INDEL标记

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玉米纯度高通量InDel快速检测体系的建立
《玉米科学》2025年第4期42-48,共7页胡丽萍 彭飞飞 许理文 田红丽 张茗起 葛建镕 王蕊 王凤格 
海南省重点研发项目(ZDYF2023XDNY077);北京市农林科学院科技创新能力建设专项项目(KJCX20230301)。
为实现玉米品种纯度高效准确鉴定,通过建立快速DNA提取方案常温研磨法及适配的多重扩增体系,构建玉米纯度高通量InDel快速检测方案。结果表明,与对照碱煮法相比,常温研磨法提取的DNA在琼脂糖凝胶电泳中显示清晰条带,玉米纯度InDel引物...
关键词：玉米 INDEL标记 高通量 快速 纯度 
基于InDel标记的辣椒杂交组合THI-P-10×P5114种子纯度鉴定
《蔬菜》2025年第4期26-32,共7页高升华 周克贵 尹延旭 李宁 徐凯 王小迪 詹晓慧 陈卫芳 袁伟玲 姚明华 王飞 
湖北省重点研发计划项目(2022BBA0066);湖北省支持种业高质量发展资金项目(HBZY2023B004);武汉市科技重大专项(2022021302024852)。
辣椒杂交一代优良组合THI-P-10×P5114具有中熟、椒条顺直、肉厚、味辣、兼抗多种病害和品质佳等特性。为了提高该杂交组合种子纯度鉴定效率,建立基于插入缺失长度多态性(InDel)标记的种子纯度鉴定方法,以杂交组合THI-P-10×P5114及其母...
关键词：辣椒 INDEL 分子标记 种子纯度 鉴定 杂交一代 基因组 
基于InDel标记的春油菜品种指纹图谱构建和杂交种纯度鉴定
《草业科学》2025年第3期687-697,共11页何鸟飞 赵绪涛 李开祥 
帅才科学家负责制项目(2022-NK-170)。
以15份青海主栽春油菜(Brassicanapus)品种亲本为材料,从190对InDel标记中筛选出13对多态性标记作为核心InDel标记,分别用13对标记对参试材料进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,对15份供试材料进行遗传多样性分析、聚类分析、DNA指纹图谱构...
关键词：甘蓝型油菜 分子标记 香农指数 等位基因数 聚类分析 恢复系 细胞质雄性不育系 
基于基因组重测序技术开发钟花樱InDel标记
《湖南生态科学学报》2025年第1期34-43,共10页阳秀玫 禹霖 李建挥 舒东膂 严佳文 
湖南省自然科学基金项目(2023JJ30358);湖南省林业科技创新杰青培养科研项目(XLK202108-6)。
【目的】系统挖掘钟花樱InDel位点,筛选具有多态性的InDel标记,并应用于钟花樱核心种质资源的脱氧核糖核酸(DNA)指纹图谱构建。【方法】以‘湘妍’全基因组序列为参考,利用Illumina平台对18份钟花樱种质资源进行重测序,利用Trimmomatic...
关键词：园艺学 钟花樱 INDEL标记 DNA指纹图谱 基因组重测序 
基于重测序的菠萝基因组InDel标记的开发
《生物技术通报》2025年第2期65-76,共12页贺涵 刘传和 喻梦凡 袁梦萍 魏岳荣 杨敏 邝瑞彬 周陈平 吴夏明 徐泽 
广东省农业科学院创新中心课题(XTXM202203-XT202212);国家重点研发计划项目(2023YFD2300800);广东省农村科技特派员项目(KTP20210395,KTP20240379);广州市科技计划项目(2023E04J0562)。
【目的】基于菠萝种质的基因组重测序数据研发菠萝InDel分子标记,为菠萝种质资源的创新利用奠定理论基础。【方法】选取4份代表性菠萝种质进行基因组重测序,鉴定插入/缺失长度大于30 bp的InDel位点。根据InDel位点信息设计InDel标记引物...
