、发展和治疗的密切关联。然而,传统的分子生物学测试方法既耗时又昂贵,患病样本获取困难,不平衡的数据集训练得到的分类器导致患病样本识别准确率低。面对以上...
关键词：计算机应用技术 深度学习 特征选择 生成对抗网络 MIRNA 
基于miRNA组学探讨补肾调冲汤对薄型子宫内膜大鼠作用机制被引量：3
《辽宁中医药大学学报》2022年第10期39-45,共7页伍娟娟 严斯琪 汤舒荻 刘锐 
广西自然科学基金项目(2017GXNSFBA198109);广西壮族自治区中医药局自筹经费科研课题(GZZC2020109);广西中医药大学博士科研启动基金项目(2019BS039)。
目的运用高通量测序技术筛选补肾调冲汤干预薄型子宫内膜大鼠模型中差异表达的miRNA,并对其进行生物信息学分析,揭示补肾调冲汤对薄型子宫内膜大鼠的作用机制。方法制备薄型子宫内膜大鼠模型,使用补肾调冲汤干预,以生理盐水做阴性对照,...
关键词：薄型子宫内膜 补肾调冲汤 MIRNA 信号通路 
联合microRNA和mRNA组学对雄性小鼠随增龄生育力变化的生物信息学研究
《中国计划生育学杂志》2022年第9期1944-1949,共6页赵铭佳 宁艳春 程宇 彭阳 朱研峰 韩宝生 刘美玲 卢文红 谷翊群 
目的:通过生物信息学方法筛选出小鼠睾丸组织随增龄变化的差异表达的关键miRNA和mRNA,为精子发生的研究提供新的方向.方法:检索美国国家生物技术信息中心(NCBI)的基因表达集合(GEO)数据库中关于精子发生的miRNAs和mRNA的芯片数据,确定...
关键词：生物信息学 MICRORNA mRNA 雄性小鼠 生育力 睾丸 
烟曲霉的细胞外囊泡蛋白质及RNA分析被引量：1
《中国真菌学杂志》2022年第1期8-11,26,共5页陈晨 贺彬婵 朱益敏 赵蓓蕾 陈菲 徐小勇 
目的分析烟曲霉的细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)中的重要成分,以进一步明确曲霉致病机制。方法通过离心法分离烟曲霉的囊泡,用电镜观察形态。采用马尔文纳米颗粒跟踪分析仪分析溶液中EVs的大小分布。通过质谱仪对囊泡内处理...
关键词：烟曲霉 细胞外囊泡 蛋白质组学 RNA组学 
基于加权随机森林的三阴性乳腺癌microRNA组学数据的分类预测被引量：1
《中国卫生统计》2020年第6期809-812,817,共5页郭志飞 王碧珏 杨海涛 李治 王菊平 曹红艳 周立业 
国家自然科学基金资助(71403156);山西省回国留学人员科研资助(2017-054);山西省应用基础研究计划(201901D111204);河北省自然科学基金(H2019206558)。
目的基于microRNA组学数据,探讨加权随机森林在三阴性乳腺癌分类预测中的应用,为疾病诊断提供方法学支撑。方法以TCGA乳腺癌数据为例,采用加权随机森林构建三阴性乳腺癌的分类预测模型,并与随机森林、logistic回归、支持向量机、LASSO...
关键词：加权随机森林 分类预测 MICRORNA 三阴性乳腺癌 
蚊虫组学研究进展被引量：1
《环境昆虫学报》2020年第4期789-797,共9页吴恙 周腾飞 赖泽钿 谢李华 谢雨谷 刘培文 刘通 杨文强 金彬彬 孔翎 郭怡佳 赵宜洁 邓洁琳 顾金保 陈晓光 
国家自然科学基金(31830087);美国NIH R01项目(AI136850);广州市与发达国家和港澳台地区合作项目(201803040006)。
近年来,随着高通量测序技术和生物信息学分析技术的成熟和不断革新,蚊虫基因组学、转录组学、小RNA组学也获得了快速发展。迄今为止,已有包括白纹伊蚊、埃及伊蚊、冈比按蚊在内约22种媒介蚊虫的基因组被解析报道。不同蚊种的基因组大小...
关键词：蚊 媒介 基因组学 转录组学 小RNA组学 蚊媒传染病 
基于small RNA组学分析揭示意大利蜜蜂响应东方蜜蜂微孢子虫胁迫的免疫应答机制被引量：9
《微生物学报》2020年第7期1458-1478,共21页陈华枝 熊翠玲 祝智威 王杰 范小雪 蒋海宾 范元婵 万洁琦 卢家轩 郑燕珍 付中民 徐国钧 陈大福 郭睿 
国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-KXJ7);福建省自然科学基金(2018J05042);福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158);福建农林大学杰出青年科研人才计划(xjq201814);福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017342,CXZX2017343);福建省大学生创新创业训练计划(3165602032,3155006018)。
【目的】通过深度测序和组学分析在small RNA组学层面揭示意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)响应东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)的免疫应答机制。【方法】利用small RNA-seq技术对正常及N.ceranae胁迫7 d和10 d的意蜂...
关键词：意大利蜜蜂 东方蜜蜂微孢子虫 微小RNA 免疫应答 宿主-病原互作 分子机制 
水产虾蟹microRNA组学研究进展被引量：2
《生物资源》2020年第1期67-76,共10页郭梁 蒋启程 崇加俊 陈浩 欧江涛 王资生 钟金城 
国家自然科学基金面上项目(编号:31570176,31872601);国家自然科学基金青年科学基金项目(编号:31000072).
MicroRNA是一类广泛存在于真核生物,长度约为18~25个核苷酸的非编码RNA,对靶基因转录后的调控具有重要作用,广泛参与生长发育、免疫、增殖和凋亡等各种生物学过程。本文简要总结了microRNA的生成、调控机制及其检测方法,讨论了虾蟹micro...
关键词：microRNA组学 虾蟹 免疫调控 生殖发育 环境胁迫 
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