曹红艳

作品数:13被引量:18H指数:3
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供职机构:山西医科大学更多>>
发文主题:数据整合分子亚型分子分型低级别胶质瘤加权更多>>
发文领域:医药卫生自动化与计算机技术文化科学更多>>
发文期刊:《中国卫生统计》《卫生软科学》《中国教育技术装备》《中华疾病控制杂志》更多>>
所获基金:国家自然科学基金博士科研启动基金山西省回国留学人员科研经费资助项目河北省自然科学基金更多>>
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基于生存结局加权多组学数据整合的胶质瘤分子分型
《中国卫生统计》2024年第5期644-649,共6页贾聪聪 杜港 赵鑫 师国京 房瑞玲 李治 张岩波 曹红艳 
国家自然科学基金资助项目(82473739);山西省基础研究计划(202303021211130);山西省回国留学人员科研资助项目(2024-081);山西省高等教育“百亿工程”科技引导专项;山西省基础研究计划(20210302124409);山西省研究生科研创新项目(2023KY403)。
目的探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型。方法采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma genome atlas,CGGA)的胶质瘤多...
关键词:生存结局加权聚类 分子亚型 多组学数据整合 胶质瘤 
网络增强核融合方法的改进及其在乳头状肾细胞癌多组学数据整合分子分型中的应用
《中国卫生统计》2024年第3期376-381,共6页师国京 李灵梅 魏亿芳 赵鑫 房瑞玲 杨海涛 余红梅 张岩波 曹红艳 
国家自然科学基金资助项目(71403156,81872717,82273742);山西省应用基础研究计划项目(202303021211130);山西医科大学博士启动基金项目(BS201722)。
目的针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(improved network enhancement fus...
关键词:改进的网络增强融合 乳头状肾细胞癌 多组学数据整合 分子亚型 
基于MOVICS集成聚类的低级别胶质瘤多组学数据整合分子分型被引量:1
《中华疾病控制杂志》2023年第2期216-223,共8页赵鑫 魏亿芳 李灵梅 师国京 房瑞玲 曹红艳 
国家自然科学基金资助项目(71403156);山西省应用基础研究计划项目(201901D111204);山西医科大学校级博士启动基金项目(BS201722)。
目的探讨癌症分型中的多组学整合与可视化(multi-omics integration and visualization in cancer subtyping,MOVICS)集成聚类方法在低级别胶质瘤(lower-grade gliomas,LGG)多组学数据整合分型中的应用,识别LGG高危患者,筛选出潜在的生...
关键词:聚类集成 多组学数据 分子亚型 低级别胶质瘤 
基于rMKL-LPP方法的乳头状肾细胞癌多组学数据整合分型分析被引量:1
《中国卫生统计》2022年第4期522-528,共7页李灵梅 魏亿芳 李治 房瑞玲 崔跃华 曹红艳 
国家自然科学基金资助项目(71403156);山西省应用基础研究计划项目(201901D111204);山西医科大学校级博士启动基金项目(BS201722);国家留学基金资助(201908140151)。
目的探讨局部保留投影的正则化多核学习(regularized multiple kernel learning with locality preserving projections,rMKL-LPP)在乳头状肾细胞癌(papillary renal cell carcinoma,PRCC)多组学数据分子分型中的应用,进一步研究PRCC分...
关键词:局部保留投影的正则化多核学习 多组学数据整合 分子亚型 乳头状肾细胞癌 
基于相似核融合的多组学数据结直肠癌分子亚型研究
《中国卫生统计》2021年第5期650-655,660,共7页武永清 郭志飞 房瑞玲 李治 曹红艳 崔跃华 
国家自然科学基金资助项目(71403156);山西省回国留学人员科研资助项目(2017-054);山西省应用基础研究计划项目(201901D111204)。
目的探讨相似核融合(similarity kernel fusion, SKF)方法在整合多组学数据的结直肠癌分子分型中的应用,识别结直肠癌预后高危患者,筛选出潜在的生物标志物以及重要通路。方法采用SKF对结直肠癌患者多组学数据进行整合,得到融合核,在融...