关键词：菠萝 重测序 INDEL标记 遗传多样性分析 
赣南野生山金柑全基因组InDel标记开发及应用
《园艺学报》2025年第2期267-278,共12页罗嗣芳 严翔 谢丽芳 孙静贤 郭紫晶 张祖铭 陈兆星 
现代农业产业技术体系建设专项资助(CARS-26);赣州市重点研发计划重点项目(2022XM061209)。
为探究赣南野生山金柑InDel特征,选取99份赣南野生山金柑进行全基因组重测序,进而筛选InDel变异位点以开发InDel标记。获得590.58 Mb有效片段数据,共检测到211470个InDel,包括98043个插入和113427个缺失。从8760条插入/缺少碱基数大于10...
关键词：山金柑 INDEL标记 遗传多样性 核心种质 DNA指纹图谱 
基于Indel标记的新疆色素辣椒杂交种纯度鉴定
《现代园艺》2025年第1期28-30,共3页李辉玲 张建文 叶远荣 曾卫东 
河北省科技支撑计划项目(项目编号:V1644920219095);巴州财政支持基本科研业务经费“分子标记辅助创制高色价优异辣椒种质资源”(项目编号:202104);新疆维吾尔自治区科技特派员农村科技创业行动项目(项目编号:2022BKF133)。
为充分利用Indel分子标记技术,建立新疆色素辣椒杂交种室内纯度快速鉴定体系,为后续的群体构建、QTL定位、杂交子代遗传多样性分析等相关研究提供依据,提高育种效率。利用251对Indel引物对10个品种的父母本共11个杂交组合的F_(1)杂交代...
关键词：色素辣椒 InDel分子标记 杂交子代 纯度 
常染色体InDel标记的法医物证应用与研究进展
《中国法医学杂志》2024年第6期724-729,共6页李智敏 姚以宁 周芷菡 季琪琪 谢建辉 
国家自然科学基金面上项目(82171875)。
插入/缺失多态性(Insertion/deletion,InDel)标记是基因组中一类广泛分布的长度多态性遗传标记,兼具STR和SNP的特点。InDel标记可应用于降解生物检材的个体识别、复杂亲缘关系鉴定等工作,可通过个体族源推断以缩小侦查范围,在法医物证...
关键词：法医物证学 插入/缺失多态性 降解检材 族源推断 Multi-InDel 多等位基因InDel 
花生全基因组变异的鉴定和InDel标记的开发及应用
《植物遗传资源学报》2024年第12期2136-2148,共13页张雪姣 季木灯 王丽媛 李启彪 徐磊 江日东 徐志军 
海南省自然科学基金项目(321QN348);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1630102024002,1630102023001)。
利用13个花生品种的重测序数据进行花生全基因组变异鉴定,分析InDel在花生基因组上的分布特点,开发、验证并评估InDel标记在花生亲缘关系和品种鉴定中的效率。结果表明,从13个花生品种中共检测到313432个高质量SNP和38777个高质量InDel...
关键词：花生 全基因组变异 INDEL 分子标记 遗传多样性 
基于重测序的中国李基因组InDel标记的开发及应用
《园艺学报》2024年第11期2510-2522,共13页陈方策 胡平正 解为玮 王钲彭 钟创南 李海炎 何业华 彭泽 万保雄 刘朝阳 
广州市科技计划项目(202206010038);省级乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-NPY-00-029,2023-NBH-00-026)。
基于部分中国李种质资源的基因组重测序结果,挖掘出一系列候选InDel位点,并从中筛选出分布在8条染色体上且表现出稳定多态性的53个InDel标记。利用开发的53个InDel标记对79份李种质资源进行遗传多样性评价,主要等位基因频率平均为0.6593...
关键词：李 INDEL标记 遗传多样性 分子身份证 F_(1)真实性鉴定 
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