MATK序列

作品数：34被引量：166H指数：7
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基于不同序列对不同来源浙贝母的鉴定分析
《中华中医药杂志》2024年第6期2855-2858,共4页孙贝贝 康显杰 杜伟锋 葛卫红 李昌煜 
浙江省中医药科技计划中医药现代化专项(No.2020ZX006);杭州市农业与社会发展科研重点项目计划(No.202204A06);宁波市“科技创新2025”重大专项(No.20201ZDYF020069);中华中医药学会青年人才托举工程项目(No.QNRC2-C12)。
目的:基于ITS2、psbA-trnH、matK序列,探讨不同来源浙贝母的分子鉴定方法及系统进化关系。方法:分别提取7个来源浙贝母的DNA,经PCR扩增及测序,并用MEGA 7.0等软件对测序结果进行分析。结果:ITS2序列未检测到变异位点;psbA-trnH序列共检...
关键词：浙贝母 ITS2序列 psbA-trnH序列 MATK序列 遗传距离 系统聚类 亲缘关系 
基于ITS和matK序列的苗药朱砂根遗传多样性分析被引量：1
《种子》2024年第1期29-35,42,F0003,共9页郎云虎 文琴琴 魏升华 严福林 
国家重点研发计划项目(2018YFC1708101);贵州省科技计划项目(黔科中引地[2022]4016);贵州省中药材现代产业技术体系建设(GZCYTX2019-2024)。
为探究朱砂根的遗传多样性,对收集的16个居群的69份朱砂根样品ITS和matK序列进行双向测序,应用Genious 11.0软件分析2个序列的结构变异,应用MEGA 11.0软件基于Kimura-2-Parameter(K2P)模型,计算居群间遗传距离,采用邻接法(NJ)分别构建...
关键词：朱砂根 ITS MATK 遗传多样性 
广东紫珠matK基因的生物信息学分析
《种子》2024年第1期130-136,共7页李家敏 潘芝玲 王灿 张兵锋 
江西省宜春市科学技术局课题“宜春道地药材紫珠属DNA条形码数据库构建与鉴定研究”(JXYC2017KSA012)。
通过PCR扩增获得广东紫珠matK基因的完整核苷酸序列,利用生物信息学对matK基因进行开放阅读框、氨基酸组成、蛋白质跨膜结构区、亚细胞定位和结合区分析,预测信号肽、氨基酸亲/疏水性、氨基酸及高级结构预测,采用UPGMA算法对13种紫珠属...
关键词：广东紫珠 MATK序列 生物信息学 序列分析 
matK序列在绞股蓝及其混伪品中的应用被引量：1
《安徽农学通报》2023年第7期22-25,共4页徐林 赵芳 杨贵清 尹鑫 徐其碧 赵月梅 
国家自然科学基金项目(31900273);大学生创新创业训练计划项目(S202114223051)
用matK序列作为DNA条形码来区分绞股蓝及其混伪品雪胆、锥形果、棒槌瓜、乌蔹梅和崖爬藤。通过PCR扩增测序和在GenBank中下载的方式共获得16条matK序列,经比对后,用MEGA 6.0计算种间的K2P距离并基于该距离建立了系统发育邻接树(NJ),并...
关键词：MATK 绞股蓝 伪品 DNA条形码 
基于ITS2和matK序列的红景天属植物条形码鉴定研究被引量：3
《高原农业》2022年第5期462-468,共7页赵凯辉 袁芳 赵芳玉 兰小中 
西藏红景天属药用植物的DNA条形码鉴定研究(XZ202001ZR0038G);第四次全国中药资源普查西藏自治区中(藏)药资源普查项目(20190502-542133)。
本研究旨在开发一种准确快速鉴别红景天属植物的方法。选用14种红景天属植物进行ITS2和matK序列的测定,并对其进行序列特征和系统发育分析。ITS2和matK条形码序列的扩增成功率均为100%。ITS2序列测序成功率为94.7%,matK序列的测序成功率...
