SNP

作品数：2599被引量：7455H指数：27
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金佛山方竹笋箨转录组SNP和SSR位点信息分析被引量：5
《分子植物育种》2022年第24期8152-8159,共8页朱潇 代朝霞 刘艳江 伍明理 
国家科技支撑计划课题(2015BAD04B0204);贵州省教育厅攻关项目(黔教合KY[2019]062)共同资助。
金佛山方竹是中国西南地区特有的笋用竹种,目前关于金佛山方竹品种选育的研究还不够完善。本研究对金佛山方竹3个发育部位笋箨进行转录组测序,利用Varscan和MISA程序分析、比较转录组序列中SNP和SSR的特征。研究表明,99 744条Unigene序...
关键词：金佛山方竹笋箨 转录组 SNP SSR 
一种基于PCR的水稻SNP标记检测方法被引量：1
《中国农学通报》2020年第9期82-93,共12页王钰 许学 秦瑞英 陆徐忠 李莉 杨剑波 倪金龙 马卉 汪秀峰 
国家科技支撑计划“现代种业交易平台及种子质量监控技术研发”(2015BAD02B02);安徽省科技重大专项计划项目“基于在线检测和物联网的农作物种子质量监管和服务关键技术研究与应用”(15czz03117);院长青年创新基金项目“水稻类病斑突变体spl(t)抗病机制的研究”(17B0102).
旨在找到一种简便的SNP检测方法用于水稻种性鉴定及遗传多样性分析,本研究以245份长江中下游主推杂交水稻品种及亲本为研究材料,从1319个SNP位点中筛选出124对多态性高的位点,建立SNP的高效检测体系。选用其中的1个标记sf0141821553和SS...
关键词：水稻 SNP 功能基因 标记筛选 多态性 
基于祖源分析的猪遗传成分鉴定被引量：5
《中国畜牧兽医》2020年第2期544-553,共10页卜李那 彭业博 张春媛 刘洋秀 赵毅强 
国家科技支撑计划“猪优质肉种质资源保护、分子基础挖掘与创新利用”课题(2015BAD03B01)
解析不同品牌猪肉的遗传成分对商业品牌的保护,防伪溯源及中国地方猪种的改良和开发具有重要参考价值。从市场上选取4种不同来源的猪肌肉组织通过全基因组重测序,并结合已发表的59头猪的数据,对其祖先成分进行分析,推测它们祖先可能的...
关键词：猪 SNP 线粒体DNA 群体结构 祖先成分 
不同鸡种BF1基因SNP和Indel比对分析被引量：4
《江苏农业学报》2018年第5期1087-1094,共8页陈博雯 郑圣晗 张莘 王统苗 王志秀 张扬 陈国宏 常国斌 
国家科技支撑计划项目(2015BAD03B03);江苏省六大人才高峰项目(2015-NY-019)
鸡BF1基因多态性与传染性疾病的抗性有很大关系。鸡BF1基因多态性及功能尚不清楚。本研究直接测定了25个鸡种BF1基因序列,并与从NCBI下载的红色原鸡BF1基因进行了比较,构建系统进化树进行分析。结果显示,在这25个鸡种中共检测到了171个...
关键词：鸡MHC BF1基因 SNP INDEL 
鸭不同品种特异性分子标记SNP的筛选与鉴定被引量：5
《中国家禽》2018年第15期7-10,共4页朱涛 谷洪昌 张泽宾 陈余 贾亚雄 吕学泽 王梁 曲鲁江 
国家科技支撑计划(2015BAD03B03)
为开发和鉴定鸭品种特异性分子标记,试验选取樱桃谷鸭、北京鸭、枫叶鸭、金定鸭、绍兴鸭、山麻鸭、高邮鸭7个群体共56只鸭通过Illumina Hi Seq 2500平台进行了重测序,筛选出686个存在于特定群体中的单核苷酸多态性突变(SNP)和插入缺失标...