关键词:相似核融合 多组学数据 分子亚型 差异基因 结直肠癌 
基于加权随机森林的三阴性乳腺癌microRNA组学数据的分类预测被引量:1
《中国卫生统计》2020年第6期809-812,817,共5页郭志飞 王碧珏 杨海涛 李治 王菊平 曹红艳 周立业 
国家自然科学基金资助(71403156);山西省回国留学人员科研资助(2017-054);山西省应用基础研究计划(201901D111204);河北省自然科学基金(H2019206558)。
目的基于microRNA组学数据,探讨加权随机森林在三阴性乳腺癌分类预测中的应用,为疾病诊断提供方法学支撑。方法以TCGA乳腺癌数据为例,采用加权随机森林构建三阴性乳腺癌的分类预测模型,并与随机森林、logistic回归、支持向量机、LASSO...
关键词:加权随机森林 分类预测 MICRORNA 三阴性乳腺癌 
基于因果推断方法检验mRNA在年龄和低级别胶质瘤中的中介效应被引量:1
《中国卫生统计》2020年第6期840-843,847,共5页王碧珏 郭志飞 杨海涛 李治 王菊平 曹红艳 周立业 
国家自然科学基金资助(71403156,81872717);山西省回国留学人员科研资助(2017-054);山西省应用基础研究计划(201901D111204)。
目的构建年龄、mRNA表达水平和低级别胶质瘤(LGG)患者结局之间的因果中介推断模型,识别介导年龄和LGG结局的中介因子,为LGG的治疗和预后提供方法指导。方法以TCGA数据库中LGG数据为例,采用CIT和VanderWeele方法建立因果中介模型,识别年...
关键词:因果推断 中介分析 MRNA 低级别胶质瘤 
脑卒中患者治疗满意度和心理中介效应研究被引量:1
《卫生软科学》2020年第5期28-32,共5页王碧珏 张岩波 曹红艳 郭志飞 周立业 
国家自然科学基金:心脑血管疾病患者报告结局(PRO)恶化预警与潜在状态评估模型构建(81872714);山西省重点实验室:重大疾病分析评估山西省重点实验室(201805D111006)。
[目的]建立脑卒中患者在心理、社会、治疗领域的结构方程模型,分析脑卒中患者心理和治疗满意度的影响因素,为脑卒中患者治疗提供理论依据。[方法]采用随机抽样的方法对485例确诊的脑卒中患者进行问卷调查,利用《脑卒中患者报告临床结局...
关键词:脑卒中 结构方程模型 治疗满意度 心理及社会领域 
基于时间序列的急性髓系白血病融合基因表达网络差异分析被引量:1
《中华疾病控制杂志》2020年第3期274-278,289,共6页王慧慧 萨建 曹红艳 崔跃华 
国家自然科学基金资助项目(71403156);山西省回国留学人员科研资助项目(2017-054);山西省应用基础研究计划项目(201901D111204)。
目的探讨急性髓系白血病(acute myelocytic leukemia,AML)不同融合基因的时间序列基因表达数据的网络差异,识别靶基因。方法采用网络差异分析的方法,针对AML的不同融合基因相关的基因表达数据构建网络,对联合网络的全局属性进行统计分析...
关键词:急性髓系白血病 融合基因 枢纽基因 网络差异分析 时间序列基因表达数据 
基于循证医学的出生缺陷发病风险预测模型被引量:4
《中华疾病控制杂志》2019年第9期1143-1147,共5页赵晶华 李鹭 曹红艳 宋春英 郭兴萍 张岩波 
国家自然科学基金(71403156)~~
目的在循证医学的基础上利用Rothman-Keller模型建立出生缺陷发病风险预测模型,为中国有针对性的制定干预措施提供依据。方法通过评价Meta分析的文献获得出生缺陷危险因素及相应比值比(odds ratio,OR)值,构建Rothman-Keller模型的危险...
关键词:出生缺陷 循证医学 危险因素 风险预测模型 
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