关键词：红景天属 DNA条形码 分子鉴定 系统发育分析 
我国主要产区白芷的基原和群体遗传组成特征分析被引量：5
《中药材》2022年第4期824-829,共6页王丽赟 孙健 沈宇峰 沈晓霞 周介仁 邓惠敏 王志安 
磐安县中药材绿色发展示范项目(磐中药发202002);国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-21);浙江省中药材新品种选育重大科技专项(2021C02074-4-6);浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室(2021E10013);浙江省药用植物种质改良与质量控制技术重点实验室(2011E10015)
目的:分析我国主要产区白芷的遗传组成差异。方法:以15份不同主产区的白芷为材料,应用核基因ITS2序列和叶绿体基因matK序列进行基原差异分析;应用SRAP分子标记技术,进行UPGMA聚类和遗传多样性分析。结果:ITS2序列全长452 bp、获得有2个...
关键词：白芷 杭白芷 ITS2序列 MATK序列 SRAP 遗传多样性 
基于matK序列的24个茶树品种亲缘关系
《宁德师范学院学报（自然科学版）》2021年第4期384-390,共7页卓雄标 陈美霞 彭成彬 王泽榕 张月华 沈小莲 刘伟 
福建省教育厅新世纪优秀人才项目;宁德市科技局项目(20160051);宁德师范学院校级项目(2020Z01,2020Q101,2019T02)。
matK基因是陆地植物核心条形码候选片段之一,通过PCR扩增获得24个茶树品种matK基因片段,进行序列测定比对,构建系统发育树,探索matK基因在茶树品种鉴定中的适用性.结果表明:扩增片段长度介于750~1000 bp,存在21个变异位点;系统进化树分...
关键词：茶树 MATK基因 亲缘关系 
基于mtDNA和cpDNA序列的甘薯栽培种及近缘野生种分析
《华南农业大学学报》2021年第4期25-32,共8页王崇 王连军 田小海 雷剑 柴沙沙 焦春海 杨新笋 
国家重点研发计划(2019YFD1001300,2019YFD1001304,2019YFD1001305);粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室开放课题(国家现代甘薯产业技术体系建设项目)(CARS-11-C-15);湖北省技术创新专项(重大项目)(2017ABA149);湖北省农业科学院特色学科、湖北省农业科技创新中心资助项目(2007-620-001-03);湖北省农业科学院青年拔尖人才培养计划。
【目的】利用线粒体DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)序列和叶绿体DNA(Chloroplast DNA,cpDNA)matK序列对甘薯Ipomoea batatas栽培种及近缘野生种进行分子鉴定和亲缘关系分析,为甘薯栽培种和近缘野生种的种质鉴定、保护及开发利用提供理论...
关键词：甘薯 线粒体DNA MATK序列 系统发育 遗传多样性 
基于trnH-psbA和matK序列的不同种油茶种苗DNA条形码分析被引量：3
《热带作物学报》2021年第3期611-619,共9页代佳妮 于靖 戚华沙 郑蔚 王健 吴友根 赖杭桂 胡新文 
海南省自然科学基金高层次人才项目(No.820RC585);海南省重大科技计划项目(No.ZDKJ2017004)。
为有效鉴别出不同种油茶种苗,收集101份不同种油茶种苗作为试材,其中18份越南油茶、79份普通油茶、1份博白大果油茶、3份红花油茶,利用叶绿体基因组trnH-psbA和matK序列进行扩增并测序分析,随后对序列进行拼接及特征分析,并计算样本种...
关键词：trnH-psbA序列 MATK序列 油茶 DNA条形码 
四川江安大白李与重庆开州地方李的亲缘关系比较试验被引量：2
《中国南方果树》2020年第2期131-136,共6页寇琳羚 熊伟 于杰 周贤文 胡万芬 
重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划(晚熟柑桔脆李技术体系);2019年重庆市科技传播与普及项目“重庆市奉节脐橙、巫山脆李、荔枝龙眼‘三大水果’优质高效生产技术丛书”资助。
长江上中游地区是世界李的原产地,李品种资源丰富,传统主栽品种为江安大白李。为了快速甄别重庆地方李与江安大白李之间的亲缘关系,加快重庆地方良种李新品种培育,采用DNA条形码技术,运用分子鉴定方法,从分子水平对重庆开州区选择的开...
关键词：李 新品种培育 分子鉴定 DNA条形码 分子辅助育种 亲缘关系 MATK序列 
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