关键词：鸭 单核苷酸多态性 二代测序 分子标记 
不同鸡品种BTN2基因SNP和INDEL分析被引量：2
《四川农业大学学报》2018年第3期380-385,共6页王统苗 郑圣晗 张莘 陈博雯 刘本帅 张扬 王志秀 常国斌 陈国宏 
国家科技支撑计划(2015BAD03B03;鸡种质资源培育与创新利用);江苏省六大人才高峰项目(2015-NY-019)
【目的】研究BTN2基因多态性,为鸡的免疫和抗病育种研究提供候选基因。【方法】选取26个不同鸡品种,对BTN2基因进行目标捕获测序,以NCBI中Gallus gallus的BTN2基因序列号(NC_006103.4)为参照,使用MEGA6软件进行不同鸡种基因序列比对,筛...
关键词：鸡 BTN2基因 SNP INDEL 进化树 
一种高效筛选Mx GTPase效应区SNP方法
《生物技术》2018年第2期130-135,共6页尹春光 秦宏伟 彭浩 王晓强 杜立新 赵桂苹 
国家高技术研究发展计划项目("抗重大传染性疾病转基因家禽新品种培育";No.2007AA10Z183);山东省中青年科学家奖励基金项目("鲁西南地方家禽Mx基因抗性基因型筛选与鉴定";No.BS2011NY003);国家科技支撑计划项目("鸡种质资源培育与创新利用";No.2015BAD03B03)
[目的]建立高效检测家禽Mx功能区SNP方法 ,改进PCR SSCP。[方法]以引进品种和地方品种为研究对象,筛选引物,优化程序,通过二次PCR改进SSCP方法对Mx基因GTPase效应区SNP进行检测。[结果]SSCP检测引物分型检测及SNP分析,检测结果与测序一...
关键词：MX 二次PCR-SSCP GED区 SNP 
国内虹鳟代表性养殖群体的高通量SNP芯片检测及遗传分析被引量：2
《中国水产科学》2018年第3期485-493,共9页赵紫霞 许建 白庆利 杨世勇 蒋立坤 陈葆华 Palti Yniv Gao Guangtu 徐鹏 
国家科技支撑计划项目(2015BAD25B01); 中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2015C007)
本研究旨在对国内虹鳟(Oncorhynchus mykiss)代表性养殖群体开展全基因组水平的遗传评估。利用57K单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,检测了来自不同地域的6个虹鳟养殖群体样本共计48尾,包括黑龙江虹鳟、黑龙江...
关键词：虹鳟 SNP芯片 遗传多态性 群体结构 
秦川肉牛FABP3及FABP4基因SNP与肉质性状的关联性被引量：7
《西北农林科技大学学报（自然科学版）》2018年第3期1-7,15,共8页余横伟 桂林生 胡言 昝林森 
国家科技支撑计划项目(2015BAD03B04);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-38);陕西省科技统筹创新工程计划项目(2014KTZB02-02-01)
【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择18~24月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,...
关键词：秦川牛肉用新品系 FABP3基因 FABP4基因 多态性 关联分析 
油菜主花序角果密度及其相关性状的全基因组关联分析被引量：5
《中国农业科学》2018年第6期1020-1033,共14页任义英 崔翠 王倩 唐章林 徐新福 林呐 殷家明 李加纳 周清元 
国家"十二五"科技支撑计划(2013BAD01B03-12);国家农业部现代农业产业技术体系(CARS-12);重庆市社会事业与民生保障科技创新(cstc2016shmszx0756);西南大学博士启动基金(swu113064)
【目的】油菜高产是育种工作的主要研究目标之一。角果密度、主花序有效角果数等性状与产量都有显著或极显著的正相关关系,是油菜高产育种考查的主要性状。为揭示油菜角果密度及其相关性状的遗传机理和分子机制奠定基础。【方法】以不...
关键词：甘蓝型油菜 主花序角果密度 连锁不平衡 SNP 全基因组关联分析 
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