SSR标记

作品数:2558被引量:13041H指数:46
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相关机构:四川农业大学西北农林科技大学南京农业大学中国农业科学院作物科学研究所更多>>
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蔗茅全基因组SSR标记特征分析与开发
《中国农业科学》2025年第5期851-863,I0001-I0003,共16页罗正英 胡鑫 吴转娣 钱禛锋 田春艳 刘新龙 李富生 
云南省农业科学院科研项目(2024KYZX-03);云南省种子种业联合实验室项目(202205AR070001-09)。
【目的】蔗茅(Erianthus fulvus)是甘蔗重要的野生资源,可用于改良品种的抗逆性和产量。系统鉴定和开发蔗茅基因组中的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点,筛选可利用的多态性SSR标记,解析蔗茅资源的遗传多样性特征,开发重...
关键词:蔗茅 基因组 简单序列重复 特异扩增 多态性分析 
基于表型性状与SSR标记的冬瓜、节瓜种质资源遗传多样性分析被引量:1
《中国农业科学》2024年第17期3440-3457,I0024-I0033,共28页翟彩娇 葛礼姣 程玉静 仇亮 王小秋 刘水东 
江苏省省级农业科技创新与推广补助专项(南通特色蔬菜志);南通市科技创新智库项目(CXZK202304);江苏沿江地区农业科学研究所学科建设基金(YJXK[2021]101)。
【目的】分析冬瓜、节瓜种质的遗传多样性,构建综合评价体系,筛选优异种质,为冬瓜、节瓜种质创新和新品种选育提供理论支撑。【方法】以148份不同来源的冬瓜、节瓜种质为供试材料,利用28个表型性状和19对SSR标记进行遗传多样性分析。综...
关键词:冬瓜 节瓜 表型性状 SSR标记 遗传多样性 综合评价 
中国棉花审定品种SSR指纹库的构建与综合评价被引量:1
《中国农业科学》2024年第8期1430-1443,I0001-I0061,共75页吴玉珍 黄龙雨 周大云 黄义文 付守阳 彭军 匡猛 
三亚崖州湾科技城科技专项(SCKJ-JYRC-2022-62);棉花生物育种与综合利用全国重点实验室项目(CB2022C08);农业生物育种重大项目(2022ZD04019);海南省自然科学基金联合项目(SQ2021ZRLH0113)。
[目的]棉花是一种异源四倍体作物,基因组结构复杂,常异花授粉的繁殖方式也导致棉花品种难以实现高度纯合;棉种市场缺乏有效的监管技术手段,品种多乱杂现象长期存在,严重影响纤维品质一致性。构建中国近20年棉花审定品种标准样品的DNA指...
关键词:棉花 标准样品 SSR标记 DNA指纹库 综合评价 
板栗总苞和坚果主要性状与SSR标记的关联分析被引量:9
《中国农业科学》2022年第13期2613-2628,I0004-I0008,共21页陈旭 郝雅琼 聂兴华 杨海莹 刘松 王雪峰 曹庆芹 秦岭 邢宇 
国家重点研发计划(2018YFD1000605)。
【目的】通过测定113份板栗品种(系)的数量、质量和假质量性状,分析其遗传变异,比较不同组群之间的性状差异,将SSR标记与性状进行关联,获得更多与SSR标记显著关联的性状,挖掘优异的等位变异位点,为开展板栗分子辅助育种的研究提供参考...
关键词:板栗 性状 SSR 遗传多样性 关联分析 
基于转录组测序开发糜子SSR标记被引量:13
《中国农业科学》2020年第10期1940-1949,共10页陈小红 何杰丽 石甜甜 邵欢欢 王海岗 陈凌 高志军 王瑞云 乔治军 
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06-13.5-A16);国家自然科学基金(31271791);国家留学基金((2019)75号-201908140133);山西省自然科学基金(201901D11126);山西省重点研发计划(一般项目)(农业)(201803D221008-5);山西省回国留学人员科研资助项目(2016-066)。
[目的]以6份不同地理来源的糜子资源为试验材料,基于前期转录组测序获得的1000对SSR引物,选出200对进行多态性检测,以期构建一批可以准确评估糜子种质遗传差异的分子标记.[方法]用Primer Premier 5.0软件设计引物,改良CTAB法提取DNA,PC...
