HAPMAP

作品数:21被引量:37H指数:4
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相关领域:医药卫生更多>>
相关作者:王红赵凯平邓立彬贺毅憬俞英更多>>
相关机构:中国科学院北京大学中南大学中国农业大学更多>>
相关期刊:《中国优生与遗传杂志》《Journal of Bio-X Research》《Wuhan University Journal of Natural Sciences》《Bulletin of the Chinese Academy of Sciences》更多>>
相关基金:国家自然科学基金美国国立卫生研究院基金Fogarty基金广东省自然科学基金更多>>
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A brief overview of game-changing genetic engineering projects
《Journal of Bio-X Research》2023年第4期124-132,共9页Poulami Khan Saheli Basu Roy 
In recent era,advancement of research involves computational management of large-scale genomic and post-genomic datasets in an obvious way.Rapidly emerging field of bioinformatics,fueled by high-throughput technologie...
关键词:1000 Genome Project Cancer Genome ATLAS Project ENCODE Project Human Genome Project International HAPMAP Project 
SR4R:An Integrative SNP Resource for Genomic Breeding and Population Research in Rice被引量:6
《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》2020年第2期173-185,共13页Jun Yan Dong Zou Chen Li Zhang Zhang Shuhui Song Xiangfeng Wang 
supported by the National Natural Science Foundation of China(Grant No.31871706);the Department of Agriculture of Guangdong Province(2018-36);Science and Technology Program of Guangdong Province(Grant No.2019B030316006);The Strategic Priority Research Program of the Chinese Academy of Sciences(Grant No.XDA24040201);the Youth Innovation Promotion Association of the Chinese Academy of Sciences(Grant No.2017141)
The information commons for rice(IC4 R)database is a collection of 18 million single nucleotide polymorphisms(SNPs)identified by resequencing of 5152 rice accessions.Although IC4 R offers ultra-high density rice varia...
关键词:RICE SNP Database HAPMAP Panel 
应用Hapmap数据库分析HBG1-HBD基因间序列单倍型及标签SNP的挑选被引量:1
《医学研究生学报》2016年第12期1281-1285,共5页韩文平 黄盛文 黄凌 王偲颖 韩媛媛 王予川 安邦权 
国家自然科学基金(81260089);贵州省科技创新人才团队建设项目(黔科合人才团队[2015]4019号);贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2015]2091号)
目的 HBG1-HBD基因间序列在γ珠蛋白基因表达有重要作用,文中分析中国北京汉族人群HBG1-HBD基因间序列的单倍型并挑选标签SNP(tag SNP)。方法从Hapmap数据库中下载HBG1-HBD基因间序列上中国北京汉族人群的所有SNP数据。应用Haploview 4....
关键词:HAPMAP HBG1-HBD基因间序列 单倍型 标签SNP位点 
A HapMap leads to a Capsicum annuum SNP infinium array: a new tool for pepper breeding
《Horticulture Research》2016年第1期157-166,共10页Amanda M Hulse-Kemp Hamid Ashrafi Joerg Plieske Jana Lemm Kevin Stoffel Theresa Hill Hartmut Luerssen Charit L Pethiyagoda Cindy T Lawley Martin W Ganal Allen Van Deynze 
The Capsicum genus(Pepper)is a part of the Solanacae family.It has been important in many cultures worldwide for its key nutritional components and uses as spices,medicines,ornamentals and vegetables.Worldwide populat...
关键词:BREEDING PEPPER LINKAGE 
Effect of Genome-Wide Genotyping and Reference Panels on Rare Variants Imputation被引量:2
《Journal of Genetics and Genomics》2012年第10期545-550,共6页Hou-Feng Zheng Martin Ladouceur Celia M.T. Greenwood J. Brent Richards 
Common variants explain little of the variance of most common disease, prompting large-scale sequencing studies to understand the contribution of rare variants to these diseases. Imputation of rare variants from genom...
关键词:Genotype imputation Genome-wide association study 1000 Genome Project HAPMAP Rare variant Common disease 
北京汉族和西北欧洲后裔人群ROR2基因单核苷酸多态性比较研究被引量:1
《中国预防医学杂志》2011年第12期985-990,共6页赵凯平 王红 
美国国立卫生研究院国家牙科与颅面研究院基金(No.R21-DE-013707;R01-DE-014581);Fogarty基金(No.D43-TW006176)
目的分析比较北京汉族(CHB)和西北欧洲后裔人群(CEU)ROR2基因单核苷酸多态性(SNPs)和单体域的特征,为两人群病因学研究SNPs的确定和分析提供依据。方法用Haplov-iew软件对HapMapCHB和CEU人群ROR2基因SNPs数据进行分析和比较。结果 HapMa...
关键词:ROR2基因 MAF 单体型 HAPMAP Haploview 
北京汉族人群ROR2基因SNPs等位基因及单体型频率研究被引量:4
《中国优生与遗传杂志》2011年第6期11-13,129,共4页赵凯平 袁长征 王红 
美国国立卫生研究院国家牙科与颅面研究院基金 基金代码为R21-DE-013707;R01-DE-014581;Fogarty基金资助;基金代码为D43-TW006176~~
目的为病因学研究中ROR2基因SNPs的确定和分析提供依据。方法利用Hap loview软件对HapM ap数据库中北京汉族人群(CHB)ROR2基因SNPs基因型数据进行分析。结果和讨论ROR2基因404个SNPs中,103个(25.5%)SNPs为纯合基因型,在中国人群中进行...
关键词:ROR2基因 MAF 单体型频率 Hardy-Weinberg平衡 Haploview HAPMAP 
Influence of Allele Frequency on Predicting Animal Phenotype Using Back-Propagation Artificial Neural Networks被引量:2
《Wuhan University Journal of Natural Sciences》2011年第2期101-105,共5页LI Xuebin YU Xiaoling GUO Yunrui XIANG Zhifeng ZHAO Kun REN Fei 
Supported by the Scientific Research Starting Foundation for Doctors, Henan Institute of Science and Technology of China
To overcome the obstacle of the fascinating relation in predicting animal phenotype value, we have developed a neural network model to detect the complex non-linear relationships between the genotypes and phenotypes a...
关键词:artificial neural network single-nucleotide polymorphism (SNP) HapMap project genomic breeding value molecular marker allele frequency 
HapMap五周年回顾被引量:1
《科学观察》2010年第6期61-66,共6页曾长青 
今年10月,是人类基因组国际HapMap计划启动8周年和这一重大国际合作的主要任务完成5周年。儿年间,全球范围的基因组特别是人类基因组的研究,
关键词:人类基因组 国际合作 人类遗传学 HAPMAP 
第10号染色体一个祖先信息标记区域的发现及鉴定
《郑州大学学报(医学版)》2010年第5期743-746,共4页李瓅 曾昭书 周艳梅 董子明 
国家自然科学基金资助项目30700966;31071100
目的:应用第10号染色体的HapMap单核苷酸多态性(SNP)基因分型数据及人群聚类分析技术区分人亚群。方法:从HapMap数据库(r23)获取北京汉族人、欧裔和非裔3个人群225个样本的第10号染色体共4660余万个SNPs分型结果,提取在3个群体间等位基...
关键词:祖先信息标记 单核苷酸多态性 固定系数 HAPMAP 
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