关键词:糜子(Panicum miliaceum L.) SSR 引物分辨率(Rp) 多态性信息含量(PIC) 多样性指数 
基于RNA-seq数据的栽培种花生SSR位点鉴定和标记开发被引量:8
《中国农业科学》2020年第4期695-706,共12页徐志军 赵胜 徐磊 胡小文 安东升 刘洋 
中国热带农业科学院科技创新团队专项资金(1630102017002)
【目的】鉴定花生RNA-seq数据中的SSR位点,明确转录组中SSR位点的分布和结构特点,开发与花生基因相关联的SSR标记,为花生重要功能基因的挖掘、等位变异研究和分子标记辅助育种奠定基础。【方法】根据栽培种花生全生育期中22种不同类型...
关键词:花生 RNA-seq数据 SSR位点 基因关联SSR标记 物理图谱 
基于SSR标记的谷子主要农艺性状关联位点检测及等位变异分析被引量:9
《中国农业科学》2019年第24期4453-4469,I0001-I0003,共20页李剑峰 张博 全建章 王永芳 张小梅 赵渊 袁玺垒 贾小平 董志平 
国家自然科学基金(31471569);国家“十二五”科技支撑计划(2011BAD06B01-1)
【目的】通过在海南省乐东县、河南省洛阳市、吉林省吉林市和公主岭市4个不同地理环境调查谷子10个主要性状,进行SSR标记与性状的关联分析,获得单一环境特异表达位点及多个环境共同表达位点,发掘优异等位变异,探究谷子可能的生态适应性...
关键词:谷子 SSR 地理环境 农艺性状 关联分析 
小麦新品种淮麦33的遗传构成分析被引量:18
《中国农业科学》2018年第17期3237-3248,共12页杨子博 王安邦 冷苏凤 顾正中 周羊梅 
国家重点研发计划(2017YFD0100703);淮安市自然科学研究计划(HAB201721);江苏省农业重大新品种创制项目(PZCZ201706);淮安市农业科学院院长基金(HNY201701);江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室自主研发项目(17HZHL006)
【目的】解析高产广适小麦新品种淮麦33的遗传构成,探讨双亲烟农19和郑麦991对其产量相关性状的遗传贡献,为小麦品种改良及亲本选配提供依据。【方法】利用部分农艺及品质性状、高分子量谷蛋白亚基组成及覆盖小麦21条染色体的625个SSR...
关键词:淮麦33 高分子量谷蛋白亚基 SSR标记 遗传构成 
基于SSR标记的黍稷种质资源遗传多样性及亲缘关系研究被引量:36
《中国农业科学》2018年第15期2846-2859,3036,3037,3038,3039,3040,3041,3042,共21页薛延桃 陆平 乔治军 刘敏轩 王瑞云 
国家自然科学基金(31271791);山西省回国留学人员科研资助项目(2016-066);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-06-13.5-A16);农业部谷子高粱产业体系(CARS-07-12[1].5-A1);农业部作物种质资源保护项目(NB2012-2130135-25-06-1)
【目的】利用SSR标记,分析黍稷种质资源(野生材料和地方品种)的遗传多样性水平,揭示不同来源黍稷种质资源的亲缘关系和遗传群体结构差异,为黍稷起源进化研究奠定基础。【方法】用6份地理差异显著的黍稷种质资源对137对小宗作物课题组开...
关键词:黍稷 野生糜子 国外品种 SSR标记 遗传多样性 群体结构 
基于SSR标记的四倍体鸭茅遗传图谱加密被引量:7
《中国农业科学》2018年第5期991-998,共8页唐露 金梦雅 黄琳凯 张旭 赵欣欣 张新全 
国家自然科学基金(NSFC 31372363);国家现代牧草产业技术体系(CARS-34)
【目的】利用转录组测序开发的EST-SSR标记和鸭茅基因组调研测序开发的基因组SSR(genomic-SSR)标记,对已构建的四倍体鸭茅遗传图谱加密,为定位控制鸭茅重要农艺性状的QTL位点奠定基础。【方法】基于拟测交策略,以"楷模"(高杆、多分蘖、...
关键词:鸭茅 SSR 遗传图谱加密 
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